ABL1

ABL1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи ABL1, ABL proto-oncogene 1, non-receptor tyrosine kinase, ABL, JTK7, bcr/abl, c-ABL, c-p150, v-abl, CHDSKM, BCR-ABL, Genes, abl
Зовнішні ІД OMIM: 189980 MGI: 87859 HomoloGene: 3783 GeneCards: ABL1
шифр КФ 2.7.10.2
Пов'язані генетичні захворювання
lymphoblastic leukemia, Філадельфійська хромосома[1]
Реагує на сполуку
bafetinib, бозутиніб, Дазатиніб, іматиніб, нілотиніб, ponatinib, saracatinib, іматиніб, ponatinib, saracatinib, rebastinib, umbralisib, imatinib mesylate[2]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
25
11350
Ensembl
ENSG00000097007
ENSMUSG00000026842
UniProt
P00519
P00520
RefSeq (мРНК)
NM_007313
NM_005157
NM_001112703
NM_009594
NM_001283045
NM_001283046
NM_001283047
RefSeq (білок)
NP_005148
NP_009297
NP_001106174
NP_001269974
NP_001269975
NP_001269976
NP_033724
Локус (UCSC) Хр. 9: 130.71 – 130.89 Mb Хр. 2: 31.58 – 31.69 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ABL1 (англ. ABL proto-oncogene 1, non-receptor tyrosine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 130 амінокислот, а молекулярна маса — 122 873[6].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MLEICLKLVG CKSKKGLSSS SSCYLEEALQ RPVASDFEPQ GLSEAARWNS
KENLLAGPSE NDPNLFVALY DFVASGDNTL SITKGEKLRV LGYNHNGEWC
EAQTKNGQGW VPSNYITPVN SLEKHSWYHG PVSRNAAEYL LSSGINGSFL
VRESESSPGQ RSISLRYEGR VYHYRINTAS DGKLYVSSES RFNTLAELVH
HHSTVADGLI TTLHYPAPKR NKPTVYGVSP NYDKWEMERT DITMKHKLGG
GQYGEVYEGV WKKYSLTVAV KTLKEDTMEV EEFLKEAAVM KEIKHPNLVQ
LLGVCTREPP FYIITEFMTY GNLLDYLREC NRQEVNAVVL LYMATQISSA
MEYLEKKNFI HRDLAARNCL VGENHLVKVA DFGLSRLMTG DTYTAHAGAK
FPIKWTAPES LAYNKFSIKS DVWAFGVLLW EIATYGMSPY PGIDLSQVYE
LLEKDYRMER PEGCPEKVYE LMRACWQWNP SDRPSFAEIH QAFETMFQES
SISDEVEKEL GKQGVRGAVS TLLQAPELPT KTRTSRRAAE HRDTTDVPEM
PHSKGQGESD PLDHEPAVSP LLPRKERGPP EGGLNEDERL LPKDKKTNLF
SALIKKKKKT APTPPKRSSS FREMDGQPER RGAGEEEGRD ISNGALAFTP
LDTADPAKSP KPSNGAGVPN GALRESGGSG FRSPHLWKKS STLTSSRLAT
GEEEGGGSSS KRFLRSCSAS CVPHGAKDTE WRSVTLPRDL QSTGRQFDSS
TFGGHKSEKP ALPRKRAGEN RSDQVTRGTV TPPPRLVKKN EEAADEVFKD
IMESSPGSSP PNLTPKPLRR QVTVAPASGL PHKEEAGKGS ALGTPAAAEP
VTPTSKAGSG APGGTSKGPA EESRVRRHKH SSESPGRDKG KLSRLKPAPP
PPPAASAGKA GGKPSQSPSQ EAAGEAVLGA KTKATSLVDA VNSDAAKPSQ
PGEGLKKPVL PATPKPQSAK PSGTPISPAP VPSTLPSASS ALAGDQPSST
AFIPLISTRV SLRKTRQPPE RIASGAITKG VVLDSTEALC LAISRNSEQM
ASHSAVLEAG KNLYTFCVSY VDSIQQMRNK FAFREAINKL ENNLRELQIC
PATAGSGPAA TQDFSKLLSS VKEISDIVQR

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, клітинна адгезія, пошкодження ДНК, репарація ДНК, ендоцитоз, автофагія, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, ДНК, іоном магнію, іоном марганцю. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, мітохондрії.

Література

  • Shtivelman E., Lifshitz B., Gale R.P., Roe B.A., Canaani E. (1986). Alternative splicing of RNAs transcribed from the human abl gene and from the bcr-abl fused gene. Cell. 47: 277—284. PMID 3021337 doi:10.1016/0092-8674(86)90450-2
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Groffen J., Heisterkamp N., Reynolds F.H. Jr., Stephenson J.R. (1983). Homology between phosphotyrosine acceptor site of human c-abl and viral oncogene products. Nature. 304: 167—169. PMID 6191223 doi:10.1038/304167a0
  • Kipreos E.T., Wang J.Y. (1990). Differential phosphorylation of c-Abl in cell cycle determined by cdc2 kinase and phosphatase activity. Science. 248: 217—220. PMID 2183353 doi:10.1126/science.2183353
  • Agami R., Blandino G., Oren M., Shaul Y. (1999). Interaction of c-Abl and p73alpha and their collaboration to induce apoptosis. Nature. 399: 809—813. PMID 10391250 doi:10.1038/21697
  • Wang J.Y. (2000). Regulation of cell death by the Abl tyrosine kinase. Oncogene. 19: 5643—5650. PMID 11114745 doi:10.1038/sj.onc.1203878

Примітки

Див. також