PSEN1

PSEN1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2KR6, 5A63, 4UIS, 5FN3, 5FN4, 5FN5, 5FN2
Ідентифікатори
Символи	PSEN1, Psen1, Ad3h, PS-1, PS1, S182, AD3, FAD, presenilin 1, ACNINV3
Зовнішні ІД	OMIM: 104311 MGI: 1202717 HomoloGene: 7186 GeneCards: PSEN1
Пов'язані генетичні захворювання
	Alzheimer disease 3, dilated cardiomyopathy 1U, Хвороба Піка
Реагує на сполуку
	semagacestat
Онтологія гена
Молекулярна функція	• PDZ domain binding; • cadherin binding; • GO:0070122 peptidase activity; • beta-catenin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • calcium channel activity; • aspartic-type endopeptidase activity; • endopeptidase activity; • hydrolase activity; • aspartic endopeptidase activity, intramembrane cleaving;
Клітинна компонента	• ядерна мембрана; • мембрана; • мітохондрія; • ciliary rootlet; • neuron projection; • gamma-secretase complex; • клітинне ядро; • кінетохор; • центросома; • rough endoplasmic reticulum; • dendritic shaft; • aggresome; • cell surface; • мембранна органела; • ендоплазматичний ретикулум; • membrane raft; • комплекс Ґольджі; • growth cone; • neuromuscular junction; • внутрішньоклітинний; • аксон; • nuclear outer membrane; • endoplasmic reticulum membrane; • Golgi membrane; • integral component of plasma membrane; • smooth endoplasmic reticulum; • lysosomal membrane; • міжклітинні контакти; • дендрит (нейробіологія); • presynapse; • мітохондріальна внутрішня мембрана; • GO:0016023 цитоплазматичний міхур; • цитоплазма; • клітинна мембрана; • cell cortex; • integral component of membrane; • azurophil granule membrane; • Z discdkac; • soma; • perinuclear region of cytoplasm; • early endosome; • Синаптичні бульбашки; • GO:0009327 protein-containing complex; • Сарколема; • синапс; • synaptic membrane; • integral component of presynaptic membrane; • ендосома; • early endosome membrane; • cell projection;
Біологічний процес	• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process; • somitogenesis; • positive regulation of protein phosphorylation; • positive regulation of MAP kinase activity; • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity; • mitochondrial transport; • Післязародковий розвиток; • positive regulation of dendritic spine development; • cellular response to DNA damage stimulus; • heart looping; • blood vessel development; • membrane protein ectodomain proteolysis; • regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity; • regulation of resting membrane potential; • regulation of synaptic transmission, glutamatergic; • amyloid precursor protein catabolic process; • GO:0097285 апоптоз; • thymus development; • positive regulation of coagulation; • negative regulation of apoptotic signaling pathway; • neuron development; • пам'ять; • endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis; • GO:0001306 response to oxidative stress; • autophagosome assembly; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • development of the heart; • negative regulation of axonogenesis; • embryonic limb morphogenesis; • приведення в рух; • learning or memory; • protein transport; • cerebral cortex cell migration; • positive regulation of proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; • L-glutamate transmembrane transport; • brain morphogenesis; • Сигнальний шлях Notch; • GO:0033128 negative regulation of protein phosphorylation; • myeloid leukocyte differentiation; • neuron apoptotic process; • smooth endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis; • synaptic vesicle targeting; • Cajal-Retzius cell differentiation; • skin morphogenesis; • negative regulation of protein kinase activity; • cell fate specification; • skeletal system morphogenesis; • regulation of phosphorylation; • cellular calcium ion homeostasis; • epithelial cell proliferation; • neuron migration; • negative regulation of apoptotic process; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • протеоліз; • regulation of synaptic plasticity; • negative regulation of epidermal growth factor-activated receptor activity; • адгезія клітин; • hematopoietic progenitor cell differentiation; • neuron differentiation; • cerebral cortex development; • canonical Wnt signaling pathway; • dorsal/ventral neural tube patterning; • neural retina development; • positive regulation of protein kinase activity; • T cell activation involved in immune response; • Нейрогенез; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • protein processing; • protein maturation; • myeloid dendritic cell differentiation; • автофагія; • GO:0033578, GO:0033577, GO:0033575, GO:0033576 protein glycosylation; • brain development; • negative regulation of ubiquitin-protein transferase activity; • choline transport; • positive regulation of apoptotic process; • Notch receptor processing; • negative regulation of ubiquitin-dependent protein catabolic process; • forebrain development; • regulation of protein binding; • T cell receptor signaling pathway; • segmentation; • positive regulation of receptor recycling; • calcium ion transmembrane transport; • amyloid-beta formation; • amyloid precursor protein metabolic process; • neutrophil degranulation; • regulation of canonical Wnt signaling pathway; • amyloid-beta metabolic process; • positive regulation of L-glutamate import across plasma membrane; • astrocyte activation involved in immune response; • regulation of neuron projection development; • cerebellum development; • positive regulation of protein binding; • Notch receptor processing, ligand-dependent; • positive regulation of phosphorylation; • astrocyte activation; • synapse organization; • cell-cell adhesion; • cellular response to amyloid-beta; • negative regulation of core promoter binding; • negative regulation of low-density lipoprotein receptor activity; • positive regulation of amyloid fibril formation; • neuron projection maintenance; • membrane protein intracellular domain proteolysis; • positive regulation of protein import into nucleus; • ephrin receptor signaling pathway; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • negative regulation of gene expression; • positive regulation of glycolytic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5663
	19164
	ENSG00000080815
	ENSMUSG00000019969
	P49768
	P49769
	NM_000021; NM_007318; NM_007319
	NM_008943; NM_001362271
	NP_000012; NP_015557
	NP_001349200
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PSEN1 (англ. Presenilin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 467 амінокислот, а молекулярна маса — 52 668^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTELPAPLSY	FQNAQMSEDN	HLSNTVRSQN	DNRERQEHND	RRSLGHPEPL
SNGRPQGNSR	QVVEQDEEED	EELTLKYGAK	HVIMLFVPVT	LCMVVVVATI
KSVSFYTRKD	GQLIYTPFTE	DTETVGQRAL	HSILNAAIMI	SVIVVMTILL
VVLYKYRCYK	VIHAWLIISS	LLLLFFFSFI	YLGEVFKTYN	VAVDYITVAL
LIWNFGVVGM	ISIHWKGPLR	LQQAYLIMIS	ALMALVFIKY	LPEWTAWLIL
AVISVYDLVA	VLCPKGPLRM	LVETAQERNE	TLFPALIYSS	TMVWLVNMAE
GDPEAQRRVS	KNSKYNAEST	ERESQDTVAE	NDDGGFSEEW	EAQRDSHLGP
HRSTPESRAA	VQELSSSILA	GEDPEERGVK	LGLGDFIFYS	VLVGKASATA
SGDWNTTIAC	FVAILIGLCL	TLLLLAIFKK	ALPALPISIT	FGLVFYFATD
YLVQPFMDQL	AFHQFYI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані та мембрані ендоплазматичного ретикулума і апараті Ґольджі.

