IFIT5

IFIT5
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3ZGQ, 4HOQ, 4HOR, 4HOS, 4HOT, 4J0U
Ідентифікатори
Символи	IFIT5, P58, RI58, ISG58, interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 5
Зовнішні ІД	OMIM: 616135 HomoloGene: 49318 GeneCards: IFIT5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• tRNA binding; • single-stranded RNA binding; • RNA binding; • RNA cap binding; • зв’язування дволанцюгових ДНК; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • poly(U) RNA binding;
Клітинна компонента	• ruffle membrane; • клітинна мембрана; • cell projection; • apical part of cell; • мембрана; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • actin cytoskeleton; • IkappaB kinase complex; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• вроджений імунітет; • defense response to virus; • процес імунної системи; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • negative regulation of viral genome replication;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	24138
	100001239
	ENSG00000152778
	ENSDARG00000090537
	Q13325
	E7FCM5
	NM_012420
	NM_001190464
	NP_036552
	NP_001177393
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

IFIT5 (англ. Interferon induced protein with tetratricopeptide repeats 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 10-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 482 амінокислот, а молекулярна маса — 55 847^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSEIRKDTLK	AILLELECHF	TWNLLKEDID	LFEVEDTIGQ	QLEFLTTKSR
LALYNLLAYV	KHLKGQNKDA	LECLEQAEEI	IQQEHSDKEE	VRSLVTWGNY
AWVYYHMDQL	EEAQKYTGKI	GNVCKKLSSP	SNYKLECPET	DCEKGWALLK
FGGKYYQKAK	AAFEKALEVE	PDNPEFNIGY	AITVYRLDDS	DREGSVKSFS
LGPLRKAVTL	NPDNSYIKVF	LALKLQDVHA	EAEGEKYIEE	ILDQISSQPY
VLRYAAKFYR	RKNSWNKALE	LLKKALEVTP	TSSFLHHQMG	LCYRAQMIQI
KKATHNRPKG	KDKLKVDELI	SSAIFHFKAA	MERDSMFAFA	YTDLANMYAE
GGQYSNAEDI	FRKALRLENI	TDDHKHQIHY	HYGRFQEFHR	KSENTAIHHY
LEALKVKDRS	PLRTKLTSAL	KKLSTKRLCH	NALDVQSLSA	LGFVYKLEGE
KRQAAEYYEK	AQKIDPENAE	FLTALCELRL	SI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, вроджений імунітет, противірусний захист, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК, тРНК. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних відростках.

Література

Niikura T., Hirata R., Weil S.C. (1997). A novel interferon-inducible gene expressed during myeloid differentiation. Blood Cells Mol. Dis. 23: 337—349. PMID 9398535 doi:10.1006/bcmd.1997.0151
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Fensterl V., Sen G.C. (2011). The ISG56/IFIT1 gene family. J. Interferon Cytokine Res. 31: 71—78. PMID 20950130 doi:10.1089/jir.2010.0101
Abbas Y.M., Pichlmair A., Gorna M.W., Superti-Furga G., Nagar B. (2013). Structural basis for viral 5'-PPP-RNA recognition by human IFIT proteins. Nature. 494: 60—64. PMID 23334420 doi:10.1038/nature11783

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13328 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q13325 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13328 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q13325 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]