EBF1

EBF1
	Structure de la protéine EBF1. Basée sur l'identifiant PDB 3LYR.
Structures disponibles
PDB	Recherche d'orthologue : PDBe RCSB
Identifiants PDB
	3LYR, 3MQI
Identifiants
Alias	EBF1, Facteur de transcription COE1
IDs externes	OMIM: 164343 MGI: 95275 HomoloGene: 7297 GeneCards: EBF1
Position du gène (humain)
Chr.	Chromosome 5 humain
Fin	159,099,916 bp
Position du gène (souris)
Chr.	Chromosome 11 (souris)
Fin	45,008,091 bp
Expression génique
	Fortement exprimé dans
	jointure synoviale; ; membrane synoviale; ; tendon calcanéen; ; ovocyte; ; buccal mucosa cell; ; skin of hip; ; cardiac muscle tissue of right atrium; ; parietal pleura; ; veine cave; ; ganglion sensitif d’un nerf spinal;
	Fortement exprimé dans
	artère carotide externe; ; artère carotide interne; ; ganglion trigéminal; ; ganglion cervical supérieur; ; ganglion sensitif d’un nerf spinal; ; tube neural; ; cheville; ; lumbar spinal ganglion; ; subcutaneous adipose tissue; ; tissu adipeux brun;
	Plus de données d'expression de référence
	n/a
Gene Ontology
Fonction moléculaire	liaison ADN; liaison protéique; liaison ion métal; DNA-binding transcription factor activity; protein dimerization activity; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; C2H2 zinc finger domain binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific;
Composant cellulaire	noyau;
Processus biologique	développent d'un organisme multicellulaire; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; regulation of transcription by RNA polymerase II; positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
	1879
	13591
	ENSG00000164330
	ENSMUSG00000057098
	Q9UH73
	Q07802
NM_001290360; NM_024007; NM_182708; NM_001324101; NM_001324103;
	NM_001324106; NM_001324107; NM_001324108; NM_001324109; NM_001324111; NM_001364155; NM_001364156; NM_001364157; NM_001364158; NM_001364159
	NM_001290709; NM_001290710; NM_001290711; NM_007897
NP_001277289; NP_001311030; NP_001311032; NP_001311035; NP_001311036;
	NP_001311037; NP_001311038; NP_001311040; NP_076870; NP_874367; NP_001351084; NP_001351085; NP_001351086; NP_001351087; NP_001351088
NP_001277638; NP_001277639; NP_001277640; NP_031923; NP_001349498;
	NP_001349500; NP_001349503; NP_001349504; NP_001349505; NP_001349506; NP_001349507; NP_001349508
	Wikidata
Voir/Editer Humain	Voir/Editer Souris

Le facteur de transcription COE1 est une protéine codée par le gène EBF1 chez l'homme.

EBF1 est le sigle anglais de Early B-Cell Factor 1^[5]^,^[6]^,^[7].

Interactions

Il fut montré qu'EBF1 interagit avec ZNF423^[8] et CREB^[9].

Notes et références

GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000164330 - Ensembl, May 2017
GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000057098 - Ensembl, May 2017
↑ « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
↑ « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
↑ « Symbol Report: EBF1 »
↑ « Gene for a tissue-specific transcriptional activator (EBF or Olf-1), expressed in early B lymphocytes, adipocytes, and olfactory neurons, is located on human chromosome 5, band q34, and proximal mouse chromosome 11 », Mamm. Genome, vol. 5, n^o 4,‎ juillet 1994, p. 211–5 (PMID 8012110, DOI 10.1007/BF00360547)
↑ « Entrez Gene: EBF1 early B-cell factor 1 »
↑ « Cloning and functional characterization of Roaz, a zinc finger protein that interacts with O/E-1 to regulate gene expression: implications for olfactory neuronal development », J. Neurosci., vol. 17, n^o 11,‎ juin 1997, p. 4159–69 (PMID 9151733)
↑ « Inhibition of p300/CBP by early B-cell factor », Mol. Cell. Biol., vol. 23, n^o 11,‎ juin 2003, p. 3837–46 (PMID 12748286, PMCID 155219, DOI 10.1128/MCB.23.11.3837-3846.2003)

Bibliographie

Liens externes

FactorBook EBF1

Portail de la biologie cellulaire et moléculaire

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000164330 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000057098 - Ensembl, May 2017

[3] « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine

[4] « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine

[5] « Symbol Report: EBF1 »

[pmid8012110-6] « Gene for a tissue-specific transcriptional activator (EBF or Olf-1), expressed in early B lymphocytes, adipocytes, and olfactory neurons, is located on human chromosome 5, band q34, and proximal mouse chromosome 11 », Mamm. Genome, vol. 5, n^o 4,‎ juillet 1994, p. 211–5 (PMID 8012110, DOI 10.1007/BF00360547)

[entrez-7] « Entrez Gene: EBF1 early B-cell factor 1 »

[pmid9151733-8] « Cloning and functional characterization of Roaz, a zinc finger protein that interacts with O/E-1 to regulate gene expression: implications for olfactory neuronal development », J. Neurosci., vol. 17, n^o 11,‎ juin 1997, p. 4159–69 (PMID 9151733)

[pmid12748286-9] « Inhibition of p300/CBP by early B-cell factor », Mol. Cell. Biol., vol. 23, n^o 11,‎ juin 2003, p. 3837–46 (PMID 12748286, PMCID 155219, DOI 10.1128/MCB.23.11.3837-3846.2003)

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