PPFIBP1

PPFIBP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3TAD
Ідентифікатори
Символи	PPFIBP1, L2, SGT2, hSGT2, hSgt2p, PPFIA binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603141 MGI: 1914783 HomoloGene: 2685 GeneCards: PPFIBP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cadherin binding;
Клітинна компонента	• клітинна мембрана; • focal adhesion; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• адгезія клітин;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	8496
	67533
	ENSG00000110841
	ENSMUSG00000016487
	Q86W92
	Q8C8U0
	NM_001198915; NM_001198916; NM_003622; NM_177444
	NM_001170433; NM_026221; NM_001355728; NM_001355729
	NP_001185844; NP_001185845; NP_003613; NP_803193
	NP_001163904; NP_080497; NP_001342657; NP_001342658
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PPFIBP1 (англ. PPFIA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 011 амінокислот, а молекулярна маса — 114 024^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMSDASDMLA	AALEQMDGII	AGSKALEYSN	GIFDCQSPTS	PFMGSLRALH
LVEDLRGLLE	MMETDEKEGL	RCQIPDSTAE	TLVEWLQSQM	TNGHLPGNGD
VYQERLARLE	NDKESLVLQV	SVLTDQVEAQ	GEKIRDLEFC	LEEHREKVNA
TEEMLQQELL	SRTSLETQKL	DLMAEISNLK	LKLTAVEKDR	LDYEDKFRDT
EGLIQEINDL	RLKVSEMDSE	RLQYEKKLKS	TKSLMAKLSS	MKIKVGQMQY
EKQRMEQKWE	SLKDELASLK	EQLEEKESEV	KRLQEKLVCK	MKGEGVEIVD
RDIEVQKMKK	AVESLMAANE	EKDRKIEDLR	QCLNRYKKMQ	DTVVLAQGKD
GEYEELLNSS	SISSLLDAQG	FSDLEKSPSP	TPVMGSPSCD	PFNTSVPEEF
HTTILQVSIP	SLLPATVSME	TSEKSKLTPK	PETSFEENDG	NIILGATVDT
QLCDKLLTSS	LQKSSSLGNL	KKETSDGEKE	TIQKTSEDRA	PAESRPFGTL
PPRPPGQDTS	MDDNPFGTRK	VRSSFGRGFF	KIKSNKRTAS	APNLAETEKE
TAEHLDLAGA	SSRPKDSQRN	SPFQIPPPSP	DSKKKSRGIM	KLFGKLRRSQ
STTFNPDDMS	EPEFKRGGTR	ATAGPRLGWS	RDLGQSNSDL	DMPFAKWTKE
QVCNWLMEQG	LGSYLNSGKH	WIASGQTLLQ	ASQQDLEKEL	GIKHSLHRKK
LQLALQALGS	EEETNHGKLD	FNWVTRWLDD	IGLPQYKTQF	DEGRVDGRML
HYMTVDDLLS	LKVVSVLHHL	SIKRAIQVLR	INNFEPNCLR	RRPSDENTIA
PSEVQKWTNH	RVMEWLRSVD	LAEYAPNLRG	SGVHGGLMVL	EPRFNVETMA
QLLNIPPNKT	LLRRHLATHF	NLLIGAEAQH	QKRDAMELPD	YVLLTATAKV
KPKKLAFSNF	GNLRKKKQED	GEEYVCPMEL	GQASGSASKK	GFKPGLDMRL
YEEDDLDRLE	QMEDSEGTVR	QIGAFSEGIN	NLTHMLKEDD	MFKDFAARSP
SASITDEDSN	V

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

Serra-Pages C., Medley Q.G., Tang M., Hart A., Streuli M. (1998). Liprins, a family of LAR transmembrane protein-tyrosine phosphatase-interacting proteins. J. Biol. Chem. 273: 15611—15620. PMID 9624153 doi:10.1074/jbc.273.25.15611
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9249 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-15 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q86W92 (англ.) . Архів оригіналу за 24 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9249 (англ.) . Архів оригіналу за 15 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-15 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q86W92 (англ.) . Архів оригіналу за 24 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]