ABCB9

ABCB9
Ідентифікатори
Символи	ABCB9, EST122234, TAPL, ATP binding cassette subfamily B member 9
Зовнішні ІД	OMIM: 605453 MGI: 1861729 HomoloGene: 10491 GeneCards: ABCB9
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • ATPase activity; • protein homodimerization activity; • GO:0022891 трансмембранна транспортна активність; • ABC-type oligopeptide transporter activity; • ATP binding; • ABC-type peptide transporter activity; • ATPase-coupled transmembrane transporter activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • peptide transmembrane transporter activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • early endosome; • мембрана; • integral component of endoplasmic reticulum membrane; • ендоплазматичний ретикулум; • лізосома; • lysosomal membrane; • внутрішньоклітинна мембранна органела;
Біологічний процес	• трансмембранний транспорт; • peptide transport; • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I; • protein transport; • oligopeptide transmembrane transport; • GO:0015915 транспорт;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	23457
	56325
	ENSG00000150967
	ENSMUSG00000029408
	Q9NP78
	Q9JJ59
NM_001243013; NM_001243014; NM_019624; NM_019625; NM_203444;
	NM_203445
	NM_019875
	NP_001229942; NP_001229943; NP_062570; NP_062571; NP_982269
	NP_063928
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ABCB9 (англ. ATP binding cassette subfamily B member 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 766 амінокислот, а молекулярна маса — 84 475^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRLWKAVVVT	LAFMSVDICV	TTAIYVFSHL	DRSLLEDIRH	FNIFDSVLDL
WAACLYRSCL	LLGATIGVAK	NSALGPRRLR	ASWLVITLVC	LFVGIYAMVK
LLLFSEVRRP	IRDPWFWALF	VWTYISLGAS	FLLWWLLSTV	RPGTQALEPG
AATEAEGFPG	SGRPPPEQAS	GATLQKLLSY	TKPDVAFLVA	ASFFLIVAAL
GETFLPYYTG	RAIDGIVIQK	SMDQFSTAVV	IVCLLAIGSS	FAAGIRGGIF
TLIFARLNIR	LRNCLFRSLV	SQETSFFDEN	RTGDLISRLT	SDTTMVSDLV
SQNINVFLRN	TVKVTGVVVF	MFSLSWQLSL	VTFMGFPIIM	MVSNIYGKYY
KRLSKEVQNA	LARASNTAEE	TISAMKTVRS	FANEEEEAEV	YLRKLQQVYK
LNRKEAAAYM	YYVWGSGLTL	LVVQVSILYY	GGHLVISGQM	TSGNLIAFII
YEFVLGDCME	SVGSVYSGLM	QGVGAAEKVF	EFIDRQPTMV	HDGSLAPDHL
EGRVDFENVT	FTYRTRPHTQ	VLQNVSFSLS	PGKVTALVGP	SGSGKSSCVN
ILENFYPLEG	GRVLLDGKPI	SAYDHKYLHR	VISLVSQEPV	LFARSITDNI
SYGLPTVPFE	MVVEAAQKAN	AHGFIMELQD	GYSTETGEKG	AQLSGGQKQR
VAMARALVRN	PPVLILDEAT	SALDAESEYL	IQQAIHGNLQ	KHTVLIIAHR
LSTVEHAHLI	VVLDKGRVVQ	QGTHQQLLAQ	GGLYAKLVQR	QMLGLQPAAD
FTAGHNEPVA	NGSHKA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані, лізосомі.

Література

Kobayashi A., Hori S., Suita N., Maeda M. (2003). Gene organization of human transporter associated with antigen processing-like (TAPL, ABCB9): analysis of alternative splicing variants and promoter activity. Biochem. Biophys. Res. Commun. 309: 815—822. PMID 13679046 doi:10.1016/j.bbrc.2003.08.081
Homma K., Kikuno R.F., Nagase T., Ohara O., Nishikawa K. (2004). Alternative splice variants encoding unstable protein domains exist in the human brain. J. Mol. Biol. 343: 1207—1220. PMID 15491607 doi:10.1016/j.jmb.2004.09.028
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 doi:10.1093/dnares/7.2.143
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Kobayashi A., Maeda T., Maeda M. (2004). Membrane localization of transporter associated with antigen processing (TAP)-like (ABCB9) visualized in vivo with a fluorescence protein-fusion technique. Biol. Pharm. Bull. 27: 1916—1922. PMID 15577206 doi:10.1248/bpb.27.1916
Wolters J.C., Abele R., Tampe R. (2005). Selective and ATP-dependent translocation of peptides by the homodimeric ATP binding cassette transporter TAP-like (ABCB9). J. Biol. Chem. 280: 23631—23636. PMID 15863492 doi:10.1074/jbc.M503231200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:50 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9NP78 (англ.) . Архів оригіналу за 2 лютого 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:50 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9NP78 (англ.) . Архів оригіналу за 2 лютого 2018. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]