CYP2D6

CYP2D6
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2F9Q, 3QM4, 3TBG, 3TDA, 4WNT, 4WNU, 4WNV, 4WNW, 4XRY, 4XRZ
Ідентифікатори
Символи	CYP2D6, CPD6, CYP2D, CYP2D7AP, CYP2D7BP, CYP2D7P2, CYP2D8P2, CYP2DL1, CYPIID6, P450-DB1, P450C2D, P450DB1, cytochrome P450 family 2 subfamily D member 6, Cytochrome P450 2D6
Зовнішні ІД	OMIM: 124030 HomoloGene: 133550 GeneCards: CYP2D6
Реагує на сполуку
	raubasine
Онтологія гена
Молекулярна функція	• iron ion binding; • зв’язування з іоном металу; • heme binding; • GO:0050602 oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen; • oxidoreductase activity; • aromatase activity; • oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen, reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen; • steroid hydroxylase activity; • monooxygenase activity;
Клітинна компонента	• organelle membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • мембрана; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • ендоплазматичний ретикулум; • мітохондрія; • цитоплазма;
Біологічний процес	• steroid metabolic process; • alkaloid metabolic process; • coumarin metabolic process; • Обмін жирів; • isoquinoline alkaloid metabolic process; • GO:1900774, GO:1900783, GO:1900795, GO:1901084, GO:1900780, GO:1900777, GO:1900771, GO:1901014, GO:1902180, GO:1900987, GO:1900990 alkaloid catabolic process; • oxidative demethylation; • heterocycle metabolic process; • negative regulation of binding; • monoterpenoid metabolic process; • ксенобіотичний метаболізм; • arachidonic acid metabolic process; • negative regulation of cellular organofluorine metabolic process; • long-chain fatty acid biosynthetic process; • процес метаболізму органічних кислот;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	1565
	24303
ENSG00000100197; ENSG00000275211; ENSG00000280905; ENSG00000282966; ENSG00000283284;
	ENSG00000272532
	ENSRNOG00000029179
	P10635
	P12938
	NM_000106; NM_001025161
	NM_173093
	NP_000097; NP_001020332
	NP_775116
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CYP2D6 (англ. Cytochrome P450 family 2 subfamily D member 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 22-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 497 амінокислот, а молекулярна маса — 55 769^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGLEALVPLA	VIVAIFLLLV	DLMHRRQRWA	ARYPPGPLPL	PGLGNLLHVD
FQNTPYCFDQ	LRRRFGDVFS	LQLAWTPVVV	LNGLAAVREA	LVTHGEDTAD
RPPVPITQIL	GFGPRSQGVF	LARYGPAWRE	QRRFSVSTLR	NLGLGKKSLE
QWVTEEAACL	CAAFANHSGR	PFRPNGLLDK	AVSNVIASLT	CGRRFEYDDP
RFLRLLDLAQ	EGLKEESGFL	REVLNAVPVL	LHIPALAGKV	LRFQKAFLTQ
LDELLTEHRM	TWDPAQPPRD	LTEAFLAEME	KAKGNPESSF	NDENLRIVVA
DLFSAGMVTT	STTLAWGLLL	MILHPDVQRR	VQQEIDDVIG	QVRRPEMGDQ
AHMPYTTAVI	HEVQRFGDIV	PLGVTHMTSR	DIEVQGFRIP	KGTTLITNLS
SVLKDEAVWE	KPFRFHPEHF	LDAQGHFVKP	EAFLPFSAGR	RACLGEPLAR
MELFLFFTSL	LQHFSFSVPT	GQPRPSHHGV	FAFLVSPSPY	ELCAVPR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як метаболізм ліпідів, метаболізм стероїдів, метаболізм стеролів, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза, гемом. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, мікросомах.

Також відомий як дебризохінгідроксилаза (названий на честь препарату, який призвів до відкриття), CYP2D6 є найбільш відомим і вивченим геном надродини CYP. Цей ген викликає великий інтерес також завдяки своїй високополіморфній природі, а також через те, що бере участь у метаболічному перетворенні великої кількості лікарських речовин.

Приклади лікарських препаратів, які може метаболізувати цитохром CYP2D6
CYP2D6	Метопролол, пропранолол, кодеїн, декстрометорфан, клозапін, дезипрамін, галоперидол, амітриптилін, іміпрамін

Відомо понад 100 генетичних варіантів CYP2D6, зокрема поліморфізми rs35742686, rs3892097, rs5030655. Використовують також таку номенклатуру поліморфізмів: алелі *1, *3, *4, *5, *6, *1xN (мутації, що призводять до зміни активності ферменту). Алель *1 вважається нормою.

Ген кодує цитохром Р450 2D6, монооксигеназу печінки, є ферментом першої фази детоксикації ксенобіотиків і відповідає за метаболізм 20% ліків, зокрема протиаритмічних, антигіпертензивних і психотропних препаратів, а також бере участь в синтезі холестеролу й інших ліпідів.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Evert B., Griese E.U., Eichelbaum M. (1994). A missense mutation in exon 6 of the CYP2D6 gene leading to a histidine 324 to proline exchange is associated with the poor metabolizer phenotype of sparteine. Naunyn Schmiedebergs Arch. Pharmacol. 350: 434—439. PMID 7845481 doi:10.1007/BF00178963
Daly A.K., Leathart J.B., London S.J., Idle J.R. (1995). An inactive cytochrome P450 CYP2D6 allele containing a deletion and a base substitution. Hum. Genet. 95: 337—341. PMID 7868129 doi:10.1007/BF00225204
Masimirembwa C., Persson I., Bertilsson L., Hasler J., Ingelman-Sundberg M. (1996). A novel mutant variant of the CYP2D6 gene (CYP2D6*17) common in a black African population: association with diminished debrisoquine hydroxylase activity. Br. J. Clin. Pharmacol. 42: 713—719. PMID 8971426 doi:10.1046/j.1365-2125.1996.00489.x
Kimura S., Umeno M., Skoda R.C., Meyer U.A., Gonzalez F.J. (1989). The human debrisoquine 4-hydroxylase (CYP2D) locus: sequence and identification of the polymorphic CYP2D6 gene, a related gene, and a pseudogene. Am. J. Hum. Genet. 45: 889—904. PMID 2574001
Wang S.L., Lai M.D., Huang J.D. (1999). G169R mutation diminishes the metabolic activity of CYP2D6 in Chinese. Drug Metab. Dispos. 27: 385—388. PMID 10064570

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з CYP2D6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2625 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P10635 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 22

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з CYP2D6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2625 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, P10635 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]