FBXO18

FBXO18
Ідентифікатори
Символи	FBH1, Fbx18, hF-box protein, helicase, 18, FBXO18, F-box DNA helicase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607222 MGI: 1354699 HomoloGene: 9272 GeneCards: FBH1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • DNA binding; • GO:0008026 helicase activity; • GO:0004003 DNA helicase activity; • DNA translocase activity; • single-stranded DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв’язування дволанцюгових ДНК; • GO:0043140 3'-5' DNA helicase activity; • hydrolase activity; • ATP binding;
Клітинна компонента	• SCF ubiquitin ligase complex; • хромосома; • хроматин; • клітинне ядро; • nuclear SCF ubiquitin ligase complex;
Біологічний процес	• positive regulation of protein phosphorylation; • replication fork protection; • negative regulation of double-strand break repair via homologous recombination; • negative regulation of chromatin binding; • смерть клітини; • DNA catabolic process, endonucleolytic; • cellular response to DNA damage stimulus; • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; • double-strand break repair via homologous recombination; • Убіквітин-залежний протеоліз; • replication fork processing; • response to intra-S DNA damage checkpoint signaling; • GO:0100026 Репарація ДНК; • DNA duplex unwinding; • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • recombinational repair;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	84893
	50755
	ENSG00000134452
	ENSMUSG00000058594
	Q8NFZ0; Q2TAK1
	Q8K2I9
	NM_001258452; NM_001258453; NM_032807; NM_178150
	NM_015792; NM_001348234; NM_001348235; NM_001348236; NM_001348237
	NP_001245381; NP_001245382; NP_116196; NP_835363; NP_001245382.1
	NP_056607; NP_001335163; NP_001335164; NP_001335165; NP_001335166
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

FBXO18 (англ. F-box protein, helicase, 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 043 амінокислот, а молекулярна маса — 117 686^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRRFKRKHLT	AIDCQHLARS	HLAVTQPFGQ	RWTNRDPNHG	LYPKPRTKRG
SRGQGSQRCI	PEFFLAGKQP	CTNDMAKSNS	VGQDSCQDSE	GDMIFPAESS
CALPQEGSAG	PGSPGSAPPS	RKRSWSSEEE	SNQATGTSRW	DGVSKKAPRH
HLSVPCTRPR	EARQEAEDST	SRLSAESGET	DQDAGDVGPD	PIPDSYYGLL
GTLPCQEALS	HICSLPSEVL	RHVFAFLPVE	DLYWNLSLVC	HLWREIISDP
LFIPWKKLYH	RYLMNEEQAV	SKVDGILSNC	GIEKESDLCV	LNLIRYTATT
KCSPSVDPER	VLWSLRDHPL	LPEAEACVRQ	HLPDLYAAAG	GVNIWALVAA
VVLLSSSVND	IQRLLFCLRR	PSSTVTMPDV	TETLYCIAVL	LYAMREKGIN
ISNRIHYNIF	YCLYLQENSC	TQATKVKEEP	SVWPGKKTIQ	LTHEQQLILN
HKMEPLQVVK	IMAFAGTGKT	STLVKYAEKW	SQSRFLYVTF	NKSIAKQAER
VFPSNVICKT	FHSMAYGHIG	RKYQSKKKLN	LFKLTPFMVN	SVLAEGKGGF
IRAKLVCKTL	ENFFASADEE	LTIDHVPIWC	KNSQGQRVMV	EQSEKLNGVL
EASRLWDNMR	KLGECTEEAH	QMTHDGYLKL	WQLSKPSLAS	FDAIFVDEAQ
DCTPAIMNIV	LSQPCGKIFV	GDPHQQIYTF	RGAVNALFTV	PHTHVFYLTQ
SFRFGVEIAY	VGATILDVCK	RVRKKTLVGG	NHQSGIRGDA	KGQVALLSRT
NANVFDEAVR	VTEGEFPSRI	HLIGGIKSFG	LDRIIDIWIL	LQPEEERRKQ
NLVIKDKFIR	RWVHKEGFSG	FKRYVTAAED	KELEAKIAVV	EKYNIRIPEL
VQRIEKCHIE	DLDFAEYILG	TVHKAKGLEF	DTVHVLDDFV	KVPCARHNLP
QLPHFRVESF	SEDEWNLLYV	AVTRAKKRLI	MTKSLENILT	LAGEYFLQAE
LTSNVLKTGV	VRCCVGQCNN	AIPVDTVLTM	KKLPITYSNR	KENKGGYLCH
SCAEQRIGPL	AFLTASPEQV	RAMERTVENI	VLPRHEALLF	LVF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Jeong Y.T., Cermak L., Guijarro M.V., Hernando E., Pagano M. (2013). FBH1 protects melanocytes from transformation and is deregulated in melanomas. Cell Cycle. 12: 1128—1132. PMID 23466708 doi:10.4161/cc.24165
Masuda-Ozawa T., Hoang T., Seo Y.S., Chen L.F., Spies M. (2013). Single-molecule sorting reveals how ubiquitylation affects substrate recognition and activities of FBH1 helicase. Nucleic Acids Res. 41: 3576—3587. PMID 23393192 doi:10.1093/nar/gkt056

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13620 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 19 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q8NFZ0 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13620 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 19 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q8NFZ0 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]