Peroxydase de cytochrome c
de cytochrome c
| N° EC | EC |
|---|---|
| N° CAS | |
| Cofacteur(s) | Hème |
| IUBMB | Entrée IUBMB |
|---|---|
| IntEnz | Vue IntEnz |
| BRENDA | Entrée BRENDA |
| KEGG | Entrée KEGG |
| MetaCyc | Voie métabolique |
| PRIAM | Profil |
| PDB | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum |
| GO | AmiGO / EGO |

Une peroxydase de cytochrome c ou cytochrome c-peroxydase (CCP) est une oxydoréductase qui catalyse la réaction :
- 2 ferrocytochrome c + H2O2 2 ferricytochrome c + 2 H2O.
Cette enzyme est une hémoprotéine soluble dans l'eau isolée pour la première fois en 1940 à partir de levure de boulanger et purifiée au début des années 1960. Sa structure à l'état solide a été élucidée à la fin des années 1970 par cristallographie aux rayons X[1].
L'enzyme extraite de la levure est un monomère de 293 résidus d'acides aminés et de masse moléculaire 34 kDa. Elle contient une molécule d'hème b lié par covalence. De manière inattendue pour une protéine, elle cristallise par dialyse dans l'eau distillée et sa cristallisation contribue à sa purification, ce qui fait de la cristallisation l'étape finale de la purification de cette protéine.
Comme les autres peroxydases héminiques, la peroxydase de cytochrome c agit par un mécanisme à trois étapes faisant intervenir un composé I et un composé II intermédiaires :
- CCP + ROOH → composé I + ROH + H2O ;
- CCP-composé I + e− + H+ → composé II ;
- composé II + e− + H+ → CCP.
Les peroxydases de cytochrome c fonctionnent de manière légèrement différente de la plupart des autres peroxydases héminiques en ce qu'elles portent un équivalent d'oxydation sur la chaîne latérale d'un résidu de tryptophane (le résidu Trp191[2]) et non sur la porphyrine. Le composé I de cette enzyme a une durée de vie assez long, évoluant en composé II avec une demi-vie allant de 40 minutes à quelques heures à température ambiante.
Notes et références
- ↑ (en) Thomas L. Poulos, Stephan T. Freer, Richard A. Alden, Steven L. Edwards, Ulf Skogland, Koji Takio, Birgitta Eriksson, Nguyen-huu Xuong, Takashi Yonetani et Joseph Kraut, « The crystal structure of cytochrome c peroxidase », Journal of Biological Chemistry, vol. 255, no 2, , p. 575-580 (PMID 6243281, lire en ligne)
- ↑ (en) M. Sivaraja, D. B. Goodin, M. Smith et B. M. Hoffman, « Identification by ENDOR of Trp191 as the free-radical site in cytochrome c peroxidase compound ES », Science, vol. 245, no 4919, , p. 738-740 (PMID 2549632, DOI 10.1126/science.2549632, Bibcode 1989Sci...245..738S, lire en ligne)
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