LIN54

LIN54
Ідентифікатори
Символи LIN54, CXCDC1, JC8.6, MIP120, TCX1, lin-54 DREAM MuvB core complex component
Зовнішні ІД OMIM: 613367 MGI: 2140902 HomoloGene: 18212 GeneCards: LIN54
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
132660
231506
Ensembl
ENSG00000189308
ENSMUSG00000118665
UniProt
Q6MZP7
Q571G4
RefSeq (мРНК)
NM_001115007
NM_001115008
NM_001288996
NM_001288997
NM_194282
NM_001115010
NM_172714
NM_001346583
NM_001359914
RefSeq (білок)
NP_001108479
NP_001108480
NP_001275925
NP_001275926
NP_919258
NP_001108482
NP_001333512
NP_766302
NP_001346843
Локус (UCSC) Хр. 4: 82.91 – 83.01 Mb Хр. 5: 100.59 – 100.65 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

LIN54 (англ. Lin-54 DREAM MuvB core complex component) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 749 амінокислот, а молекулярна маса — 79 494[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MEVVPAEVNSLLPEEIMDTGITLVDDDSIEAVIVSSPIPMETELEEIVNI
NSTGDSTATPISTEPITVYSNHTNQVAVNTTITKADSNTTVKPAFPSGLQ
KLGAQTPVTISANQIILNKVSQTSDLKLGNQTLKPDGQKLILTTLGKSGS
PIVLALPHSQLPQAQKVTTQAQSGDAKLPPQQIKVVTIGGRPEVKPVIGV
SALTPGSQLINTTTQPSVLQTQQLKTVQIAKKPRTPTSGPVITKLIFAKP
INSKAVTGQTTQVSPPVIAGRVLSQSTPGTPSKTITISESGVIGSTLNST
TQTPNKIAISPLKSPNKAVKSTVQTITVGGVSTSQFKTIIPLATAPNVQQ
IQVPGSKFHYVRLVTATSASSSTQPVSQNPSTNTQPLQQAKPVVVNTTPV
RMSVPIVSAQAVKQVVPKPINPTSQIVTTSQPQQRLIMPATPLPQIQPNL
TNLPPGTVLAPAPGTGNVGYAVLPAQYVTQLQQSSYVSIASNSTFTGTSG
IQTQARLPFNGIIPSESASRPRKPCNCTKSLCLKLYCDCFANGEFCNNCN
CTNCYNNLEHENERQKAIKACLDRNPEAFKPKIGKGKEGESDRRHSKGCN
CKRSGCLKNYCECYEAKIMCSSICKCIGCKNFEESPERKTLMHLADAAEV
RVQQQTAAKTKLSSQISDLLTRPTPALNSGGGKLPFTFVTKEVAEATCNC
LLAQAEQADKKGKSKAAAERMILEEFGRCLMSVINSAGKAKSDPCAMNC

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Schmit F., Cremer S., Gaubatz S. (2009). LIN54 is an essential core subunit of the DREAM/LINC complex that binds to the cdc2 promoter in a sequence-specific manner. FEBS J. 276: 5703—5716. PMID 19725879 doi:10.1111/j.1742-4658.2009.07261.x

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25397 (англ.) . Процитовано 18 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, Q6MZP7 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.

Див. також