PRKCD

PRKCD
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2YUU, 1YRK
Ідентифікатори
Символи	PRKCD, ALPS3, CVID9, MAY1, PKCD, nPKC-delta, protein kinase C delta
Зовнішні ІД	OMIM: 176977 MGI: 97598 HomoloGene: 55963 GeneCards: PRKCD
шифр КФ	2.7.10.2
Пов'язані генетичні захворювання
	autoimmune lymphoproliferative syndrome type 3
Реагує на сполуку
	ingenol mebutate, balanol, enzastaurin, ruboxistaurin
Онтологія гена
Молекулярна функція	• kinase activity; • ATP binding; • protein kinase activity; • non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity; • зв’язування з іоном металу; • kinase binding; • enzyme binding; • insulin receptor substrate binding; • transferase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • calcium-independent protein kinase C activity; • protein kinase binding; • nucleotide binding; • GO:0010577 enzyme activator activity; • protein serine/threonine kinase activity; • protein kinase C activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • мембрана; • cell-cell junction; • perinuclear region of cytoplasm; • клітинне ядро; • nuclear matrix; • ендоплазматичний ретикулум; • екзосома; • клітинна мембрана; • нуклеоплазма; • extracellular region; • azurophil granule lumen;
Біологічний процес	• intrinsic apoptotic signaling pathway in response to oxidative stress; • termination of signal transduction; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • negative regulation of protein binding; • positive regulation of endodeoxyribonuclease activity; • platelet activation; • protein phosphorylation; • клітинне старіння; • GO:1903105 negative regulation of insulin receptor signaling pathway; • positive regulation of sphingomyelin catabolic process; • cell chemotaxis; • клітинний цикл; • negative regulation of inflammatory response; • positive regulation of protein dephosphorylation; • Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis; • positive regulation of apoptotic signaling pathway; • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; • cellular response to hydroperoxide; • negative regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; • defense response to bacterium; • negative regulation of MAP kinase activity; • positive regulation of response to DNA damage stimulus; • positive regulation of protein import into nucleus; • interleukin-10 production; • regulation of actin cytoskeleton organization; • negative regulation of actin filament polymerization; • regulation of mRNA stability; • фосфорилювання; • protein stabilization; • regulation of signaling receptor activity; • negative regulation of filopodium assembly; • cellular response to angiotensin; • interleukin-12 production; • peptidyl-threonine phosphorylation; • positive regulation of ceramide biosynthetic process; • neutrophil activation; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • negative regulation of glial cell apoptotic process; • negative regulation of platelet aggregation; • positive regulation of phospholipid scramblase activity; • B cell proliferation; • immunoglobulin mediated immune response; • positive regulation of glucosylceramide catabolic process; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • positive regulation of superoxide anion generation; • activation of protein kinase activity; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • cellular response to hydrogen peroxide; • GO:0035404 peptidyl-serine phosphorylation; • GO:0097285 апоптоз; • neutrophil degranulation; • execution phase of apoptosis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	5580
	18753
	ENSG00000163932
	ENSMUSG00000021948
	Q05655
	P28867
NM_006254; NM_212539; NM_001316327; NM_001354676; NM_001354678;
	NM_001354679; NM_001354680
	NM_011103; NM_001310682
NP_001303256; NP_006245; NP_997704; NP_001341605; NP_001341607;
	NP_001341608; NP_001341609
	NP_001297611; NP_035233
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PRKCD (англ. Protein kinase C delta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 676 амінокислот, а молекулярна маса — 77 505^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPFLRIAFN	SYELGSLQAE	DEANQPFCAV	KMKEALSTER	GKTLVQKKPT
MYPEWKSTFD	AHIYEGRVIQ	IVLMRAAEEP	VSEVTVGVSV	LAERCKKNNG
KAEFWLDLQP	QAKVLMSVQY	FLEDVDCKQS	MRSEDEAKFP	TMNRRGAIKQ
AKIHYIKNHE	FIATFFGQPT	FCSVCKDFVW	GLNKQGYKCR	QCNAAIHKKC
IDKIIGRCTG	TAANSRDTIF	QKERFNIDMP	HRFKVHNYMS	PTFCDHCGSL
LWGLVKQGLK	CEDCGMNVHH	KCREKVANLC	GINQKLLAEA	LNQVTQRASR
RSDSASSEPV	GIYQGFEKKT	GVAGEDMQDN	SGTYGKIWEG	SSKCNINNFI
FHKVLGKGSF	GKVLLGELKG	RGEYFAIKAL	KKDVVLIDDD	VECTMVEKRV
LTLAAENPFL	THLICTFQTK	DHLFFVMEFL	NGGDLMYHIQ	DKGRFELYRA
TFYAAEIMCG	LQFLHSKGII	YRDLKLDNVL	LDRDGHIKIA	DFGMCKENIF
GESRASTFCG	TPDYIAPEIL	QGLKYTFSVD	WWSFGVLLYE	MLIGQSPFHG
DDEDELFESI	RVDTPHYPRW	ITKESKDILE	KLFEREPTKR	LGVTGNIKIH
PFFKTINWTL	LEKRRLEPPF	RPKVKSPRDY	SNFDQEFLNE	KARLSYSDKN
LIDSMDQSAF	AGFSFVNPKF	EHLLED

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, клітинний цикл, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Palmer R.H., Ridden J., Parker P.J. (1994). Identification of multiple, novel, protein kinase C-related gene products. FEBS Lett. 356: 5—8. PMID 7988719 doi:10.1016/0014-5793(94)01202-4
Bankers-Fulbright J.L., Kita H., Gleich G.J., O'Grady S.M. (2001). Regulation of human eosinophil NADPH oxidase activity: a central role for PKCdelta. J. Cell. Physiol. 189: 306—315. PMID 11748588 doi:10.1002/jcp.10022
Hodgkinson C.P., Sale G.J. (2002). Regulation of both PDK1 and the phosphorylation of PKC-zeta and -delta by a C-terminal PRK2 fragment. Biochemistry. 41: 561—569. PMID 11781095 doi:10.1021/bi010719z
Ren J., Li Y., Kufe D. (2002). Protein kinase C delta regulates function of the DF3/MUC1 carcinoma antigen in beta-catenin signaling. J. Biol. Chem. 277: 17616—17622. PMID 11877440 doi:10.1074/jbc.M200436200
Yoshida K., Wang H.-G., Miki Y., Kufe D. (2003). Protein kinase Cdelta is responsible for constitutive and DNA damage-induced phosphorylation of Rad9. EMBO J. 22: 1431—1441. PMID 12628935 doi:10.1093/emboj/cdg134

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PRKCD переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Protein kinase C delta переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9399 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q05655 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PRKCD переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Protein kinase C delta переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9399 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-6] UniProt, Q05655 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]