TACK

TACK
Sulfolobus sp.
Sulfolobus sp.
Classificação científica
Domínio: Archaea
Reino: Proteoarchaeota
Superfilo: Grupo TACK
Guy & Ettema 2011
Filos
Sinónimos

TACK é um clado de organismos pertencntes ao domínio Archaea, cujo nome é um acrónimo para Thaumarchaeota (agora Nitrososphaerota), Aigarchaeota, Crenarchaeota (agora Thermoproteota) e Korarchaeota, os primeiros grupos de arqueias descobertos pertencntes ao clado. Estes microrganismos ocorrem em ambientes que variam de acidofílicos termófilos a mesófilos e psicrófilos e com diferentes tipos de metabolismo, embora predominantemente organismos anaeróbicos e quimiossintéticos.[3] TACK é um clado que é o grupo irmão do ramo Asgard que deu origem aos eucariontes. Foi proposto que o clado TACK seja classificado como Crenarchaeota e que o tradicional "Crenarchaeota" (Thermoproteota) seja classificado como uma classe chamada "Sulfolobia", em conjunto com os outros filos com nível taxonómico de classe.[4]

Classificação

  • Thermoproteota (anteriormente Crenarchaeota) — grupo mais conhecida de Archaea e o mais abundante nos ecossistemas marinhos. Foram anteriormente considerados de sulfobactérias por causa de sua dependência em relação ao enxofre e são importantes como fixadores de carbono. Existem espécies hipertermófilas em fontes hidrotermais, mas alguns grupos são os organismos mais abundantes em profundidades inferiores a 100 m.
  • "Aigarchaeota" — filo proposto a partir do genoma da espécie candidata Caldiaarchaeum, subterrânea, encontrada nas profundezas de uma mina de ouro no Japão. Sequências genómicas deste grupo também foram encontradas em ambientes geotérmicos, terrestres e marinhos.
  • "Geoarchaeota" — organismos termofílicos que vivem em ambientes ácidos reduzindo o ferro férrico. Alternativamente, foi proposto que este e o grupo anterior realmente pertencem ao filo Nitrososphaerota.
  • Nitrososphaerota (anteriormente Thaumarchaeota) — inclui organismos mesófilos ou psicrófilos (médias e baixas temperaturas), de metabolismo quimiolitoautotrófico oxidante de amónia (nitrificantes) que podem desempenhar um papel importante em ciclos bioquímicos, como os ciclos do azoto e do carbono.
  • "Bathyarchaeota" — abundante nos sedimentos do fundo do mar com escassez de nutrientes. Pelo menos algumas linhagens apresentam homoacetogénese, um tipo de metabolismo até então considerado exclusivo das bactérias.
  • "Korarchaeota" — encontrados em ambientes hidrotermais e em baixa abundância, parecem diversificados em diferentes níveis filogenéticos de acordo com a temperatura, salinidade (água doce ou marinha) e geografia.

Filogenia

Os dados disponíveis permitrm construir os seguintes cladogramas:

McKay et al. 2019[5] com base em 16S rRNA LTP_06_2022[6][7][8] 53 marcadores proteicos de GTDB 08-RS214[9][10][11]
"TACK"
 
 

"Korarchaeota"

 
 
 

"Bathyarchaeota"

 
 
 

"Aigarchaeota"

 
 

Nitrososphaerota

 
 
 
 
 
 

"Verstraetearchaeota"

 
 
 

Thermoproteota

 
 
 

"Geoarchaeota"

 
 

"Marsarchaeota"

 
 
 
 
 
"TACK"
Nitrososphaerota
Conexivisphaeria

Conexivisphaerales

 
Nitrososphaeria
 

Nitrososphaerales

 
 

Nitrosopumilales

 
 
 
Thermoproteota
Thermoproteia
 

Thermoproteales

 
 
 
 

Fervidicoccales

 
 

Desulfurococcales 2

 
 
 
 

Desulfurococcales

 
 

Sulfolobales

 
 
 
 
 
 
"TACK"
 
"Korarchaeia"

"Korarchaeales"

 
 
 
"BAT"
 

"Bathyarchaeia" (MCG)

 
 
