Cette 1re étape est sans difficulté notable. Trois sprints vont permettre l'attribution des premiers points du maillot vert, le premier à Saverne (km 53), le second à Plobsheim (km 137) et le troisième à Kehl (km 175,5). Le maillot à pois du meilleur grimpeur sera lui aussi attribué ; une côte de 4e catégorie de 1,1 km à 4,1 % (la côte de Heiligenstein) se trouve au kilomètre 101,5. Au départ de Strasbourg, les coureurs effectueront un circuit de 184,5 km, dont une trentaine de kilomètres en territoire allemand avant d'arriver à nouveau à Strasbourg.
Au fil des kilomètres, le Français Benoît Vaugrenard glane quelques secondes de bonification (1er et 2e lors des 2 premiers sprints intermédiaires) ce qui lui permet d'endosser le maillot blanc de meilleur jeune. L'Allemand Fabian Wegmann quant à lui récupérant les points du seul Grand Prix de la montagne, il sera donc, au soir de cette étape, le premier porteur du maillot à pois de ce Tour 2006. Il récidive sa performance de l'an passé à savoir être le premier à rentrer sur ses terres.
À 15 km de l'arrivée, ne reste que Walter Bénéteau qui n'a pas été repris par le peloton et à 10 km il compte encore 20 secondes d'avances avant d'être repris.
Lors du sprint final, le maillot jaune Thor Hushovd a été blessé par un choc avec un objet publicitaire en carton tenu par un supporter (une main verte du PMU) à 50 mètres de la ligne d'arrivée. Victime d'une hémorragie il parvient à franchir l'arrivée avant de s'effondrer et d'être conduit à l'hôpital de Strasbourg afin de se faire poser des points de suture. D'après le médecin du Tour de France il devrait rester présent pour la suite de la compétition.
Étape de plaine
France
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