PDCD4

PDCD4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2KZT, 2GGF, 2RG8, 2ZU6, 3EIJ
Ідентифікатори
Символи	PDCD4, H731, programmed cell death 4 (neoplastic transformation inhibitor), programmed cell death 4
Зовнішні ІД	OMIM: 608610 MGI: 107490 HomoloGene: 7879 GeneCards: PDCD4
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• regulation of protein metabolic process; • negative regulation of cell cycle; • negative regulation of apoptotic process; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of JUN kinase activity; • positive regulation of smooth muscle cell apoptotic process; • negative regulation of myofibroblast differentiation; • GO:0097285 апоптоз; • positive regulation of endothelial cell apoptotic process; • BMP signaling pathway; • epithelial to mesenchymal transition involved in cardiac fibroblast development; • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell differentiation; • positive regulation of inflammatory response; • cellular response to lipopolysaccharide; • negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response; • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling; • interleukin-12-mediated signaling pathway; • negative regulation of vascular associated smooth muscle cell proliferation; • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell apoptotic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	27250
	18569
	ENSG00000150593
	ENSMUSG00000024975
	Q53EL6
	Q61823
	NM_145341; NM_001199492; NM_014456
	NM_001168491; NM_001168492; NM_011050
	NP_001186421; NP_055271; NP_663314
	NP_001161963; NP_001161964; NP_035180
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PDCD4 (англ. Programmed cell death 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 469 амінокислот, а молекулярна маса — 51 735^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDVENEQILN	VNPADPDNLS	DSLFSGDEEN	AGTEEIKNEI	NGNWISASSI
NEARINAKAK	RRLRKNSSRD	SGRGDSVSDS	GSDALRSGLT	VPTSPKGRLL
DRRSRSGKGR	GLPKKGGAGG	KGVWGTPGQV	YDVEEVDVKD	PNYDDDQENC
VYETVVLPLD	ERAFEKTLTP	IIQEYFEHGD	TNEVAEMLRD	LNLGEMKSGV
PVLAVSLALE	GKASHREMTS	KLLSDLCGTV	MSTTDVEKSF	DKLLKDLPEL
ALDTPRAPQL	VGQFIARAVG	DGILCNTYID	SYKGTVDCVQ	ARAALDKATV
LLSMSKGGKR	KDSVWGSGGG	QQSVNHLVKE	IDMLLKEYLL	SGDISEAEHC
LKELEVPHFH	HELVYEAIIM	VLESTGESTF	KMILDLLKSL	WKSSTITVDQ
MKRGYERIYN	EIPDINLDVP	HSYSVLERFV	EECFQAGIIS	KQLRDLCPSR
GRKRFVSEGD	GGRLKPESY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Yoshinaga H., Matsuhashi S., Fujiyama C., Masaki Z. (1999). Novel human PDCD4 (H731) gene expressed in proliferative cells is expressed in the small duct epithelial cells of the breast as revealed by an anti-H731 antibody. Pathol. Int. 49: 1067—1077. PMID 10632927 doi:10.1046/j.1440-1827.1999.00995.x
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240
Matsuhashi S., Yoshinaga H., Yatsuki H., Tsugita A., Hori K. (1997). Isolation of a novel gene from a human cell line with Pr-28 MAb which recognizes a nuclear antigen involved in the cell cycle. Res. Commun. Biochem. Cell Mol. Biol. 1: 109—120.

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8763 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q53EL6 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 10

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8763 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q53EL6 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]