Originaire de Murcie, César Pérez pratique le cyclisme depuis l'âge de dix ans. Sa première licence est prise au sein de la Valverde Team, un club fondé à l'initiative d'Alejandro Valverde, qui fut son idole d'enfance. Dans les rangs juniors, il se classe cinquième du championnat d'Espagne sur route en 2021. Il évolue aussi au sein de la réserve d'Eolo-Kometa en 2022[3]. Cette même année, il connaît sa première expérience au niveau international en participant à Paris-Roubaix juniors, sous les couleurs de la sélection espagnole.
Pour la saison 2023, il revient concourir dans son club formateur. Il intègre ensuite une équipe implantée dans la Communauté valencienne en 2024. César Pérez ne délaisse pas pour autant ses études en suivant une formation en soins infirmiers. Décrit comme un grimpeur « explosif »[3], il se distingue sur le circuit national en obtenant une victoire et diverses places d'honneur. Il termine notamment deuxième du championnat d'Espagne sur route espoirs, ou encore troisième de la Clásica Ciudad de Torredonjimeno, une manche de la Coupe d'Espagne amateurs.
En 2025, il change de nouveau de maillot en courant avec la réserve de l'UCI ProTeamKern Pharma. Régulier, il s'adjuge le classement final de la Coupe d'Espagne amateurs, après avoir remporté deux de ses manches[1],[2]. Il finit par ailleurs troisième du Tour d'Ávila, une course par étapes du calendrier national. Grâce à ses performances, il devient stagiaire chez Kern Pharma à partir du mois d'août. Il signe également un premier contrat professionnel de trois ans, qui prend effet à partir de 2026[4].