Alcune squadre italiane sono state rimpiazzate in seguito agli sviluppi giudiziari dello scandalo che ha coinvolto il calcio italiano nel maggio 2006, al termine del campionato di Serie A 2005-2006. La Juventus, la Fiorentina, la Lazio e il Milan, accusate formalmente il 22 giugno, sono state giudicate il 14 luglio dalla Commissione di Appello Federale e dalla FIGC. La sentenza di appello, resa nota il 25 luglio, ha sancito la retrocessione in Serie B della Juventus con 17 punti di penalizzazione nella stagione 2006-2007, la penalizzazione di 19 punti nel campionato 2006-2007 della Fiorentina, la penalizzazione di 11 punti nella stagione 2006-2007 della Lazio e la penalizzazione di 8 punti nella stagione 2006-2007 del Milan. Juventus, Milan, Fiorentina e Lazio sono state penalizzate anche per il campionato di Serie A 2005-2006: la Juventus con il declassamento all'ultimo posto in classifica e le altre con 30 punti di penalizzazione a testa.
Per questa ragione Juventus, Fiorentina e Lazio sono state escluse dalle competizioni europee, mentre il Milan (retrocesso dal secondo al terzo posto) ha perso il diritto di accedere alla prima fase della Champions League ed è stato ammesso al terzo turno preliminare. In sostituzione di Juventus e Milan, sono state ammesse alla fase a gironi della Champions League Inter e Roma. Il Chievo Verona, già qualificato in Coppa UEFA è stato così ammesso al terzo turno preliminare della Champions League al posto della Fiorentina, ma essendo stato eliminato (ad opera del Levski Sofia), è stato quindi inserito nel tabellone della Coppa UEFA. Così a rappresentare l'Italia nella Coppa UEFA 2006-2007 inizialmente c'erano Chievo Verona, Palermo, Livorno e Parma.
Il 3 luglio 2006 la FIFA aveva inoltre sospeso la Federazione calcistica greca da tutte le competizioni europee a causa di incompatibilità tra la legge greca e le regole FIFA. Tuttavia, dopo che la legge è stata emendata per venire incontro alle obiezioni mosse dalla FIFA, il 12 luglio la sospensione è stata annullata dalla stessa FIFA.
Risultati
Preliminari
Primo turno
Andata 13 luglio, ritorno 27 luglio 2006.
Secondo turno
Andata 8 e 10 agosto, ritorno 24 agosto 2006.
Tabellone principale
Primo turno
Andata 14 e 15 settembre, ritorno 28 settembre 2006.
Fase a gruppi
A gironi eliminatori. Qualificate al turno successivo le prime tre squadre.
Girone A
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| 1ª giornata |
| Livorno | 2-3 | Rangers | |
| Maccabi Haifa | 3-1 | Auxerre | |
| 2ª giornata |
| Rangers | 2-0 | Maccabi Haifa | |
| Partizan | 1-1 | Livorno | |
| 3ª giornata |
| Auxerre | 2-2 | Rangers | |
| Maccabi Haifa | 1-0 | Partizan | |
| 4ª giornata |
| Partizan | 1-4 | Auxerre | |
| Livorno | 1-1 | Maccabi Haifa | |
| 5ª giornata |
| Auxerre | 0-1 | Livorno | |
| Rangers | 1-0 | Partizan | |
Girone B
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| 1ª giornata |
| Beşiktaş | 0-2 | Tottenham | |
| Club Burges | 1-1 | Leverkusen | |
| 2ª giornata |
| Tottenham | 3-1 | Club Burges | |
| Dinamo Bucarest | 2-1 | Beşiktaş | |
| 3ª giornata |
| Leverkusen | 0-1 | Tottenham | |
| Club Burges | 1-1 | Dinamo Bucarest | |
| 4ª giornata |
| Dinamo Bucarest | 2-1 | Leverkusen | |
| Beşiktaş | 2-1 | Club Burges | |
| 5ª giornata |
| Leverkusen | 2-1 | Beşiktaş | |
| Tottenham | 3-1 | Dinamo Bucarest | |
Girone C
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| 1ª giornata |
| AZ | 3-0 | Braga | |
| Liberec | 0-0 | Siviglia | |
| 2ª giornata |
| Braga | 4-0 | Liberec | |
| Grasshoppers | 2-5 | AZ | |
| 3ª giornata |
| Liberec | 4-1 | Grasshoppers | |
| Siviglia | 2-0 | Braga | |
| 4ª giornata |
| Grasshoppers | 0-4 | Siviglia | |
| AZ | 2-2 | Liberec | |
| 5ª giornata |
| Siviglia | 1-2 | AZ | |
