ARAP3

ARAP3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2KG5, 2LNW, 5JD0, 5JCP
Ідентифікатори
Символи	ARAP3, CENTD3, DRAG1, ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 3
Зовнішні ІД	OMIM: 606647 MGI: 2147274 HomoloGene: 11199 GeneCards: ARAP3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• зв’язування з іоном металу; • phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity; • phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • cell projection; • мембрана; • клітинна мембрана; • цитоскелет; • lamellipodium; • ruffle; • цитоплазма;
Біологічний процес	• GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • negative regulation of Rac protein signal transduction; • cytoskeleton organization; • regulation of small GTPase mediated signal transduction; • vesicle-mediated transport; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • negative regulation of cell migration; • negative regulation of Rho protein signal transduction; • regulation of cell shape;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	64411
	106952
	ENSG00000120318
	ENSMUSG00000024451
	Q8WWN8
	Q8R5G7
	NM_022481
	NM_001205336; NM_139206
	NP_071926
	NP_001192265; NP_631945
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ARAP3 (англ. ArfGAP with RhoGAP domain, ankyrin repeat and PH domain 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 544 амінокислот, а молекулярна маса — 169 844^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAPQDLDIA	VWLATVHLEQ	YADTFRRHGL	ATAGAARGLG	HEELKQLGIS
ATGHRKRILR	LLQTGTEEGS	LDPKSDSAME	PSPSPAPQAQ	PPKPVPKPRT
VFGGLSGPAT	TQRPGLSPAL	GGPGVSRSPE	PSPRPPPLPT	SSSEQSSALN
TVEMMPNSIY	FGLDSRGRAQ	AAQDKAPDSS	QISAPTPALR	PTTGTVHIMD
PGCLYYGVQP	VGTPGAPDRR	ESRGVCQGRA	EHRLSRQDLE	AREDAGYASL
ELPGDSTLLS	PTLETEETSD	DLISPYASFS	FTADRLTPLL	SGWLDKLSPQ
GNYVFQRRFV	QFNGRSLMYF	GSDKDPFPKG	VIPLTAIEMT	RSSKDNKFQV
ITGQRVFVFR	TESEAQRDMW	CSTLQSCLKE	QRLLGHPRPP	QPPRPLRTGM
LELRGHKAKV	FAALSPGELA	LYKSEQAFSL	GIGICFIELQ	GCSVRETKSR
SFDLLTPHRC	FSFTAESGGA	RQSWAAALQE	AVTETLSDYE	VAEKIWSNRA
NRQCADCGSS	RPDWAAVNLG	VVICKQCAGQ	HRALGSGISK	VQSLKLDTSV
WSNEIVQLFI	VLGNDRANRF	WAGTLPPGEG	LHPDATPGPR	GEFISRKYRL
GLFRKPHPQY	PDHSQLLQAL	CAAVARPNLL	KNMTQLLCVE	AFEGEEPWFP
PAPDGSCPGL	LPSDPSPGVY	NEVVVRATYS	GFLYCSPVSN	KAGPSPPRRG
RDAPPRLWCV	LGAALEMFAS	ENSPEPLSLI	QPQDIVCLGV	SPPPTDPGDR
FPFSFELILA	GGRIQHFGTD	GADSLEAWTS	AVGKWFSPLS	CHQLLGPGLL
RLGRLWLRSP	SHTAPAPGLW	LSGFGLLRGD	HLFLCSAPGP	GPPAPEDMVH
LRRLQEISVV	SAADTPDKKE	HLVLVETGRT	LYLQGEGRLD	FTAWNAAIGG
AAGGGGTGLQ	EQQMSRGDIP	IIVDACISFV	TQHGLRLEGV	YRKGGARARS
LRLLAEFRRD	ARSVKLRPGE	HFVEDVTDTL	KRFFRELDDP	VTSARLLPRW
REAAELPQKN	QRLEKYKDVI	GCLPRVNRRT	LATLIGHLYR	VQKCAALNQM
CTRNLALLFA	PSVFQTDGRG	EHEVRVLQEL	IDGYISVFDI	DSDQVAQIDL
EVSLITTWKD	VQLSQAGDLI	MEVYIEQQLP	DNCVTLKVSP	TLTAEELTNQ
VLEMRGTAAG	MDLWVTFEIR	EHGELERPLH	PKEKVLEQAL	QWCQLPEPCS
ASLLLKKVPL	AQAGCLFTGI	RRESPRVGLL	RCREEPPRLL	GSRFQERFFL
LRGRCLLLLK	EKKSSKPERE	WPLEGAKVYL	GIRKKLKPPT	PWGFTLILEK
MHLYLSCTDE	DEMWDWTTSI	LKAQHDDQQP	VVLRRHSSSD	LARQKFGTMP
LLPIRGDDSG	ATLLSANQTL	RRLHNRRTLS	MFFPMKSSQG	SVEEQEELEE
PVYEEPVYEE	VGAFPELIQD	TSTSFSTTRE	WTVKPENPLT	SQKSLDQPFL
SKSSTLGQEE	RPPEPPPGPP	SKSSPQARGS	LEEQLLQELS	SLILRKGETT
AGLGSPSQPS	SPQSPSPTGL	PTQTPGFPTQ	PPCTSSPPSS	QPLT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках.

Література

Santy L.C., Casanova J.E. (2002). GTPase signaling: bridging the GAP between ARF and Rho. Curr. Biol. 12: R360—R362. PMID 12015138 doi:10.1016/S0960-9822(02)00860-6
Lu Q., Wei W., Kowalski P.E., Chang A.C.Y., Cohen S.N. (2004). EST-based genome-wide gene inactivation identifies ARAP3 as a host protein affecting cellular susceptibility to anthrax toxin. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 17246—17251. PMID 15569923 doi:10.1073/pnas.0407794101
Leone M., Cellitti J., Pellecchia M. (2009). The Sam domain of the lipid phosphatase Ship2 adopts a common model to interact with Arap3-Sam and EphA2-Sam. BMC Struct. Biol. 9: 59—59. PMID 19765305 doi:10.1186/1472-6807-9-59

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24097 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8WWN8 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 5

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:24097 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q8WWN8 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]