NPAS4

NPAS4
Ідентифікатори
Символи	NPAS4, Le-PAS, NXF, PASD10, bHLHe79, neuronal PAS domain protein 4
Зовнішні ІД	OMIM: 608554 MGI: 2664186 HomoloGene: 15333 GeneCards: NPAS4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • protein dimerization activity; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein heterodimerization activity; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• postsynapse; • transcription regulator complex; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • cellular response to corticosterone stimulus; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • transcription, DNA-templated; • transcription by RNA polymerase II; • нейробіологія розвитку; • навчення; • короткочасна пам'ять; • довготривала пам'ять; • диференціація клітин; • regulation of synaptic transmission, GABAergic; • соціальна поведінка; • regulation of synaptic plasticity; • excitatory postsynaptic potential; • Гальмівний постсинаптичний потенціал; • inhibitory synapse assembly; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	266743
	225872
	ENSG00000174576
	ENSMUSG00000045903
	Q8IUM7
	Q8BGD7
	NM_178864; NM_001318804
	NM_153553
	NP_001305733; NP_849195
	NP_705781
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

NPAS4 (англ. Neuronal PAS domain protein 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 802 амінокислот, а молекулярна маса — 87 117^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MYRSTKGASK	ARRDQINAEI	RNLKELLPLA	EADKVRLSYL	HIMSLACIYT
RKGVFFAGGT	PLAGPTGLLS	AQELEDIVAA	LPGFLLVFTA	EGKLLYLSES
VSEHLGHSMV	DLVAQGDSIY	DIIDPADHLT	VRQQLTLPSA	LDTDRLFRCR
FNTSKSLRRQ	SAGNKLVLIR	GRFHAHPPGA	YWAGNPVFTA	FCAPLEPRPR
PGPGPGPGPA	SLFLAMFQSR	HAKDLALLDI	SESVLIYLGF	ERSELLCKSW
YGLLHPEDLA	HASAQHYRLL	AESGDIQAEM	VVRLQAKTGG	WAWIYCLLYS
EGPEGPITAN	NYPISDMEAW	SLRQQLNSED	TQAAYVLGTP	TMLPSFPENI
LSQEECSSTN	PLFTAALGAP	RSTSFPSAPE	LSVVSASEEL	PRPSKELDFS
YLTFPSGPEP	SLQAELSKDL	VCTPPYTPHQ	PGGCAFLFSL	HEPFQTHLPT
PSSTLQEQLT	PSTATFSDQL	TPSSATFPDP	LTSPLQGQLT	ETSVRSYEDQ
LTPCTSTFPD	QLLPSTATFP	EPLGSPAHEQ	LTPPSTAFQA	HLDSPSQTFP
EQLSPNPTKT	YFAQEGCSFL	YEKLPPSPSS	PGNGDCTLLA	LAQLRGPLSV
DVPLVPEGLL	TPEASPVKQS	FFHYSEKEQN	EIDRLIQQIS	QLAQGMDRPF
SAEAGTGGLE	PLGGLEPLDS	NLSLSGAGPP	VLSLDLKPWK	CQELDFLADP
DNMFLEETPV	EDIFMDLSTP	DPSEEWGSGD	PEAEGPGGAP	SPCNNLSPED
HSFLEDLATY	ETAFETGVSA	FPYDGFTDEL	HQLQSQVQDS	FHEDGSGGEP
TF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин, нейрогенез, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Ooe N., Saito K., Mikami N., Nakatuka I., Kaneko H. (2004). Identification of a novel basic helix-loop-helix-PAS factor, NXF, reveals a Sim2 competitive, positive regulatory role in dendritic-cytoskeleton modulator drebrin gene expression. Mol. Cell. Biol. 24: 608—616. PMID 14701734 doi:10.1128/MCB.24.2.608-616.2004
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Bersten D.C., Bruning J.B., Peet D.J., Whitelaw M.L. (2014). Human variants in the neuronal basic helix-loop-helix/Per-Arnt-Sim (bHLH/PAS) transcription factor complex NPAS4/ARNT2 disrupt function. PLoS ONE. 9: E85768—E85768. PMID 24465693 doi:10.1371/journal.pone.0085768

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18983 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q8IUM7 (англ.) . Архів оригіналу за 20 листопада 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18983 (англ.) . Процитовано 19 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q8IUM7 (англ.) . Архів оригіналу за 20 листопада 2017. Процитовано 19 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]