| Braga | 2-0 | Grasshoppers | |
Girone D
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| 1ª giornata |
| Osasuna | 0-0 | Heerenveen | |
| Odense | 1-2 | Parma | |
| 2ª giornata |
| Heerenveen | 0-2 | Odense | |
| Lens | 3-1 | Osasuna | |
| 3ª giornata |
| Parma | 2-1 | Heerenveen | |
| Odense | 1-1 | Lens | |
| 4ª giornata |
| Lens | 1-2 | Parma | |
| Osasuna | 3-1 | Odense | |
| 5ª giornata |
| Parma | 0-3 | Osasuna | |
| Heerenveen | 1-0 | Lens | |
Girone E
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| 1ª giornata |
| Wisla Cracovia | 1-2 | Blackburn | |
| Basilea | 1-1 | Feyenoord | |
| 2ª giornata |
| Blackburn | 3-0 | Basilea | |
| Nancy | 2-1 | Wisla Cracovia | |
| 3ª giornata |
| Feyenoord | 0-0 | Blackburn | |
| Basilea | 2-2 | Nancy | |
| 4ª giornata |
| Nancy | 3-0 | Feyenoord | |
| Wisla Cracovia | 3-1 | Basilea | |
| 5ª giornata |
| Feyenoord | 3-1 | Wisla Cracovia | |
| Blackburn | 1-0 | Nancy | |
Girone F
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| 1ª giornata |
| Austria Vienna | 1-4 | Zulte Waregem | |
| Sparta Praga | 0-2 | Espanyol | |
| 2ª giornata |
| Zulte Waregem | 3-1 | Sparta Praga | |
| Ajax | 3-0 | Austria Vienna | |
| 3ª giornata |
| Sparta Praga | 0-0 | Ajax | |
| Espanyol | 6-2 | Zulte Waregem | |
| 4ª giornata |
| Ajax | 0-2 | Espanyol | |
| Austria Vienna | 0-1 | Sparta Praga | |
| 5ª giornata |
| Espanyol | 1-0 | Austria Vienna | |
| Zulte Waregem | 0-3 | Ajax | |
Girone G
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| 1ª giornata |
| Panathinaikos | 2-0 | Hapoel Tel Aviv | |
| Rapid Bucarest | 0-0 | PSG | |
| 2ª giornata |
| Hapoel Tel Aviv | 2-2 | Rapid Bucarest | |
| Mlada Boleslav | 0-1 | Panathinaikos | |
| 3ª giornata |
| Rapid Bucarest | 1-1 | Mlada Boleslav | |
| PSG | 2-4 | Hapoel Tel Aviv | |
| 4ª giornata |
| Mlada Boleslav | 0-0 | PSG | |
| Panathinaikos | 0-0 | Rapid Bucarest | |
| 5ª giornata |
| PSG | 4-0 | Panathinaikos | |
| Hapoel Tel Aviv | 1-1 | Mlada Boleslav | |
Girone H
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| 1ª giornata |
| Eintracht Francoforte | 1-2 | Palermo | |
| Newcastle | 1-0 | Fenerbahce | |
| 2ª giornata |
| Palermo | 0-1 | Newcastle | |
| Celta Vigo | 1-1 | Eintracht Francoforte | |
| 3ª giornata |
| Newcastle | 2-1 | Celta Vigo | |
| Fenerbahce | 3-0 | Palermo | |
| 4ª giornata |
| Celta Vigo | 1-0 | Fenerbahce | |
| Eintracht Francoforte | 0-0 | Newcastle | |
| 5ª giornata |
| Fenerbahce | 2-2 | Eintracht Francoforte | |
| Palermo | 1-1 | Celta Vigo | |
Sedicesimi di finale
Le partite di andata si sono disputate tra il 14 e il 15 febbraio, quelle di ritorno il 22 febbraio 2007.
Ottavi di finale
Le partite di andata si sono disputate l'8 marzo, quelle di ritorno il 15 marzo 2007.
Quarti di finale
Le partite di andata si sono disputate il 5 aprile, quelle di ritorno il 12 aprile 2007.
Semifinali
Le partite di andata si sono disputate il 26 aprile, quelle di ritorno il 3 maggio 2007.
Note
- ↑ Qualificato alla fase successiva ma escluso dalla competizione a causa degli incidenti occorsi in occasione della penultima partita della fase a gironi contro il Nancy. Nei sedicesimi di finale avrebbe dovuto incontrare il Tottenham che, vista l’esclusione degli olandesi, è passato in automatico agli ottavi di finale
- ↑ Partita d'andata giocata a porte chiuse a Livorno per decisione del Governo italiano dopo gli episodi di violenza di Catania-Palermo.
- ↑ Il 19 gennaio 2007 la UEFA ha annunciato l'esclusione del Feyenoord dalla competizione a causa degli incidenti occorsi in occasione della penultima partita della fase a gironi contro il Nancy. Il 25 gennaio la UEFA ha annunciato l'ammissione automatica del Tottenham al turno successivo. La decisione è stata confermata in appello dal TAS di Losanna.