Культура нейронів переднього мозку після 40 днів диференціації індукованих людських плюрипотентних стовбурових клітин (iPSCs). iPSCs від пацієнтки з сімейною формою хвороби Альцгеймера, мутація у гені PSEN1. TUJ-1-позитивні клітини експресують маркер (β3-tubulin) зрілих нейронів (червоний колір). GABA-позитивні клітини (зелений колір) експресують маркер GABA- ергічних нейронів - рецептор гамма-аміномасляної кислоти (ГАМК) A, альфа 1. Ядра клітин пофарбовані DAPI (синій колір).

Патологія

Мутації у гені PSEN1 асоційовані з сімейними формами хвороби Альцгеймара, що успадковуються аутосомно домінантно ^[7].

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Tsujimura A., Yasojima K., Hashimoto-Gotoh T. (1997). Cloning of Xenopus presenilin-alpha and -beta cDNAs and their differential expression in oogenesis and embryogenesis. Biochem. Biophys. Res. Commun. 231: 392—396. PMID 9070286 doi:10.1006/bbrc.1996.6043
Vidal R., Ghiso J., Wisniewski T., Frangione B. (1996). Alzheimer's presenilin 1 gene expression in platelets and megakaryocytes. Identification of a novel splice variant. FEBS Lett. 393: 19—23. PMID 8804415 doi:10.1016/0014-5793(96)00845-9
Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1 — R8.16. PMID 14759258 doi:10.1186/gb-2004-5-2-r8
Fluhrer R., Friedlein A., Haass C., Walter J. (2004). Phosphorylation of presenilin 1 at the caspase recognition site regulates its proteolytic processing and the progression of apoptosis. J. Biol. Chem. 279: 1585—1593. PMID 14576165 doi:10.1074/jbc.M306653200
Cruts M., van Broeckhoven C. (1998). Presenilin mutations in Alzheimer's disease. Hum. Mutat. 11: 183—190. PMID 9521418 doi:10.1002/(SICI)1098-1004(1998)11:3<183::AID-HUMU1>3.0.CO;2-J

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з PSEN1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Presenilin 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9508 (англ.) . Архів оригіналу за 5 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-04-05 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P49768 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ Natalie S Ryan et al. "Clinical phenotype and genetic associations in autosomal dominant familial Alzheimer's disease: a case series" / Natalie S Ryan et al.// Lancet Neurol. — 2016. — Vol.15 — P.1326-1335

Див. також

Хромосома 14

[1] Захворювання, генетично пов'язані з PSEN1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Presenilin 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9508 (англ.) . Архів оригіналу за 5 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-04-05 у Wayback Machine.]

[UniProt-6] UniProt, P49768 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[7] Natalie S Ryan et al. "Clinical phenotype and genetic associations in autosomal dominant familial Alzheimer's disease: a case series" / Natalie S Ryan et al.// Lancet Neurol. — 2016. — Vol.15 — P.1326-1335

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]