Nitrososphaeria_A

"Caldarchaeales"

("Aigarchaeota")
Nitrososphaeria
 

"Geothermarchaeales"

 
 
 

Conexivisphaerales

 
 

Nitrososphaerales
(Thaumarchaeota)

 
 
 
 
 
"Sulfobacteria"
 
"Methanomethylicia"
 

"Methanomethylicales"

 
 

"Nezhaarchaeales"

 
("Verstraetearchaeota")
"Thermoproteia"
 

"Gearchaeales"

 
 
 

"Thermofilales"

 
 

Thermoproteales

 
 
 
 
 
"Sulfolobia"
 

"Marsarchaeales"

 
 

Sulfolobales

 
 
 
 
 
Thermoproteota

Hipótese eócita

A hipótese do eócito proposta na década de 1980 por James Lake sugere que os eucariotas emergiram dentro dos eócitos procarióticos.[12] Neste contexto, uma evidência que suporta uma estreita relação entre TACK e eucariotas é a presença de um homólogo da RNA polimerase subunidade Rbp-8 em Thermoproteota, mas não em Euryarchaea.[13]

Hipótese eócita.[14]

Ver também

Referências

  1. ↑ Lake, J.A.; Henderson, E.; Oakes, M. (Clark, M.W.) (1984). «Eocytes: A new ribosome structure indicates a kingdom with a close relationship to eukaryotes». PNAS. 81 (12): 3786–3790. PMC 345305Acessível livremente. PMID 6587394. doi:10.1073/pnas.81.12.3786Acessível livremente
  2. ↑ Lake, J.A. (2015). «Eukaryotic origins». Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 370 (1678). 20140321 páginas. PMC 4571561Acessível livremente. PMID 26323753. doi:10.1098/rstb.2014.0321
  3. ↑ Guy, Lionel; Ettema, Thijs J.G. (2011). «The archaeal 'TACK' superphylum and the origin of eukaryotes». Trends in Microbiology. 19 (12): 580–587. doi:10.1016/j.tim.2011.09.002
  4. ↑ Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E-Yung (2020). «Multidomain ribosomal protein trees and the planctobacterial origin of neomura (Eukaryotes, archaebacteria)». Protoplasma. 257 (3): 621–753. PMC 7203096Acessível livremente. PMID 31900730. doi:10.1007/s00709-019-01442-7
  5. ↑ McKay, L.J., Dlakić, M., Fields, M.W. et al. Co-occurring genomic capacity for anaerobic methane and dissimilatory sulfur metabolisms discovered in the Korarchaeota. Nat Microbiol 4, 614–622 (2019) doi:10.1038/s41564-019-0362-4
  6. ↑ «The LTP». The All-Species Living Tree Project. Consultado em 10 Maio 2023
  7. ↑ «LTP_all tree in newick format». The All-Species Living Tree Project. Consultado em 10 Maio 2023
  8. ↑ «LTP_06_2022 Release Notes» (PDF). The All-Species Living Tree Project. Consultado em 10 Maio 2023
  9. ↑ «GTDB release 08-RS214». Genome Taxonomy Database. Consultado em 10 Maio 2023
  10. ↑ «ar53_r214.sp_label». Genome Taxonomy Database. Consultado em 10 Maio 2023
  11. ↑ «Taxon History». Genome Taxonomy Database. Consultado em 10 Maio 2023
  12. ↑ (UCLA) The origin of the nucleus and the tree of life Arquivado em 2003-02-07 na Archive.today
  13. ↑ Kwapisz, M.; Beckouët, F.; Thuriaux, P. (2008). «Early evolution of eukaryotic DNA-dependent RNA polymerases». Trends Genet. 24 (5): 211–5. PMID 18384908. doi:10.1016/j.tig.2008.02.002
  14. ↑ Cox, C. J.; Foster, P. G.; Hirt, R. P.; Harris, S. R.; Embley, T. M. (2008). «The archaebacterial origin of eukaryotes». Proc Natl Acad Sci USA. 105 (51): 20356–61. Bibcode:2008PNAS..10520356C. PMC 2629343Acessível livremente. PMID 19073919. doi:10.1073/pnas.0810647105Acessível livremente