RAVER2

RAVER2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WG1
Ідентифікатори
Символи	RAVER2, ribonucleoprotein, PTB binding 2
Зовнішні ІД	OMIM: 609953 MGI: 2443623 HomoloGene: 18829 GeneCards: RAVER2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleic acid binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	55225
	242570
	ENSG00000162437
	ENSMUSG00000035275
	Q9HCJ3
	Q7TPD6
	NM_018211; NM_018716; NM_001366165
	NM_183024
	NP_060681; NP_001353094
	NP_898845
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RAVER2 (англ. Ribonucleoprotein, PTB binding 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 691 амінокислот, а молекулярна маса — 74 339^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAAAGDGGG	EGGAGLGSAA	GLGPGPGLRG	QGPSAEAHEG	APDPMPAALH
PEEVAARLQR	MQRELSNRRK	ILVKNLPQDS	NCQEVHDLLK	DYDLKYCYVD
RNKRTAFVTL	LNGEQAQNAI	QMFHQYSFRG	KDLIVQLQPT	DALLCITNVP
ISFTSEEFEE	LVRAYGNIER	CFLVYSEVTG	HSKGYGFVEY	MKKDFAAKAR
LELLGRQLGA	SALFAQWMDV	NLLASELIHS	KCLCIDKLPS	DYRDSEELLQ
IFSSVHKPVF	CQLAQDEGSY	VGGFAVVEYS	TAEQAEEVQQ	AADGMTIKGS
KVQVSFCAPG	APGRSTLAAL	IAAQRVMHSN	QKGLLPEPNP	VQIMKSLNNP
AMLQVLLQPQ	LCGRAVKPAV	LGTPHSLPHL	MNPSISPAFL	HLNKAHQSSV
MGNTSNLFLQ	NLSHIPLAQQ	QLMKFENIHT	NNKPGLLGEP	PAVVLQTALG
IGSVLPLKKE	LGHHHGEAHK	TSSLIPTQTT	ITAGMGMLPF	FPNQHIAGQA
GPGHSNTQEK	QPATVGMAEG	NFSGSQPYLQ	SFPNLAAGSL	LVGHHKQQQS
QPKGTEISSG	AASKNQTSLL	GEPPKEIRLS	KNPYLNLASV	LPSVCLSSPA
SKTTLHKTGI	ASSILDAISQ	GSESQHALEK	CIAYSPPFGD	YAQVSSLRNE
KRGSSYLISA	PEGGSVECVD	QHSQGTGAYY	METYLKKKRV	Y

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 doi:10.1093/dnares/7.4.271
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25577 (англ.) . Процитовано 15 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9HCJ3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 15 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 1

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25577 (англ.) . Процитовано 15 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9HCJ3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 15 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]