HNRNPM

HNRNPM
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи HNRNPM, CEAR, HNRNPM4, HNRPM, HNRPM4, HTGR1, NAGR1, hnRNP M, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M
Зовнішні ІД OMIM: 160994 MGI: 1926465 HomoloGene: 4354 GeneCards: HNRNPM
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4670
76936
Ensembl
ENSG00000099783
ENSMUSG00000059208
UniProt
P52272
Q9D0E1
RefSeq (мРНК)
NM_001297418
NM_005968
NM_031203
NM_001109913
NM_029804
RefSeq (білок)
NP_001284347
NP_005959
NP_112480
NP_001103383
NP_084080
Локус (UCSC) Хр. 19: 8.44 – 8.49 Mb Хр. 17: 33.87 – 33.91 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

HNRNPM (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 730 амінокислот, а молекулярна маса — 77 516[4].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAAGVEAAAE VAATEIKMEE ESGAPGVPSG NGAPGPKGEG ERPAQNEKRK
EKNIKRGGNR FEPYANPTKR YRAFITNIPF DVKWQSLKDL VKEKVGEVTY
VELLMDAEGK SRGCAVVEFK MEESMKKAAE VLNKHSLSGR PLKVKEDPDG
EHARRAMQKV MATTGGMGMG PGGPGMITIP PSILNNPNIP NEIIHALQAG
RLGSTVFVAN LDYKVGWKKL KEVFSMAGVV VRADILEDKD GKSRGIGTVT
FEQSIEAVQA ISMFNGQLLF DRPMHVKMDE RALPKGDFFP PERPQQLPHG
LGGIGMGLGP GGQPIDANHL NKGIGMGNIG PAGMGMEGIG FGINKMGGME
GPFGGGMENM GRFGSGMNMG RINEILSNAL KRGEIIAKQG GGGGGGSVPG
IERMGPGIDR LGGAGMERMG AGLGHGMDRV GSEIERMGLV MDRMGSVERM
GSGIERMGPL GLDHMASSIE RMGQTMERIG SGVERMGAGM GFGLERMAAP
IDRVGQTIER MGSGVERMGP AIERMGLSME RMVPAGMGAG LERMGPVMDR
MATGLERMGA NNLERMGLER MGANSLERMG LERMGANSLE RMGPAMGPAL
GAGIERMGLA MGGGGGASFD RAIEMERGNF GGSFAGSFGG AGGHAPGVAR
KACQIFVRNL PFDFTWKMLK DKFNECGHVL YADIKMENGK SKGCGVVKFE
SPEVAERACR MMNGMKLSGR EIDVRIDRNA

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • Datar K.V., Dreyfuss G., Swanson M.S. (1993). The human hnRNP M proteins: identification of a methionine/arginine-rich repeat motif in ribonucleoproteins. Nucleic Acids Res. 21: 439—446. PMID 8441656 doi:10.1093/nar/21.3.439
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 doi:10.1017/S1355838202021088
  • Gocke C.B., Yu H., Kang J. (2005). Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates. J. Biol. Chem. 280: 5004—5012. PMID 15561718 doi:10.1074/jbc.M411718200
  • Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 doi:10.1073/pnas.1413825111
  • Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 doi:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:5046 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, P52272 (англ.) . Архів оригіналу за 23 березня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також