LIM同源框蛋白質 LHX2是蛋白質的一種,在人類內由「LHX2」基因所編碼。[5][6][7]
LHX2包含LIM結構域,这是一種帶有許多半胱氨酸,具鋅指結構的結構域。該蛋白質的作用為轉錄調控。該蛋白質在果蠅體內,可用來回復由其他蛋白質引起的表型,推測是在演化時留下的功能[7]。
交互作用
LHX2已證實會與CITED2交互作用。[8]
參考資料
- ^ 1.0 1.1 1.2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000106689 – Ensembl, May 2017
- ^ 2.0 2.1 2.2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000000247 – Ensembl, 2017年5月
- ^ Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Mouse PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Wu HK, Heng HH, Siderovski DP, Dong WF, Okuno Y, Shi XM, Tsui LC, Minden MD. Identification of a human LIM-Hox gene, hLH-2, aberrantly expressed in chronic myelogenous leukaemia and located on 9q33-34.1. Oncogene. Jul 1996, 12 (6): 1205–12. PMID 8649822.
- ^ Rincon-Limas DE, Lu CH, Canal I, Calleja M, Rodriguez-Esteban C, Izpisua-Belmonte JC, Botas J. Conservation of the expression and function of apterous orthologs in Drosophila and mammals. Proc Natl Acad Sci U S A. Apr 1999, 96 (5): 2165–70. PMC 26754
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- ^ 7.0 7.1 Entrez Gene: LHX2 LIM homeobox 2.
- ^ Glenn, D J; Maurer R A. MRG1 binds to the LIM domain of Lhx2 and may function as a coactivator to stimulate glycoprotein hormone alpha-subunit gene expression. J. Biol. Chem. (UNITED STATES). Dec 1999, 274 (51): 36159–67. ISSN 0021-9258. PMID 10593900. doi:10.1074/jbc.274.51.36159.
延伸閱讀
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA et al. The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 2004, 14 (10B): 2121–7. PMC 528928
. PMID 15489334. doi:10.1101/gr.2596504.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T et al. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. Nat. Genet. 2004, 36 (1): 40–5. PMID 14702039. doi:10.1038/ng1285.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 99 (26): 16899–903. PMC 139241
. PMID 12477932. doi:10.1073/pnas.242603899.
- Glenn DJ, Maurer RA. MRG1 binds to the LIM domain of Lhx2 and may function as a coactivator to stimulate glycoprotein hormone alpha-subunit gene expression. J. Biol. Chem. 2000, 274 (51): 36159–67. PMID 10593900. doi:10.1074/jbc.274.51.36159.
- Bach I, Rodriguez-Esteban C, Carrière C et al. RLIM inhibits functional activity of LIM homeodomain transcription factors via recruitment of the histone deacetylase complex. Nat. Genet. 1999, 22 (4): 394–9. PMID 10431247. doi:10.1038/11970.
- Bendall AJ, Rincón-Limas DE, Botas J, Abate-Shen C. Protein complex formation between Msx1 and Lhx2 homeoproteins is incompatible with DNA binding activity. Differentiation. 1998, 63 (3): 151–7. PMID 9697309. doi:10.1046/j.1432-0436.1998.6330151.x.
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(1) 碱性结构域 |
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(1.1)碱性亮氨酸拉链
(bZIP) | 转录激活因子( AATF、 1、2、3、4、5、6、7) · AP-1(c-Fos、 FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND) · BACH(1、2) · BATF · BLZF1 · C/EBP( α、 β、 γ、 δ、ε、ζ) · CREB(1、3、L1) · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · Gcn4 · HLF · MAF(B、F、G、K) · NFE(2、L1、L2、L3) · NFIL3 · NRL · NRF(1、2、3) · XBP1 |
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(1.2)碱性螺旋-环-螺旋
(bHLH) | ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BMAL(ARNTL、ARNTL2) · CLOCK · DEC(1、 2) · EPAS1 · HAND(1、2) · HES(5、6) · HEY(1、2、L) · HES1 · HIF(1A、3A) · ID(1、2、 3、4) · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Neurogenins(1、2、3 · 肌形成调节因子(MyoD、成肌蛋白、MYF5、MYF6) · NeuroD( 1、2) · NPAS(1、2、3) · OLIG(1、2) · Pho4 · Scleraxis · TAL(1、2) · Twist · USF1 |
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(1.3)碱性螺旋-环-螺旋亮氨酸拉链
(bHLH-ZIP) | AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP(1、2) |
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| (1.4) NF-1 | NFI(A、B、C、X) · SMAD(R-SMAD(1、2、3、5、9) - I-SMAD(6、7) - 4) |
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| (1.5) RF-X | RFX(1、2、3、4、5、ANK) |
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(1.6)碱性螺旋-跨-螺旋
(bHSH) | AP-2(α、β、γ、δ、ε) |
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| (2.1) 核受体(Cys4) | 第一亚族: 甲状腺激素受体( α、 β)、CAR、 FXR、 LXR(α、β)、 PPAR( α、β/δ、 γ)、PXR、RAR( α、β、γ)、 ROR(α、β、γ)、 Rev-ErbA(α、β)、VDR 第二亚族( COUP-TF(I、II)、 Ear-2、 HNF4(α、γ)、PNR、RXR(α、β、γ)、Testicular receptor(2、4)、TLX) 第三亚族( 甾类激素( 雄激素、雌激素(α、β)、 糖皮质激素、盐皮质激素、 孕酮)、 雌激素相关(α、β、γ)) 第四亚族 NUR(NGFIB、NOR1、NURR1) · 第五亚族LRH-1、 SF1 · 第六亚族 GCNF · 第零亚族DAX1、 SHP |
