Thalassiosira pseudonana

Thalassiosira pseudonana
Description de cette image, également commentée ci-après
Thalassiosira pseudonana observées au microscope électronique à balayage
Classification
Empire Eukaryota
Règne Chromista
Embranchement Bacillariophyta
Classe Thalassiosirophyceae
Sous-classe Thalassiosirophycidae
Ordre Thalassiosirales
Famille Thalassiosiraceae
Genre Thalassiosira

Espèce

Thalassiosira pseudonana
Hasle & Heimdal 1970

Thalassiosira pseudonana (anciennement Cyclotella nana) est une espèce de diatomée marine du genre Thalassiosira, largement utilisée comme organisme modèle en biologie marine et en génomique. Initialement isolée en 1957 en eau douce en Allemagne[1], cette espèce a par la suite été observée dans une grande diversité de milieux, incluant des habitats saumâtres et marins. En plus de ce caractère euryhalin, T. pseudonana peut tolérer une large gamme de conditions environnementales[2].

En 2004, elle est devenue l’un des premiers phytoplanctons marins eucaryotes dont le génome a été entièrement séquencé[3]. Ce choix s’explique par caractéristiques favorables : une croissance rapide, une distribution cosmopolite et un génome relativement compact (34 mégabases ). Le séquençage a révélé un génome complexe, issu d’une histoire évolutive marquée par des événements d’endosymbiose et de transfert horizontal de gènes, ainsi qu’une grande diversité de voies métaboliques impliquées dans le métabolisme du carbone, la perception de la lumière et l’assimilation des nutriments[3].

T. pseudonana est l'un des organismes modèle pour l’étude des diatomées, notamment grâce au développement d’outils de manipulation génétique (transformation, interférence ARN, CRISPR/Cas9) permettant l’analyse fonctionnelle des gènes in vivo dans cette espèce[4]. Elle est particulièrement utilisée pour étudier la biominéralisation de la silice, processus par lequel les diatomées forment leur paroi cellulaire (frustule) constituée de structures siliceuses hiérarchisées[5]. La capacité de T. pseudonana à produire des structures de silice complexes suscite également un intérêt en biotechnologie, notamment dans les domaines des nanomatériaux, de la catalyse et des biosenseurs[6].

Plus largement, cette espèce a fait l'objet d'études portant sur la compréhension des réponses physiologiques des diatomées aux variations environnementales (lumière, nutriments, température, acidification des océans), contribuant ainsi à une meilleure compréhension du rôle du phytoplancton dans les écosystèmes marins et les cycles biogéochimiques globaux[2],[4].

Notes et références

  1. ↑ (en-US) « Hustedt 1957 - Die Diatomeenflora des Flußsystems der Weser im Gebiet der Hansestadt Bremen. | Citations - Diatoms of North America », sur diatoms.org (consulté le )
  2. (en) Edward A. Laws, S. Alex McClellan et Uta Passow, « Interactive Effects of CO 2 , Temperature, Irradiance, and Nutrient Limitation on the Growth and Physiology of the Marine Diatom Thalassiosira pseudonana (Coscinodiscophyceae) », Journal of Phycology, vol. 56, no 6,‎ , p. 1614–1624 (ISSN 0022-3646 et 1529-8817, DOI 10.1111/jpy.13048, lire en ligne, consulté le )
  3. E. Armbrust, J. Berges, C. Bowler, B. Green, D. Martinez, N. Putnam, S. Zhou, A. Allen, K. Apt, M. Bechner, M.A. Brzezinski, B. K. Chaal, A. Chiovitti, A.K. Davis, M.S. Demarest, J.C. Detter, T. Glavina, D. Goodstein, M.Z. Hadi, U. Hellsten, M. Hildebrand, B.D. Jenkins, J. Jurka, V.V. Kapitonov, N. Kröger, W.W. Lau, T.W. Lane, F.W. Larimer, J.C. Lippmeier et S. Lucas, « The genome of the diatom Thalassiosira pseudonana: ecology, evolution, and metabolism », Science, vol. 306, no 5693,‎ , p. 79–86 (PMID 15459382, DOI 10.1126/science.1101156, Bibcode 2004Sci...306...79A, S2CID 8593895, CiteSeerx 10.1.1.690.4884)
  4. (en) Nicole Poulsen et Nils Kröger, « Thalassiosira pseudonana ( Cyclotella nana ) (Hustedt) Hasle et Heimdal (Bacillariophyceae): A genetically tractable model organism for studying diatom biology, including biological silica formation », Journal of Phycology, vol. 59, no 5,‎ , p. 809–817 (ISSN 0022-3646 et 1529-8817, DOI 10.1111/jpy.13362, lire en ligne, consulté le )
  5. ↑ (en) Manfred Sumper et Eike Brunner, « Silica Biomineralisation in Diatoms: The Model Organism Thalassiosira pseudonana », ChemBioChem, vol. 9, no 8,‎ , p. 1187–1194 (ISSN 1439-4227 et 1439-7633, DOI 10.1002/cbic.200700764, lire en ligne, consulté le )
  6. ↑ (en) Dusan Losic, Diatom Nanotechnology: Progress and Emerging Applications, Royal Society of Chemistry, (ISBN 978-1-78262-932-0, lire en ligne)
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