Haplogroupe R2

Haplogroupe R2
Caractéristiques
Date d'origine Peut-être le 27 000 avant J.C
Place d'origine Asie centrale ou Asie du Sud
Ancêtre Haplogroupe P
Descendants R2a (M124);
R2b (FGC21706)
Mutations définies M479

L'haplogroupe R2, ou R-M479, est un haplogroupe du chromosome Y caractérisé par le marqueur génétique M479. Il est l'un des deux principaux descendants de l'haplogroupe R (R-M207), l'autre étant R1 (R-M173).

Le gène R-M479, et plus particulièrement son variant R2a (R-M124), est géographiquement concentré en Asie du Sud, en Asie centrale et dans certaines régions du Moyen-Orient depuis la préhistoire[1]. Le gène R2 (à l'exclusion de R2a) semble atteindre ses niveaux les plus élevés chez le peuple Burusho du nord du Pakistan[2].

R2 a des taux d'échantillonnage beaucoup plus faibles que son homologue R1[3] avec 399 branches en aval de R-M479, contre 46 529 pour R-M173.

Elle comporte deux branches principales : R2a (M124) et R2b (R-FGC21706).

Structure

  • R (M207/Page37/UTY2)
    • R1 (M173/P241/Page 29)
    • R2 (M479/PF6107, L266/PF6108, L722, L726)
      • R2a (M124, F820/Page4, L381, P249)
        • R2a1 (L263)
        • R2a2 (P267/PF6109)
      • R2b (FGC21706, FGC50198, FGC50325, FGC50333, SK2163, SK2164, SK2165, SK2166)
        • R2b1 (FGC50339)

Source : ISOGG 2017.

Répartition géographique

La plupart des recherches se sont limitées à la détection des allèles R-M479 (R2) et R-M124 (R2a), ou des SNP situés en aval de M124 (comme P249, P267, L266, PAGES00004 et L381). L'autre branche principale, R2b (R-FGC21706), ayant été découverte plus tardivement que R2a, sa recherche est souvent négligée. De ce fait, la plupart des résultats sont décrits comme R2(xR2a).

De plus, relativement peu de recherches ont été menées en Asie du Sud, région pourtant connue pour présenter la plus forte concentration de R2. (Par conséquent, les chiffres cités dans le tableau de droite peuvent ne pas refléter les fréquences réelles ; le Pakistan est le seul pays d'Asie du Sud à y figurer.)

En 2013, R2(xR2a) a été trouvé chez 5 des 19 hommes de la minorité Burusho du nord du Pakistan[2].

R2a (R-M124)

L'haplogroupe R2a (R-M124) est caractérisé par le SNP M124, F820/Page4, L381 et P249 et se rencontre principalement en Asie du Sud, avec des fréquences plus faibles en Asie centrale, au Moyen-Orient et dans le Caucase[1]. On le retrouve également dans plusieurs populations juives : les juifs irakiens, les juifs persans, les juifs des montagnes et les juifs ashkénazes[4].

R2b (R-FGC21706/ R-FGC50231)

On le trouve principalement dans le sous-continent indien. Sur FTDNA, la plus grande fréquence de personnes testées positives au R-FGC50231 provient du Pakistan (2 % des tests), ainsi que d'autres pays importants comme l'Inde, l'Afghanistan et le Tadjikistan[5],[6].

Arbre phylogénétique

M479

R2*


M124

R2a


FGC21706

R2b



Description du SNP M479

Marqueur de nom commun M479
Haplogroupe YCC R-M479
Changement de nucléotide C à T
taille de l'amplicon (pb) séquence de référence 323
Position du polymorphisme à partir de l'extrémité 5' 107
Variante d'enzyme de restriction HPI
ID RefSNP -
Position Y 19294055
Amorce avant 5'-3' gatactttatcaggcttacttc
Amorce inversée 5'-3' aaccaaatctctcagaatcg

Notes

  1. Jean-Grégoire Manoukian, « A Synthesis of Haplogroup R2 », ysearch.org,‎ (lire en ligne [archive du ])
  2. (en) Julie Di Cristofaro, Erwan Pennarun, Stéphane Mazières, Natalie M. Myres, Alice A. Lin, Shah Aga Temori, Mait Metspalu, Ene Metspalu, Michael Witzel, Roy J. King, Peter A. Underhill, Richard Villems et Jacques Chiaroni, « Afghan Hindu Kush: Where Eurasian Sub-Continent Gene Flows Converge », PLOS ONE, vol. 8, no 10,‎ (PMID 24204668, PMCID 3799995, DOI 10.1371/journal.pone.0076748 Accès libre, Bibcode 2013PLoSO...876748D)
  3. « FamilyTreeDNA - Genetic Testing for Ancestry, Family History & Genealogy », sur FamilyTreeDNA (consulté le )
  4. Kevin Alan Brook, The Jews of Khazaria, Rowman & Littlefield, 3rd éd. (ISBN 978-1-5381-0342-5, DOI 10.5040/9798881833770), p. 185
  5. « R-FGC50227 YTree », sur YFull (consulté le )
  6. « Welcome to FamilyTreeDNA Discover », sur FamilyTreeDNA (consulté le )
  1. Jean-Grégoire Manoukian, « A Synthesis of Haplogroup R2 », EthnoAncestry,‎ (lire en ligne [archive du ])
  2. (en) Cristofaro, Pennarun, Mazières et Myres, « Afghan Hindu Kush: Where Eurasian Sub-Continent Gene Flows Converge », PLOS ONE, vol. 8, no 10,‎ (PMID 24204668, PMCID 3799995, DOI 10.1371/journal.pone.0076748, Bibcode 2013PLoSO...876748D)
  3. « FamilyTreeDNA - Genetic Testing for Ancestry, Family History & Genealogy », FamilyTreeDNA (consulté le )
  4. Kevin Alan Brook, The Jews of Khazaria, Rowman & Littlefield (ISBN 978-1-5381-0342-5, DOI 10.5040/9798881833770), p. 185
  5. « R-FGC50227 YTree », YFull (consulté le )
  6. « Welcome to FamilyTreeDNA Discover », FamilyTreeDNA (consulté le )

Voir aussi

Sous-clades de l'ADN-Y R-M207

  • R-L21
  • R-L295
  • R-M124
  • R-M167
  • R-M17
  • R-M173
  • R-M207
  • R-M342
  • R-M420
  • R-M479
  • R-U106

Arbre généalogique de l'ADN-Y

Haplogroupes du chromosome Y (Y-ADN)

Plus récent ancêtre patrilinéaire commun
A
BT
 B CT
DE CF
 D E C F
 G H IJK
IJ K
I J LT K2
I1 L T  MS  P  NO
M S Q R N O
R1 R2
R1a R1b

Liens externes

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