PDS5B

PDS5B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5HDT
Ідентифікатори
Символи	PDS5B, APRIN, AS3, CG008, PDS5 cohesin associated factor B
Зовнішні ІД	OMIM: 605333 MGI: 2140945 HomoloGene: 41001 GeneCards: PDS5B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • ATP binding; • DNA binding;
Клітинна компонента	• хромосома; • гіалоплазма; • хроматин; • центромера; • нуклеоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• поділ клітини; • клітинний цикл; • проліферація; • regulation of cell population proliferation; • mitotic sister chromatid cohesion; • negative regulation of cell population proliferation; • GO:0100026 Репарація ДНК; • lens development in camera-type eye; • enteric nervous system development; • neuroblast migration;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	23047
	100710
	ENSG00000083642
	ENSMUSG00000034021
	Q9NTI5
	Q4VA53
	NM_015032; NM_015928
	NM_175310; NM_001346503
	NP_055847
	NP_001333432; NP_780519
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PDS5B (англ. PDS5 cohesin associated factor B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 447 амінокислот, а молекулярна маса — 164 667^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAHSKTRTND	GKITYPPGVK	EISDKISKEE	MVRRLKMVVK	TFMDMDQDSE
EEKELYLNLA	LHLASDFFLK	HPDKDVRLLV	ACCLADIFRI	YAPEAPYTSP
DKLKDIFMFI	TRQLKGLEDT	KSPQFNRYFY	LLENIAWVKS	YNICFELEDS
NEIFTQLYRT	LFSVINNGHN	QKVHMHMVDL	MSSIICEGDT	VSQELLDTVL
VNLVPAHKNL	NKQAYDLAKA	LLKRTAQAIE	PYITNFFNQV	LMLGKTSISD
LSEHVFDLIL	ELYNIDSHLL	LSVLPQLEFK	LKSNDNEERL	QVVKLLAKMF
GAKDSELASQ	NKPLWQCYLG	RFNDIHVPIR	LECVKFASHC	LMNHPDLAKD
LTEYLKVRSH	DPEEAIRHDV	IVSIVTAAKK	DILLVNDHLL	NFVRERTLDK
RWRVRKEAMM	GLAQIYKKYA	LQSAAGKDAA	KQIAWIKDKL	LHIYYQNSID
DRLLVERIFA	QYMVPHNLET	TERMKCLYYL	YATLDLNAVK	ALNEMWKCQN
LLRHQVKDLL	DLIKQPKTDA	SVKAIFSKVM	VITRNLPDPG	KAQDFMKKFT
QVLEDDEKIR	KQLEVLVSPT	CSCKQAEGCV	REITKKLGNP	KQPTNPFLEM
IKFLLERIAP	VHIDTESISA	LIKQVNKSID	GTADDEDEGV	PTDQAIRAGL
ELLKVLSFTH	PISFHSAETF	ESLLACLKMD	DEKVAEAALQ	IFKNTGSKIE
EDFPHIRSAL	LPVLHHKSKK	GPPRQAKYAI	HCIHAIFSSK	ETQFAQIFEP
LHKSLDPSNL	EHLITPLVTI	GHIALLAPDQ	FAAPLKSLVA	TFIVKDLLMN
DRLPGKKTTK	LWVPDEEVSP	ETMVKIQAIK	MMVRWLLGMK	NNHSKSGTST
LRLLTTILHS	DGDLTEQGKI	SKPDMSRLRL	AAGSAIVKLA	QEPCYHEIIT
LEQYQLCALA	INDECYQVRQ	VFAQKLHKGL	SRLRLPLEYM	AICALCAKDP
VKERRAHARQ	CLVKNINVRR	EYLKQHAAVS	EKLLSLLPEY	VVPYTIHLLA
HDPDYVKVQD	IEQLKDVKEC	LWFVLEILMA	KNENNSHAFI	RKMVENIKQT
KDAQGPDDAK	MNEKLYTVCD	VAMNIIMSKS	TTYSLESPKD	PVLPARFFTQ
PDKNFSNTKN	YLPPEMKSFF	TPGKPKTTNV	LGAVNKPLSS	AGKQSQTKSS
RMETVSNASS	SSNPSSPGRI	KGRLDSSEMD	HSENEDYTMS	SPLPGKKSDK
RDDSDLVRSE	LEKPRGRKKT	PVTEQEEKLG	MDDLTKLVQE	QKPKGSQRSR
KRGHTASESD	EQQWPEEKRL	KEDILENEDE	QNSPPKKGKR	GRPPKPLGGG
TPKEEPTMKT	SKKGSKKKSG	PPAPEEEEEE	ERQSGNTEQK	SKSKQHRVSR
RAQQRAESPE	SSAIESTQST	PQKGRGRPSK	TPSPSQPKKN	VRVGRSKQAA
TKENDSSEEV	DVFQGSSPVD	DIPQEETEEE	EVSTVNVRRR	SAKRERR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Geck P., Szelei J., Jimenez J., Sonnenschein C., Soto A.M. (1999). Early gene expression during androgen-induced inhibition of proliferation of prostate cancer cells: a new suppressor candidate on chromosome 13, in the BRCA2-Rb1 locus. J. Steroid Biochem. Mol. Biol. 68: 41—50. PMID 10215036 doi:10.1016/S0960-0760(98)00165-4
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Geck P., Maffini M.V., Szelei J., Sonnenschein C., Soto A.M. (2000). Androgen-induced proliferative quiescence in prostate cancer cells: the role of AS3 as its mediator. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 10185—10190. PMID 10963680 doi:10.1073/pnas.97.18.10185
Losada A., Yokochi T., Hirano T. (2005). Functional contribution of Pds5 to cohesin-mediated cohesion in human cells and Xenopus egg extracts. J. Cell Sci. 118: 2133—2141. PMID 15855230 doi:10.1242/jcs.02355
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 doi:10.1021/pr800500r

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20418 (англ.) . Архів оригіналу за 10 травня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-10 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9NTI5 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 13

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20418 (англ.) . Архів оригіналу за 10 травня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-10 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9NTI5 (англ.) . Архів оригіналу за 20 серпня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]