Virus Playa de Oro

Virus Playa de Oro
Taxonomía
Reino: Riboviria
Filo: Negarnaviricota
Clase: Bunyaviricetes
Orden: Eliovirales
Familia: Hantaviridae
Género: Orthohantavirus
Especie: Incertae sedis
Clasificación de Baltimore

El virus Playa de Oro (OROV por sus siglas en inglés) es una probable especie de orthohantavirus encontrada en los roedores Oryzomys couesi y Sigmodon mascotensis en el estado mexicano de Colima. Se cree que el primero es el principal huésped. Se han determinado las secuencias de partes del genoma basado en ARN del virus; difieren en un 7-10 % en composición de aminoácidos y un 22-24 % en composición de nucleótidos con respecto a virus estrechamente relacionados.

El virus Playa de Oro fue identificado como una nueva especie en 2008 y está más estrechamente relacionado con el virus Bayou, el virus Catacamas, el virus Muleshoe y el virus Black Creek Canal, encontrados en otras especies de Oryzomys y Sigmodon. El virus Catacamas se encuentra en una población diferente de Oryzomys couesi, y la presencia de virus diferentes en estas dos especies se ha utilizado como argumento para clasificar las dos poblaciones del huésped como especies separadas.

Historia y distribución

El virus Playa de Oro fue identificado por primera vez en roedores recolectados en 2004 como parte de un estudio de mamíferos silvestres en Playa de Oro, en Manzanillo, Colima, oeste de México. El descubrimiento fue publicado en 2008 por Yong-Kyu Chu y colegas.[1] Entre 600 pequeños mamíferos, se encontraron anticuerpos contra el hantavirus virus Sin Nombre en 23 individuos (de 358 estudiados) de Oryzomys couesi, una rata arrocera que fue la especie más común encontrada, seis (de 87) de la rata algodonera Sigmodon mascotensis y uno (de 77) del ratón pigmeo Baiomys musculus. Además, doce O. couesi y un S. mascotensis produjeron ARN de hantavirus. Los virus se encontraron con mayor frecuencia en machos que en hembras.[2] Dado que las secuencias de aminoácidos en las partes secuenciadas del genoma del virus diferían hasta en un 7 a 10 % de los hantavirus estrechamente relacionados, Chu y colegas identificaron el virus encontrado en Playa de Oro como una nueva especie, llamada virus Playa de Oro o OROV. Aunque los autores no pudieron probar que el virus cumplía todos los criterios para identificar una nueva especie de virus, argumentaron que era probable que sí los cumpliera.[3] Actualmente se trata como una especie probable en el género Hantavirus.[4]

Virología

Los hantavirus tienen un genoma que consta de tres segmentos de ARN monocatenario de sentido negativo (véase Virus ARN: Replicación), denominados segmentos grande (L), mediano (M) y pequeño (S).[2] Se han secuenciado el segmento S completo y un fragmento del segmento M.[5]

El segmento S consta de 1953 bases, de las cuales 1287 (a partir de la posición 43) codifican la proteína de la nucleocápside. Además, un segundo marco abierto de lectura de 192 bases ocurre en el medio de esta secuencia (a partir de la posición 122), como en varios otros hantavirus. Entre tres especímenes de O. couesi, la secuencia en este segmento difería solo en un 1 %, y todos los cambios eran mutación silenciosas. Los aminoácidos del segmento S difieren en un 7 a 10 % de los del hantavirus relacionado virus Bayou (BAYV; de la rata arrocera de pantano, Oryzomys palustris), virus Catacamas (CATV; de una población de Oryzomys couesi en Honduras) y virus Black Creek Canal (BCCV; de la rata algodonera hispida, Sigmodon hispidus). La secuencia de nucleótidos difiere en un 24 % de esos virus.[5]

Entre fragmentos de 1537 bases de la secuencia del segmento M, se observaron varios sitios variables, incluidos algunos con mutaciones no silenciosas. La secuencia difiere en un 8 a 10 % de BAYV, CATV y BCCV en términos de aminoácidos y en un 22 % en términos de nucleótidos.[5]

