RBBP6

RBBP6
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2C7H, 2YSA, 2YUR, 3ZTG
Ідентифікатори
Символи	RBBP6, MY038, P2P-R, PACT, RBQ-1, SNAMA, retinoblastoma binding protein 6, RB binding protein 6, ubiquitin ligase
Зовнішні ІД	OMIM: 600938 MGI: 894835 HomoloGene: 136812 GeneCards: RBBP6
Пов'язані генетичні захворювання
	ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • zinc ion binding; • nucleic acid binding; • зв’язування з іоном металу; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • transferase activity; • RNA binding; • protein kinase binding;
Клітинна компонента	• ядерце; • центр організації мікротрубочок; • клітинне ядро; • хромосома; • цитоплазма; • цитоскелет; • гіалоплазма; • центросома; • nuclear speck; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• in utero embryonic development; • embryonic organ development; • regulation of DNA replication; • реплікація ДНК; • cellular response to DNA damage stimulus; • Убіквітин-залежний протеоліз; • multicellular organism growth; • somite development; • mRNA processing; • protein polyubiquitination; • ubiquitin-dependent protein catabolic process;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	5930
	19647
	ENSG00000122257
	ENSMUSG00000030779
	Q7Z6E9
	P97868
	NM_006910; NM_018703; NM_032626
	NM_011247; NM_175023
	NP_008841; NP_061173; NP_116015
	NP_035377; NP_778188; NP_001390011; NP_001390012
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RBBP6 (англ. RB binding protein 6, ubiquitin ligase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 792 амінокислот, а молекулярна маса — 201 564^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSCVHYKFSS	KLNYDTVTFD	GLHISLCDLK	KQIMGREKLK	AADCDLQITN
AQTKEEYTDD	NALIPKNSSV	IVRRIPIGGV	KSTSKTYVIS	RTEPAMATTK
AIDDSSASIS	LAQLTKTANL	AEANASEEDK	IKAMMSQSGH	EYDPINYMKK
PLGPPPPSYT	CFRCGKPGHY	IKNCPTNGDK	NFESGPRIKK	STGIPRSFMM
EVKDPNMKGA	MLTNTGKYAI	PTIDAEAYAI	GKKEKPPFLP	EEPSSSSEED
DPIPDELLCL	ICKDIMTDAV	VIPCCGNSYC	DECIRTALLE	SDEHTCPTCH
QNDVSPDALI	ANKFLRQAVN	NFKNETGYTK	RLRKQLPPPP	PPIPPPRPLI
QRNLQPLMRS	PISRQQDPLM	IPVTSSSTHP	APSISSLTSN	QSSLAPPVSG
NPSSAPAPVP	DITATVSISV	HSEKSDGPFR	DSDNKILPAA	ALASEHSKGT
SSIAITALME	EKGYQVPVLG	TPSLLGQSLL	HGQLIPTTGP	VRINTARPGG
GRPGWEHSNK	LGYLVSPPQQ	IRRGERSCYR	SINRGRHHSE	RSQRTQGPSL
PATPVFVPVP	PPPLYPPPPH	TLPLPPGVPP	PQFSPQFPPG	QPPPAGYSVP
PPGFPPAPAN	LSTPWVSSGV	QTAHSNTIPT	TQAPPLSREE	FYREQRRLKE
EEKKKSKLDE	FTNDFAKELM	EYKKIQKERR	RSFSRSKSPY	SGSSYSRSSY
TYSKSRSGST	RSRSYSRSFS	RSHSRSYSRS	PPYPRRGRGK	SRNYRSRSRS
HGYHRSRSRS	PPYRRYHSRS	RSPQAFRGQS	PNKRNVPQGE	TEREYFNRYR
EVPPPYDMKA	YYGRSVDFRD	PFEKERYREW	ERKYREWYEK	YYKGYAAGAQ
PRPSANRENF	SPERFLPLNI	RNSPFTRGRR	EDYVGGQSHR	SRNIGSNYPE
KLSARDGHNQ	KDNTKSKEKE	SENAPGDGKG	NKHKKHRKRR	KGEESEGFLN
PELLETSRKS	REPTGVEENK	TDSLFVLPSR	DDATPVRDEP	MDAESITFKS
VSEKDKRERD	KPKAKGDKTK	RKNDGSAVSK	KENIVKPAKG	PQEKVDGERE
RSPRSEPPIK	KAKEETPKTD	NTKSSSSSQK	DEKITGTPRK	AHSKSAKEHQ
ETKPVKEEKV	KKDYSKDVKS	EKLTTKEEKA	KKPNEKNKPL	DNKGEKRKRK
TEEKGVDKDF	ESSSMKISKL	EVTEIVKPSP	KRKMEPDTEK	MDRTPEKDKI
SLSAPAKKIK	LNRETGKKIG	STENISNTKE	PSEKLESTSS	KVKQEKVKGK
VRRKVTGTEG	SSSTLVDYTS	TSSTGGSPVR	KSEEKTDTKR	TVIKTMEEYN
NDNTAPAEDV	IIMIQVPQSK	WDKDDFESEE	EDVKSTQPIS	SVGKPASVIK
NVSTKPSNIV	KYPEKESEPS	EKIQKFTKDV	SHEIIQHEVK	SSKNSASSEK
GKTKDRDYSV	LEKENPEKRK	NSTQPEKESN	LDRLNEQGNF	KSLSQSSKEA
RTSDKHDSTR	ASSNKDFTPN	RDKKTDYDTR	EYSSSKRRDE	KNELTRRKDS
PSRNKDSASG	QKNKPREERD	LPKKGTGDSK	KSNSSPSRDR	KPHDHKATYD
TKRPNEETKS	VDKNPCKDRE	KHVLEARNNK	ESSGNKLLYI	LNPPETQVEK
EQITGQIDKS	TVKPKPQLSH	SSRLSSDLTR	ETDEAAFEPD	YNESDSESNV
SVKEEESSGN	ISKDLKDKIV	EKAKESLDTA	AVVQVGISRN	QSHSSPSVSP
SRSHSPSGSQ	TRSHSSSASS	AESQDSKKKK	KKKEKKKHKK	HKKHKKHKKH
AGTEVELEKS	QKHKHKKKKS	KKNKDKEKEK	EKDDQKVKSV	TV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, убіквітинування білків, реплікація ДНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, хромосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Gao S., Witte M.M., Scott R.E. (2002). P2P-R protein localizes to the nucleolus of interphase cells and the periphery of chromosomes in mitotic cells which show maximum P2P-R immunoreactivity. J. Cell. Physiol. 191: 145—154. PMID 12064457 doi:10.1002/jcp.10084
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240
Gao S., Witte M.M., Scott R.E. (2002). J. Cell. Physiol. 192: 359—360. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з RBBP6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9889 (англ.) . Архів оригіналу за 14 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-14 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q7Z6E9 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

[1] Захворювання, генетично пов'язані з RBBP6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9889 (англ.) . Архів оригіналу за 14 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-14 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q7Z6E9 (англ.) . Архів оригіналу за 19 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]