RAP1GDS1

RAP1GDS1
Ідентифікатори
Символи	RAP1GDS1, GDS1, SmgGDS, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1
Зовнішні ІД	OMIM: 179502 MGI: 2385189 HomoloGene: 41422 GeneCards: RAP1GDS1
Реагує на сполуку
	Viroporin 3a
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • екзосома; • ендоплазматичний ретикулум; • мітохондрія;
Біологічний процес	• negative regulation of endoplasmic reticulum calcium ion concentration; • positive regulation of mitochondrial calcium ion concentration; • vascular associated smooth muscle contraction; • myosin filament assembly; • small GTPase mediated signal transduction; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	5910
	229877
	ENSG00000138698
	ENSMUSG00000028149
	P52306
	E9Q912
NM_001100426; NM_001100427; NM_001100428; NM_001100429; NM_001100430;
	NM_021159
	NM_001040690; NM_001286759; NM_145544; NM_001356388
NP_001093896; NP_001093897; NP_001093898; NP_001093899; NP_001093900;
	NP_066982
	NP_001035780; NP_001273688; NP_001343317; NP_663519
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RAP1GDS1 (англ. Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 607 амінокислот, а молекулярна маса — 66 317^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDNLSDTLKK	LKITAVDKTE	DSLEGCLDCL	LQALAQNNTE	TSEKIQASGI
LQLFASLLTP	QSSCKAKVAN	IIAEVAKNEF	MRIPCVDAGL	ISPLVQLLNS
KDQEVLLQTG	RALGNICYDS	HEGRSAVDQA	GGAQIVIDHL	RSLCSITDPA
NEKLLTVFCG	MLMNYSNEND	SLQAQLINMG	VIPTLVKLLG	IHCQNAALTE
MCLVAFGNLA	ELESSKEQFA	STNIAEELVK	LFKKQIEHDK	REMIFEVLAP
LAENDAIKLQ	LVEAGLVECL	LEIVQQKVDS	DKEDDITELK	TGSDLMVLLL
LGDESMQKLF	EGGKGSVFQR	VLSWIPSNNH	QLQLAGALAI	ANFARNDANC
IHMVDNGIVE	KLMDLLDRHV	EDGNVTVQHA	ALSALRNLAI	PVINKAKMLS
AGVTEAVLKF	LKSEMPPVQF	KLLGTLRMLI	DAQAEAAEQL	GKNVKLVERL
VEWCEAKDHA	GVMGESNRLL	SALIRHSKSK	DVIKTIVQSG	GIKHLVTMAT
SEHVIMQNEA	LVALALIAAL	ELGTAEKDLE	SAKLVQILHR	LLADERSAPE
IKYNSMVLIC	ALMGSECLHK	EVQDLAFLDV	VSKLRSHENK	SVAQQASLTE
QRLTVES

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів гтфаз. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг.

Література

Vikis H.G., Stewart S., Guan K.L. (2002). SmgGDS displays differential binding and exchange activity towards different Ras isoforms. Oncogene. 21: 2425—2432. PMID 11948427 doi:10.1038/sj.onc.1205306
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9859 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P52306 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9859 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P52306 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]