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| (2.2) 其他的Cys4结构 | GATA(1、2、3、4、5、6) · MTA(1、2、3) · TRPS1 |
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| (2.3) Cys2His2 | 通用转录因子(TFⅡA、TFⅡB、TFIID、TFⅡE、TFⅡF(1、2)、TFⅡH(1、2、4、2I、3A、3C1、3C2)) ATBF1 · BCL(6、11A、11B) · CTCF · E4F1 · EGR(1、 2、 3、 4) · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family(1、2、3、REST、S2、YY1) · HIC(1、2) · HIVEP(1、2、3) · IKZF(1、2、3) · ILF(2、3) · Sp/KLF家族( KLF:1、2、3、 4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17, SP:1、2、4、7、 8) · MTF1 · MYT1 · OSR1 · · WT1 · Zbtb7(7A、7B) · ZBTB(16、17、20、32、33、40) · zinc finger(3、7、9、10、19、22、24、33B、 34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、 423、451、452、471、593、638、649、655) |
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| (2.4) Cys6 | HIVEP1 |
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| (2.5)交替composition | AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING(1、2、4) · JARID(1A、1B、1C、1D、2) · JMJD1B |
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| (2.6)WRKY结构 | WRKY转录因子家族 |
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| (3.1)同源异型域 | ARX · CDX( 1、2) · CRX · CUTL1 · DBX(1、2) · DLX(3、4、5) · EMX2 · EN(1、2) · FHL(1、2、3) · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框(A1、A2、A3、A4、A5、A7、A9、A10、A11、A13、B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B13、C4、C5、C6、C8、C9、C10、C11、C13、D1、D3、D4、D8、D9、D10、D11、 D12、D13) · HOPX · IRX(1、2、3、4、5、6、MKX) · LMX(1A、1B) · MEIS(1、2) · MEOX2 · MNX1 · MSX( 1、2) · NANOG · NKX(2-1、2-2、2-3、2-5、3-1、3-2、6-1、6-2) · PBX(1、2、3) · PHF(1、3、6、8、10、16、17、20、21A) · PITX(1、 2、3) · POU结构域(PIT-1、BRN-3: A、B、C、 八聚体转录因子:1、2、 3/4、6、7、11) · OTX(1、2) · PDX1 · ZEB( 1、2) |
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| (3.2)配对框 | PAX(1、2、3、4、5、6、7、8、9) |
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| (3.3)叉头状/翼状螺旋 | E2F( 1、2、3、4、5) · FOX proteins(C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、 M1、N3、O1、O3、O4、P1、 P2、 P3) |
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| (3.4)热休克因子 | HSF(1、2、4) |
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| (3.5)色氨酸簇 | ELF(2、4、5) · EGF · ELK(1、3、4) · ERF · ERG · ETS(1、 2、SPIB) · ETV(1、4、5、6) · FLI1 · Interferon regulatory factors(1、2、3、4、5、6、7、8) · MYB · MYBL2 |
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| (3.6)TEA结构域 | transcriptional enhancer factor(1、2、3、4) |
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(4) 具有小凹槽触点的β-支架因子 |
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| (4.1) Rel homology region | NF-κB(NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB) · NFAT(C1、C2、C3、C4、5) |
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| (4.2) STAT | |
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| (4.3) p53样转录因子 | |
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| (4.4) MADS盒 | Mef2(A、B、C、D) · SRF |
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| (4.6) TATA结合蛋白 | |
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| (4.7) 高迁移率族 | BBX · HMGB( 1、 2、 3、 4) · HMGN、( 1、 2、 3、 4) · HNF(1A、1B) · SOX(1、 2、3、4、5、6、8、 9、10、11、12、13、14、15、18、21、 SRY) · SSRP1 · TCF/LEF家族( TCF(1、3、4) · LEF1) · TOX(1、2、3、4) |
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| (4.9) Grainyhead | TFCP2 |
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| (4.10) 冷休克域 | CSDA、YBX1 |
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| (4.11) Runt | CBF(CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1) |
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(0) 其他转录因子 |
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| (0.2) HMGI(Y) | |
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| (0.3) 袋状结构域 | |
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| (0.5) AP-2/EREBP-related factors | Apetala 2 · EREBP · B3(ARF · ABI3 · RAV) |
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| (0.6) Miscellaneous | ARID(1A、1B、2、3A、3B、4A) · CAP · IFI(16、35) · MLL(2、3、T1) · MNDA · NFY(A、B、C) · ρ因子/ σ因子 |
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参见 转录因子/共调节因子缺陷 Category:蛋白质生物合成模板 |