Haplogroupe R2
| Date d'origine | Peut-être le 27 000 avant J.C |
|---|---|
| Place d'origine | Asie centrale ou Asie du Sud |
| Ancêtre | Haplogroupe P |
| Descendants |
R2a (M124); R2b (FGC21706) |
| Mutations définies | M479 |
L'haplogroupe R2, ou R-M479, est un haplogroupe du chromosome Y caractérisé par le marqueur génétique M479. Il est l'un des deux principaux descendants de l'haplogroupe R (R-M207), l'autre étant R1 (R-M173).
Le gène R-M479, et plus particulièrement son variant R2a (R-M124), est géographiquement concentré en Asie du Sud, en Asie centrale et dans certaines régions du Moyen-Orient depuis la préhistoire[1]. Le gène R2 (à l'exclusion de R2a) semble atteindre ses niveaux les plus élevés chez le peuple Burusho du nord du Pakistan[2].
R2 a des taux d'échantillonnage beaucoup plus faibles que son homologue R1[3] avec 399 branches en aval de R-M479, contre 46 529 pour R-M173.
Elle comporte deux branches principales : R2a (M124) et R2b (R-FGC21706).
Structure
- R (M207/Page37/UTY2)
- R1 (M173/P241/Page 29)
- R2 (M479/PF6107, L266/PF6108, L722, L726)
- R2a (M124, F820/Page4, L381, P249)
- R2a1 (L263)
- R2a2 (P267/PF6109)
- R2b (FGC21706, FGC50198, FGC50325, FGC50333, SK2163, SK2164, SK2165, SK2166)
- R2b1 (FGC50339)
- R2a (M124, F820/Page4, L381, P249)
Source : ISOGG 2017.
Répartition géographique
La plupart des recherches se sont limitées à la détection des allèles R-M479 (R2) et R-M124 (R2a), ou des SNP situés en aval de M124 (comme P249, P267, L266, PAGES00004 et L381). L'autre branche principale, R2b (R-FGC21706), ayant été découverte plus tardivement que R2a, sa recherche est souvent négligée. De ce fait, la plupart des résultats sont décrits comme R2(xR2a).
De plus, relativement peu de recherches ont été menées en Asie du Sud, région pourtant connue pour présenter la plus forte concentration de R2. (Par conséquent, les chiffres cités dans le tableau de droite peuvent ne pas refléter les fréquences réelles ; le Pakistan est le seul pays d'Asie du Sud à y figurer.)
En 2013, R2(xR2a) a été trouvé chez 5 des 19 hommes de la minorité Burusho du nord du Pakistan[2].
R2a (R-M124)
L'haplogroupe R2a (R-M124) est caractérisé par le SNP M124, F820/Page4, L381 et P249 et se rencontre principalement en Asie du Sud, avec des fréquences plus faibles en Asie centrale, au Moyen-Orient et dans le Caucase[1]. On le retrouve également dans plusieurs populations juives : les juifs irakiens, les juifs persans, les juifs des montagnes et les juifs ashkénazes[4].
R2b (R-FGC21706/ R-FGC50231)
On le trouve principalement dans le sous-continent indien. Sur FTDNA, la plus grande fréquence de personnes testées positives au R-FGC50231 provient du Pakistan (2 % des tests), ainsi que d'autres pays importants comme l'Inde, l'Afghanistan et le Tadjikistan[5],[6].
Arbre phylogénétique
| M479 |
| |||||||||
Description du SNP M479
| Marqueur de nom commun | M479 |
|---|---|
| Haplogroupe YCC | R-M479 |
| Changement de nucléotide | C à T |
| taille de l'amplicon (pb) séquence de référence | 323 |
| Position du polymorphisme à partir de l'extrémité 5' | 107 |
| Variante d'enzyme de restriction | HPI |
| ID RefSNP | - |
| Position Y | 19294055 |
| Amorce avant 5'-3' | gatactttatcaggcttacttc |
| Amorce inversée 5'-3' | aaccaaatctctcagaatcg |
Notes
- Jean-Grégoire Manoukian, « A Synthesis of Haplogroup R2 », ysearch.org, (lire en ligne [archive du ])
- (en) Julie Di Cristofaro, Erwan Pennarun, Stéphane Mazières, Natalie M. Myres, Alice A. Lin, Shah Aga Temori, Mait Metspalu, Ene Metspalu, Michael Witzel, Roy J. King, Peter A. Underhill, Richard Villems et Jacques Chiaroni, « Afghan Hindu Kush: Where Eurasian Sub-Continent Gene Flows Converge », PLOS ONE, vol. 8, no 10, (PMID 24204668, PMCID 3799995, DOI 10.1371/journal.pone.0076748
, Bibcode 2013PLoSO...876748D) - « FamilyTreeDNA - Genetic Testing for Ancestry, Family History & Genealogy », sur FamilyTreeDNA (consulté le )
- Kevin Alan Brook, The Jews of Khazaria, Rowman & Littlefield, 3rd éd. (ISBN 978-1-5381-0342-5, DOI 10.5040/9798881833770), p. 185
- « R-FGC50227 YTree », sur YFull (consulté le )
- « Welcome to FamilyTreeDNA Discover », sur FamilyTreeDNA (consulté le )
- Jean-Grégoire Manoukian, « A Synthesis of Haplogroup R2 », EthnoAncestry, (lire en ligne [archive du ])
- (en) Cristofaro, Pennarun, Mazières et Myres, « Afghan Hindu Kush: Where Eurasian Sub-Continent Gene Flows Converge », PLOS ONE, vol. 8, no 10, (PMID 24204668, PMCID 3799995, DOI 10.1371/journal.pone.0076748, Bibcode 2013PLoSO...876748D)
- ↑ « FamilyTreeDNA - Genetic Testing for Ancestry, Family History & Genealogy », FamilyTreeDNA (consulté le )
- ↑ Kevin Alan Brook, The Jews of Khazaria, Rowman & Littlefield (ISBN 978-1-5381-0342-5, DOI 10.5040/9798881833770), p. 185
- ↑ « R-FGC50227 YTree », YFull (consulté le )
- ↑ « Welcome to FamilyTreeDNA Discover », FamilyTreeDNA (consulté le )
Voir aussi
Sous-clades de l'ADN-Y R-M207
- R-L21
- R-L295
- R-M124
- R-M167
- R-M17
- R-M173
- R-M207
- R-M342
- R-M420
- R-M479
- R-U106
Arbre généalogique de l'ADN-Y
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Haplogroupes du chromosome Y (Y-ADN) | ||||||||||||||||||||||||
| Plus récent ancêtre patrilinéaire commun | ||||||||||||||||||||||||
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| BT | ||||||||||||||||||||||||
| B | CT | |||||||||||||||||||||||
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| D | E | C | F | |||||||||||||||||||||
| G | H | IJK | ||||||||||||||||||||||
| IJ | K | |||||||||||||||||||||||
| I | J | LT | K2 | |||||||||||||||||||||
| I1 | L | T | MS | P | NO | |||||||||||||||||||
| M | S | Q | R | N | O | |||||||||||||||||||
| R1 | R2 | |||||||||||||||||||||||
| R1a | R1b | |||||||||||||||||||||||
Liens externes
- Exploration de l'haplogroupe R2 (ADN-Y)
- Liste des fréquences R2
- Projet R2-M124-WTY (Promenade en Y)
- Le projet ADN généalogique de l'Inde
- Projet d'ADN de l'haplogroupe du chromosome Y R2
- Portail de la biologie