Epidemiología y efectos

Dado que OROV ocurre con frecuencia en Oryzomys couesi, Chu y colegas sugirieron que es el huésped primario del virus y que las infecciones en Sigmodon mascotensis son el resultado de un derrame entre estas dos especies de roedores, que ocurren juntas de cerca.[6] El síndrome pulmonar por hantavirus, la enfermedad causada por hantavirus como el virus Sin Nombre, nunca se ha reportado en México, pero se han encontrado anticuerpos contra hantavirus en muestras de sangre humana en Yucatán y se sabe que varios roedores silvestres son reservorios de especies de hantavirus.[7] Por lo tanto, existe un riesgo potencial de infección por OROV en humanos.[8] Antes del descubrimiento de OROV, se había identificado una especie de hantavirus en México: el virus El Moro Canyon del pequeño roedor Reithrodontomys megalotis.[9]

Relaciones

Según análisis filogenéticos basados en las secuencias de los segmentos S y M, OROV está más estrechamente relacionado con el clado formado por BAYV, CATV, BCCV y virus Muleshoe (MUL; de la rata algodonera hispida).[10] En 2009, Piet Maes y colegas propusieron que los estrechamente relacionados BAYV, BCCV y MUL se unieran en una sola especie.[11] Chu y colegas se sorprendieron al encontrar que la misma especie, Oryzomys couesi, albergaba virus diferentes (OROV y CATV), aunque notaron que las subespecies infectadas por los dos virus eran diferentes.[12] En 2010, Delton Hanson y colegas sugirieron, sobre la base de varias líneas de evidencia, incluida la presencia de diferentes hantavirus, que las poblaciones de Oryzomys couesi del oeste de México representan una especie diferente, Oryzomys mexicanus.[13]

Referencias

  1. ↑ Chu et al., 2008, pp. 180-181.
  2. 1 2 Chu et al., 2008, p. 182.
  3. ↑ Chu et al., 2008, pp. 186-187.
  4. ↑ Mahy, 2009, p. 373.
  5. 1 2 3 Chu et al., 2008, p. 183.
  6. ↑ Chu et al., 2008, p. 186.
  7. ↑ Chu et al., 2008, pp. 180, 185-186.
  8. ↑ Chu et al., 2008, p. 187.
  9. ↑ Chu et al., 2008, p. 180.
  10. ↑ Chu et al., 2008, fig. 1.
  11. ↑ Maes et al., 2009, tabla 1.
  12. ↑ Chu et al., 2008, p. 181.
  13. ↑ Hanson et al., 2010, pp. 342-343.

Bibliografía

  • Chu, Y.-K.; Owen, R.D.; Sánchez-Hernández, C.; Romero-Almaraz, M.D.L.; Jonsson, C.B. (2008). «Genetic characterization and phylogeny of a hantavirus from Western Mexico». Virus Research (en inglés) 131 (2): 180-188. PMID 17963942. doi:10.1016/j.virusres.2007.09.007. 
  • Hanson, J.D.; Indorf, J.L.; Swier, V.J.; Bradley, R.D. (2010). «Molecular divergence within the Oryzomys palustris complex: evidence for multiple species». Journal of Mammalogy (en inglés) 91 (2): 336-347. doi:10.1644/08-MAMM-A-342.1. 
  • Maes, P.; Klempa, B.; Clement, J.; Matthijnssens, J.; Gajdusek, D.C.; Krüger, D.H.; Van Ranst, M. (2009). «A proposal for new criteria for the classification of hantaviruses, based on S and M segment protein sequences». Infection, Genetics and Evolution (en inglés) 9 (5): 813-820. Bibcode:2009InfGE...9..813M. PMID 19393771. doi:10.1016/j.meegid.2009.04.012. 
  • Mahy, B.W.J. (2009). The Dictionary of Virology (en inglés) (4º edición). Prensa Académica. p. 510. ISBN 978-0-12-373732-8. 
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