PER1

PER1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1UL6
Ідентифікатори
Символи	PER1, PER, RIGUI, hPER, period circadian clock 1, period circadian regulator 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602260 MGI: 1098283 HomoloGene: 1966 GeneCards: PER1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transcription factor binding; • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • E-box binding; • kinase binding; • chromatin DNA binding; • ubiquitin protein ligase binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • transcription corepressor binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• histone H3 deacetylation; • negative regulation of glucocorticoid receptor signaling pathway; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • response to light stimulus; • regulation of cytokine production involved in inflammatory response; • regulation of sodium ion transport; • ритмічний процес; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • circadian regulation of gene expression; • transcription, DNA-templated; • entrainment of circadian clock; • negative regulation of JNK cascade; • circadian regulation of translation; • regulation of circadian rhythm; • циркадний ритм; • histone H3 acetylation; • regulation of hair cycle; • histone H4 acetylation; • posttranscriptional regulation of gene expression; • response to cAMP; • regulation of p38MAPK cascade; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • entrainment of circadian clock by photoperiod; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5187
	18626
	ENSG00000179094
	ENSMUSG00000020893
	O15534
	O35973
	NM_002616
	NM_001159367; NM_011065
	NP_002607
	NP_001152839; NP_035195
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PER1 (англ. Period circadian clock 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 290 амінокислот, а молекулярна маса — 136 212^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGPLEGADG	GGDPRPGESF	CPGGVPSPGP	PQHRPCPGPS	LADDTDANSN
GSSGNESNGH	ESRGASQRSS	HSSSSGNGKD	SALLETTESS	KSTNSQSPSP
PSSSIAYSLL	SASSEQDNPS	TSGCSSEQSA	RARTQKELMT	ALRELKLRLP
PERRGKGRSG	TLATLQYALA	CVKQVQANQE	YYQQWSLEEG	EPCSMDMSTY
TLEELEHITS	EYTLQNQDTF	SVAVSFLTGR	IVYISEQAAV	LLRCKRDVFR
GTRFSELLAP	QDVGVFYGST	APSRLPTWGT	GASAGSGLRD	FTQEKSVFCR
IRGGPDRDPG	PRYQPFRLTP	YVTKIRVSDG	APAQPCCLLI	AERIHSGYEA
PRIPPDKRIF	TTRHTPSCLF	QDVDERAAPL	LGYLPQDLLG	APVLLFLHPE
DRPLMLAIHK	KILQLAGQPF	DHSPIRFCAR	NGEYVTMDTS	WAGFVHPWSR
KVAFVLGRHK	VRTAPLNEDV	FTPPAPSPAP	SLDTDIQELS	EQIHRLLLQP
VHSPSPTGLC	GVGAVTSPGP	LHSPGSSSDS	NGGDAEGPGP	PAPVTFQQIC
KDVHLVKHQG	QQLFIESRAR	PQSRPRLPAT	GTFKAKALPC	QSPDPELEAG
SAPVQAPLAL	VPEEAERKEA	SSCSYQQINC	LDSILRYLES	CNLPSTTKRK
CASSSSYTTS	SASDDDRQRT	GPVSVGTKKD	PPSAALSGEG	ATPRKEPVVG
GTLSPLALAN	KAESVVSVTS	QCSFSSTIVH	VGDKKPPESD	IIMMEDLPGL
APGPAPSPAP	SPTVAPDPAP	DAYRPVGLTK	AVLSLHTQKE	EQAFLSRFRD
LGRLRGLDSS	STAPSALGER	GCHHGPAPPS	RRHHCRSKAK	RSRHHQNPRA
EAPCYVSHPS	PVPPSTPWPT	PPATTPFPAV	VQPYPLPVFS	PRGGPQPLPP
APTSVPPAAF	PAPLVTPMVA	LVLPNYLFPT	PSSYPYGALQ	TPAEGPPTPA
SHSPSPSLPA	LAPSPPHRPD	SPLFNSRCSS	PLQLNLLQLE	ELPRAEGAAV
AGGPGSSAGP	PPPSAEAAEP	EARLAEVTES	SNQDALSGSS	DLLELLLQED
SRSGTGSAAS	GSLGSGLGSG	SGSGSHEGGS	TSASITRSSQ	SSHTSKYFGS
IDSSEAEAGA	ARGGAEPGDQ	VIKYVLQDPI	WLLMANADQR	VMMTYQVPSR
DMTSVLKQDR	ERLRAMQKQQ	PRFSEDQRRE	LGAVHSWVRK	GQLPRALDVM
ACVDCGSSTQ	DPGHPDDPLF	SELDGLGLEP	MEEGGGEQGS	SGGGSGEGEG
CEEAQGGAKA	SSSQDLAMEE	EEEGRSSSSP	ALPTAGNCTS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Shearman L.P., Zylka M.J., Weaver D.R., Kolakowski L.F. Jr., Reppert S.M. (1997). Two period homologs: circadian expression and photic regulation in the suprachiasmatic nuclei. Neuron. 19: 1261—1269. PMID 9427249 doi:10.1016/S0896-6273(00)80417-1
Shirogane T., Jin J., Ang X.L., Harper J.W. (2005). SCFbeta-TRCP controls clock-dependent transcription via casein kinase 1-dependent degradation of the mammalian period-1 (Per1) protein. J. Biol. Chem. 280: 26863—26872. PMID 15917222 doi:10.1074/jbc.M502862200
Eckel-Mahan K., Sassone-Corsi P. (2013). Metabolism and the circadian clock converge. Physiol. Rev. 93: 107—135. PMID 23303907 doi:10.1152/physrev.00016.2012
Partch C.L., Green C.B., Takahashi J.S. (2014). Molecular architecture of the mammalian circadian clock. Trends Cell Biol. 24: 90—99. PMID 23916625 doi:10.1016/j.tcb.2013.07.002

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8845 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-13 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, O15534 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:8845 (англ.) . Архів оригіналу за 13 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-13 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, O15534 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]