Haplogroupe R (ADNmt)

Caractéristiques
Date d'origine	Il y a 50-70 000 ans
Place d'origine	Asie du Sud-Est
Ancêtre	Haplogroupe N (ADNmt)

L'haplogroupe R est un haplogroupe d'ADN mitochondrial (haplogroupe féminin) humain largement répandu. L'haplogroupe R est associé à la sortie d'Afrique par homo sapiens il y a environ 70 000 ans et est présent dans les populations modernes du monde entier, à l'exception de l'Afrique subsaharienne^[1].

L'haplogroupe R est un descendant du macro-haplogroupe N. Parmi les haplogroupes descendants du clade R figurent B, U, F, R0 et JT (l'haplogroupe ancestral de J et de T).

Origine

Soares et al. (2009) estiment l'âge du R à environ 50 000 à 70 000 ans.

Cela concorde avec une émergence survenue lors de la dispersion méridionale depuis l'Afrique de l'Est vers l'Asie de l'Ouest, du Sud et du Sud-Est. Il a été suggéré que les premiers haplogroupes M, N et R se seraient propagés le long de la route côtière il y a environ 70 000 à 60 000 ans^[2]. Une autre possibilité est celle d'une migration par le nord hors d'Afrique, l'expansion du R pouvant alors provenir d'Asie du Sud-Est^[3].

L’haplogroupe R présente une grande diversité et une longue histoire au sein des populations autochtones d’ Asie du Sud. Les tribus et les castes basses de l’ouest et du sud de l’Inde affichent une diversité plus élevée que dans les autres régions, ce qui pourrait indiquer leur caractère autochtone^[4]. Larruga et al. (2017) ont constaté que l’haplogroupe R de l’ADNmt s’est répandu en Eurasie et en Australie à partir d’une zone centrale située le long de la côte sud-est asiatique^[1].

Bibliographie

Soares, Pedro; Ermini, Luca; Thomson, Noel; Mormina, Maru; Rito, Teresa; Röhl, Arne; Salas, Antonio; Oppenheimer, Stephen; MacAulay, Vincent (2009). "Correcting for Purifying Selection: An Improved Human Mitochondrial Molecular Clock". The American Journal of Human Genetics. 84 (6): 740–59. doi:10.1016/j.ajhg.2009.05.001. PMC 2694979. PMID 19500773.
Larruga, Jose M (23 May 2017).
Van Oven, Mannis; Kayser, Manfred (2009).
Monika Karmin, Human mitochondrial DNA haplogroup R in India: dissecting the phylogenetic tree of South Asian-specific lineages (thèse), University of Tartu, 2005 (OCLC 692161090, hdl 10062/567)

Références

Larruga, « Carriers of mitochondrial DNA macrohaplogroup R colonized Eurasia and Australasia from a southeast Asia core area », BMC Evolutionary Biology, vol. 17, n^o 1,‎ 23 mai 2017 (PMID 28535779, PMCID 5442693, DOI 10.1186/s12862-017-0964-5, Bibcode 2017BMCEE..17..115L)
↑ Palanichamy, Sun, Agrawal et Bandelt, « Phylogeny of Mitochondrial DNA Macrohaplogroup N in India, Based on Complete Sequencing: Implications for the Peopling of South Asia », The American Journal of Human Genetics, vol. 75, n^o 6,‎ 2004, p. 966–78 (PMID 15467980, PMCID 1182158, DOI 10.1086/425871, Bibcode 2004AmJHG..75..966P)
↑ « Carriers of mitochondrial DNA macrohaplogroup R colonized Eurasia and Australasia from a southeast Asia core area », BMC Evolutionary Biology, vol. 17, n^o 1,‎ 2017 (PMID 28535779, PMCID 5442693, DOI 10.1186/s12862-017-0964-5, Bibcode 2017BMCEE..17..115L)
↑ Maji, Krithika et Vasul, « Distribution of Mitochondrial DNA Macrohaplogroup N in India with Special Reference to Haplogroup R and its Sub-Haplogroup U », International Journal of Human Genetics, vol. 8, n^os 1–2,‎ 2008, p. 85–96 (DOI 10.1080/09723757.2008.11886022, S2CID 14231815, lire en ligne)