Chromobacteriaceae

Classification LPSN
Domaine	Bacteria
Règne	Pseudomonadati
Phylum	Pseudomonadota
Classe	Betaproteobacteria
Ordre	Neisseriales

Les Chromobacteriaceae sont une famille de bactéries à Gram négatif de l'ordre des Neisseriales. Son nom provient de Chromobacterium qui est le genre type de cette famille, créée en 2013 pour accommoder des genres bactériens auparavant classés parmi les Neisseriaceae.

Taxonomie

La famille Chromobacteriaceae a été créée en 2013 par scission de la famille Neisseriaceae en deux familles distinctes : les Neisseriaceae dont le genre type est toujours Neisseria et la famille Chromobacteriaceae dont le genre type est Chromobacterium^[1]. Elle a été créée pour inclure les bactéries hélicoïdales.

En 2021, une nouvelle étude phylogénétique sur un plus grand nombre de génomes complets, a proposé de scinder à nouveau les Neisseriaceae et les Chromobacteriaceae en conservant le nom de ces deux et en ajoutant trois nouvelles familles^[2]. Dans cette étude, 10 genres ont été déplacés des Chromobacteriaceae vers les autres familles mais à l'heure actuelle (au 28 juillet 2022), ces transferts ne sont toujours pas validés par l'ICSP.

Étymologie

L'étymologie du nom de la famille Chromobacteriaceae se résume ainsi : Chro.mo.bac.teri.a’ce.ae. N.L. neut. n. Chromobacterium, genre type de la famille; L. fem. pl. n. suff. -aceae, suffixe pour signifier une famille ; N.L. fem. pl. n. Chromobacteriaceae, la famille de Chromobacterium^[1]^,^[3].

Liste de genres

Selon la LPSN (10 février 2026)^[4] la famille des Chromobacteriaceae comporte les genres suivants :

Andreprevotia Weon et al. 2007
Aquaspirillum Hylemon et al. 1973
Aquitalea Lau et al. 2006
Chitinibacter Chern et al. 2004
Chitinilyticum Chang et al. 2007
Chitiniphilus Sato et al. 2009
Chromobacterium Bergonzini 1880 – genre type
Deefgea Stackebrandt et al. 2007
Formivibrio Tanaka et al. 1991
Gulbenkiania Vaz-Moreira et al. 2007
Iodobacter Logan 1989
Jeongeupia Yoon et al. 2010
Laribacter Yuen et al. 2002
Leeia Lim et al. 2007
Microvirgula Patureau et al. 1998
Paludibacterium Kwon et al. 2008
Prolinoborus Pot et al. 1992
Pseudogulbenkiania Lin et al. 2008
Silvimonas Yang et al. 2005
Vogesella Grimes et al. 1997

Description

La famille Chromobacteriaceae est formée de bactéries libres même si certaines peuvent être des pathogènes facultatifs. Ce seont des bacilles, se présentant seuls, en paires ou en petites chaînes. Un genre bactérien de cette famille, Aquaspirillum fait axception à ces formes en se présentant avec une morphologie hélicoïdale^[5]. Les bactéries de cette famille sont mobiles avec préseence de flagelles à l'exception de Formivibrio qui se meut par sa surface. À l'exception de Chromobacterium et de quelques souches de Vosgella, les bactéries de cette famille ne sont pas pigmentées^[1]. Le pourcentage en bases GC de l'ADN est de 49 à 70 %^[1].

Des indels de signatures conservées (CSI) ont été identifiées pour caractériser cette famille. Ces CSI sont présentes chez toutes les Neisseriales mais absentes des bactéries de la famille des Neisseriaceae. Ces signatures sont présentes sur les protéines suivantes : Glycine cleavage system aminomethyletransferase T (GcvT), hypothetical protein CV_3451, methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (IolA), ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha (NrdE), propionyl-CoA carboxylase subunit beta (PccB), succinyl-CoA synthetase subunit alphe (SucC) et tetraacyldisaccharide 4'-kinase (LpxK)^[1].

Références

(en) Mobolaji Adeolu et Radhey S. Gupta, « Phylogenomics and molecular signatures for the order Neisseriales: proposal for division of the order Neisseriales into the emended family Neisseriaceae and Chromobacteriaceae fam. nov. », Antonie Van Leeuwenhoek, vol. 104,‎ 11 avril 2013, p. 1-24 (DOI 10.1007/s10482-013-9920-6)
↑ (en) S Chen, B Rudra et RS Gupta, « Phylogenomics and molecular signatures support division of the order Neisseriales into emended families Neisseriaceae and Chromobacteriaceae and three new families Aquaspirillaceae fam. nov., Chitinibacteraceae fam. nov., and Leeiaceae fam. nov. », Syst Appl Microbiol, vol. 44,‎ 2021, p. 126251 (DOI https://doi.org/10.1016/j.syapm.2021.126251)
↑ (en) « Family Chromobacteriaceae », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le 28 juillet 2022)
↑ List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 10 février 2026.
↑ (en) P.B. Hylemon, J.S. Wells Jr., N.R. Krieg et H.W. Jannasch, « The genus Spirillum: A taxonomic study », International Journal of Systematic Bacteriology, vol. 23, n^o 4,‎ 1^er octobre 1973, p. 340-380 (DOI 10.1099/00207713-23-4-340)

Liens externes

Ressources relatives au vivant :

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[Adeolu2013-1] (en) Mobolaji Adeolu et Radhey S. Gupta, « Phylogenomics and molecular signatures for the order Neisseriales: proposal for division of the order Neisseriales into the emended family Neisseriaceae and Chromobacteriaceae fam. nov. », Antonie Van Leeuwenhoek, vol. 104,‎ 11 avril 2013, p. 1-24 (DOI 10.1007/s10482-013-9920-6)

[Chen2021-2] (en) S Chen, B Rudra et RS Gupta, « Phylogenomics and molecular signatures support division of the order Neisseriales into emended families Neisseriaceae and Chromobacteriaceae and three new families Aquaspirillaceae fam. nov., Chitinibacteraceae fam. nov., and Leeiaceae fam. nov. », Syst Appl Microbiol, vol. 44,‎ 2021, p. 126251 (DOI https://doi.org/10.1016/j.syapm.2021.126251)

[LPSNChrom-3] (en) « Family Chromobacteriaceae », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le 28 juillet 2022)

[LPSN10_février_2026-4] List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 10 février 2026.

[Hylemon1973-5] (en) P.B. Hylemon, J.S. Wells Jr., N.R. Krieg et H.W. Jannasch, « The genus Spirillum: A taxonomic study », International Journal of Systematic Bacteriology, vol. 23, n^o 4,‎ 1^er octobre 1973, p. 340-380 (DOI 10.1099/00207713-23-4-340)

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