DSCAML1

DSCAML1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1VA9
Ідентифікатори
Символи	DSCAML1, Dscaml1, 4921507G06Rik, 4930435C18Rik, BB239540, mKIAA1132, DSCAM2, DS cell adhesion molecule like 1
Зовнішні ІД	OMIM: 611782 MGI: 2150309 HomoloGene: 79549 GeneCards: DSCAML1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • cell-cell adhesion mediator activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • cell surface; • міжклітинні контакти; • клітинна мембрана; • синапс; • мембрана; • міжклітинний простір; • аксон;
Біологічний процес	• embryonic skeletal system morphogenesis; • Детермінація; • central nervous system development; • brain development; • адгезія клітин; • dorsal/ventral pattern formation; • аксоноґенеза; • нейробіологія розвитку; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • axon guidance; • dendrite self-avoidance;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	57453
	114873
	ENSG00000177103
	ENSMUSG00000032087
	Q8TD84
	Q4VA61
	NM_020693; NM_001367904; NM_001367905
	NM_001081270; NM_029039
	NP_065744; NP_001354833; NP_001354834
	NP_001074739
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DSCAML1 (англ. DS cell adhesion molecule like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 053 амінокислот, а молекулярна маса — 224 463^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWLVTFLLLL	DSLHKARPED	VGTSLYFVND	SLQQVTFSSS	VGVVVPCPAA
GSPSAALRWY	LATGDDIYDV	PHIRHVHANG	TLQLYPFSPS	AFNSFIHDND
YFCTAENAAG	KIRSPNIRVK	AVFREPYTVR	VEDQRSMRGN	VAVFKCLIPS
SVQEYVSVVS	WEKDTVSIIP	EHRFFITYHG	GLYISDVQKE	DALSTYRCIT
KHKYSGETRQ	SNGARLSVTD	PAESIPTILD	GFHSQEVWAG	HTVELPCTAS
GYPIPAIRWL	KDGRPLPADS	RWTKRITGLT	ISDLRTEDSG	TYICEVTNTF
GSAEATGILM	VIDPLHVTLT	PKKLKTGIGS	TVILSCALTG	SPEFTIRWYR
NTELVLPDEA	ISIRGLSNET	LLITSAQKSH	SGAYQCFATR	KAQTAQDFAI
IALEDGTPRI	VSSFSEKVVN	PGEQFSLMCA	AKGAPPPTVT	WALDDEPIVR
DGSHRTNQYT	MSDGTTISHM	NVTGPQIRDG	GVYRCTARNL	VGSAEYQARI
NVRGPPSIRA	MRNITAVAGR	DTLINCRVIG	YPYYSIKWYK	DALLLPDNHR
QVVFENGTLK	LTDVQKGMDE	GEYLCSVLIQ	PQLSISQSVH	VAVKVPPLIQ
PFEFPPASIG	QLLYIPCVVS	SGDMPIRITW	RKDGQVIISG	SGVTIESKEF
MSSLQISSVS	LKHNGNYTCI	ASNAAATVSR	ERQLIVRVPP	RFVVQPNNQD
GIYGKAGVLN	CSVDGYPPPK	VMWKHAKGSG	NPQQYHPVPL	TGRIQILPNS
SLLIRHVLEE	DIGYYLCQAS	NGVGTDISKS	MFLTVKIPAM	ITSHPNTTIA
IKGHAKELNC	TARGERPIII	RWEKGDTVID	PDRVMRYAIA	TKDNGDEVVS
TLKLKPADRG	DSVFFSCHAI	NSYGEDRGLI	QLTVQEPPDP	PELEIREVKA
RSMNLRWTQR	FDGNSIITGF	DIEYKNKSDS	WDFKQSTRNI	SPTINQANIV
DLHPASVYSI	RMYSFNKIGR	SEPSKELTIS	TEEAAPDGPP	MDVTLQPVTS
QSIQVTWKAP	KKELQNGVIR	GYQIGYRENS	PGSNGQYSIV	EMKATGDSEV
YTLDNLKKFA	QYGVVVQAFN	RAGTGPSSSE	INATTLEDVP	SQPPENVRAL
SITSDVAVIS	WSEPPRSTLN	GVLKGYRVIF	WSLYVDGEWG	EMQNITTTRE
RVELRGMEKF	TNYSVQVLAY	TQAGDGVRSS	VLYIQTKEDV	PGPPAGIKAV
PSSASSVVVS	WLPPTKPNGV	IRKYTIFCSS	PGSGQPAPSE	YETSPEQLFY
RIAHLNRGQQ	YLLWVAAVTS	AGRGNSSEKV	TIEPAGKAPA	KIISFGGTVT
TPWMKDVRLP	CNSVGDPAPA	VKWTKDSEDS	AIPVSMDGHR	LIHTNGTLLL
RAVKAEDSGY	YTCTATNTGG	FDTIIVNLLV	QVPPDQPRLT	VSKTSASSIT
LTWIPGDNGG	SSIRGFVLQY	SVDNSEEWKD	VFISSSERSF	KLDSLKCGTW
YKVKLAAKNS	VGSGRISEII	EAKTHGREPS	FSKDQHLFTH	INSTHARLNL
QGWNNGGCPI	TAIVLEYRPK	GTWAWQGLRA	NSSGEVFLTE	LREATWYELR
MRACNSAGCG	NETAQFATLD	YDGSTIPPIK	SAQGEGDDVK	KLFTIGCPVI
LATLGVALLF	IVRKKRKEKR	LKRLRDAKSL	AEMLISKNNR	SFDTPVKGPP
QGPRLHIDIP	RVQLLIEDKE	GIKQLGDDKA	TIPVTDAEFS	QAVNPQSFCT
GVSLHHPTLI	QSTGPLIDMS	DIRPGTNPVS	RKNVKSAHST	RNRYSSQWTL
TKCQASTPAR	TLTSDWRTVG	SQHGVTVTES	DSYSASLSQD	TDKGRNSMVS
TESASSTYEE	LARAYEHAKL	EEQLQHAKFE	ITECFISDSS	SDQMTTGTNE
NADSMTSMST	PSEPGICRFT	ASPPKPQDAD	RGKNVAVPIP	HRANKSDYCN
LPLYAKSEAF	FRKADGREPC	PVVPPREASI	RNLARTYHTQ	ARHLTLDPAS
KSLGLPHPGA	PAAASTATLP	QRTLAMPAPP	AGTAPPAPGP	TPAEPPTAPS
AAPPAPSTEP	PRAGGPHTKM	GGSRDSLLEM	STSGVGRSQK	QGAGAYSKSY
TLV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

Barlow G.M., Micales B., Chen X.-N., Lyons G.E., Korenberg J.R. (2002). Mammalian DSCAMs: roles in the development of the spinal cord, cortex, and cerebellum?. Biochem. Biophys. Res. Commun. 293: 881—891. PMID 12051741 doi:10.1016/S0006-291X(02)00307-8

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14656 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8TD84 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14656 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q8TD84 (англ.) . Архів оригіналу за 7 листопада 2016. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]