Acidaminococcus fermentans
| Domaine | Bacteria |
|---|---|
| Règne | Bacillati |
| Phylum | Bacillota |
| Classe | Negativicutes |
| Ordre | Acidaminococcales |
| Famille | Acidaminococcaceae |
| Genre | Acidaminococcus |
Acidaminococcus fermentans est une espèce de bactéries gram-négatives de la famille des Acidaminococcaceae.
Description
Ce sont des micro-organismes anaérobies de forme coccus simple ou plutôt ovale ou en forme de rein selon leur description initiale et pouvant apparaître comme des diplocoques. Ce sont des bactéries de coloration de Gram négative[1]. Elles ne forment pas de spores et ne sont pas mobiles[1],[2]. Elles sont généralement plus grosses que les bactéries de l'espèce Acidaminococcus intestini[1], leurs dimensions sont d'environ 0,6 à 1,0 µm[2].
Répartition
La souche type a été isolée du tractus digestif d'un porc[3]. Cette espèce a aussi été isolée chez l'homme, les vaches et les lapins[4].
Taxonomie
Le nom correct complet (avec auteur) de ce taxon est Acidaminococcus fermentans Morrison Rogosa, 1969[5],[6]. La souche type de cette espèce est la souche VR4 déposée à l'American Type Culture Collection sous le numéro ATCC 25085[6],[3].
Étymologie
L'étymologie du nom de cette espèce est liée à sa capacité de fermentation : fer.men’tans. L. masc. part. adj. fermentans, fermenter soit la bactérie Acidaminococcus capable de fermenter[6].
Phylogénie
Lors de sa description, cette espèce a été placée ainsi que son genre Acidaminococcus dans la famille Neisseriaceae puis dans les Veillonellaceae (alors appelée aussi Sporomusa) alors classée dans les Firmicutes[7],[1],[3], comprenant les bactéries gram-positives à faible pourcentage en bases GC. Elle a ensuite été classée dans la famille Acidaminococcaceae après analyse des séquences de l'ARN ribosomique 16S[1]. La souche type de cette espèce a une homologie de séquence ARNr 16S de 95,7 % avec la souche type de l'espèce Acidaminococcus intestini et au maximum de 91,7 % avec les souches types des autres espèces de la famille Acidaminococcaceae[8].
Notes et références
- Marchandin et Jumas-Bilak 2011, p. 339.
- Chang et al. 2010, p. 3.
- Chang et al. 2010, p. 1.
- ↑ Chang et al. 2010, p. 1-2.
- ↑ GBIF Secretariat. GBIF Backbone Taxonomy. Checklist dataset https://doi.org/10.15468/39omei accessed via GBIF.org, consulté le 14 janvier 2026.
- List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 14 janvier 2026.
- ↑ Both et al. 1992, p. 7.
- ↑ Chang et al. 2010, p. 2.
Voir aussi
Bibliographie
- Publication originale (en) Morrison Rogosa, « Acidaminococcus gen. n., Acidaminococcus fermentans sp. n., anaerobic gram-negative diplococci using amino acids as the sole energy source for growth. », J Bacteriol, vol. 98, , p. 756-766 (DOI 10.1128/jb.98.2.756-766.1969)
- (en) Marchandin Hélène et Estelle Jumas-Bilak, « Acidaminococcus », dans Dongyou Liu, Molecular Detection of Human Bacterial Pathogens, CRC Press, , 1278 p. (ISBN 9781040070024), p. 339-348
- (en) Beatrix Both, Wolfgang Buckel, Reiner Kroppenstedt et Erko Stackebrandt, « Phylogenetic and chemotaxonomic characterization of Acidaminococcus fermentans », FEMS Microbiology Letters, vol. 97, nos 1-2, , p. 7-11 (DOI 10.1111/j.1574-6968.1992.tb05431.x)
- (en) Yun-Juan Chang, Rüdiger Pukall, Elizabeth Saunders, Alla Lapidus, Alex Copeland, Matt Nolan, Tijana Glavina Del Rio, Susan Lucas, Feng Chen, Hope Tice, Jan-Fang Cheng, Cliff Han, John C. Detter, David Bruce, Lynne Goodwin, Sam Pitluck, Natalia Mikhailova, Konstantinos Liolios, Amrita Pati, Natalia Ivanova, Konstantinos Mavromatis, Amy Chen, Krishna Palaniappan, Miriam Land, Loren Hauser, Cynthia D. Jeffries, Thomas Brettin, Manfred Rohde, Markus Göker, James Bristow, Jonathan A. Eisen, Victor Markowitz, Philip Hugenholtz, Nikos C. Kyrpides et Hans-Peter Klenk, « Complete genome sequence of Acidaminococcus fermentans type strain (VR4T) », Stand in Genomic Sci, vol. 3, , p. 1–14 (DOI 10.4056/sigs.1002553)
Liens externes
- (en) Catalogue of Life : Acidaminococcus fermentans Rogosa, 1969 (Approved Lists 1980) (consulté le )
- (fr + en) EOL : Acidaminococcus fermentans (consulté le )
- (fr + en) GBIF : Acidaminococcus fermentans A (consulté le )
- (en) IRMNG : Acidaminococcus fermentans A (consulté le )
- (fr + en) ITIS : Acidaminococcus fermentans Rogosa, 1969 emend. Cook et al., 1994 (consulté le )
- (en) LPSN : Acidaminococcus fermentans Rogosa 1969 (consulté le )
- (en) NCBI : Acidaminococcus fermentans (taxons inclus) (consulté le )
- (en) Taxonomicon : Acidaminococcus fermentans Rogosa 1969 (Approved Lists 1980) (consulté le )
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