RBFOX2

RBFOX2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2CQ3
Ідентифікатори
Символи	RBFOX2, FOX2, Fox-2, HNRBP2, HRNBP2, RBM9, RTA, dJ106I20.3, fxh, RNA binding protein, fox-1 homolog 2, RNA binding fox-1 homolog 2
Зовнішні ІД	OMIM: 612149 MGI: 1933973 HomoloGene: 49375 GeneCards: RBFOX2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001106 transcription corepressor activity; • transcription factor binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • nucleic acid binding; • mRNA binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• neuromuscular process controlling balance; • dendrite morphogenesis; • mRNA processing; • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; • нейробіологія розвитку; • regulation of RNA splicing; • regulation of cell population proliferation; • Сплайсинг РНК; • radial glia guided migration of Purkinje cell; • regulation of definitive erythrocyte differentiation; • RNA metabolic process; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • intracellular estrogen receptor signaling pathway; • fibroblast growth factor receptor signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	23543
	93686
	ENSG00000277564; ENSG00000100320
	ENSMUSG00000033565
	O43251
	Q8BP71
NM_001031695; NM_001082576; NM_001082577; NM_001082578; NM_001082579;
	NM_014309; NM_001349982; NM_001349983; NM_001349989; NM_001349990; NM_001349991; NM_001349992; NM_001349994; NM_001349995; NM_001349996; NM_001349997; NM_001349998; NM_001349999; NM_001394108; NM_001394109; NM_001394110; NM_001394111; NM_001394112; NM_001394113; NM_001394114; NM_001394115
NM_001110827; NM_001110828; NM_001110829; NM_001110830; NM_001286417;
	NM_001286418; NM_001286419; NM_053104; NM_175387; NM_001358770; NM_001358771; NM_001358772
NP_001026865; NP_001076045; NP_001076046; NP_001076047; NP_001076048;
	NP_055124; NP_001336911; NP_001336912; NP_001336918; NP_001336919; NP_001336920; NP_001336921; NP_001336923; NP_001336924; NP_001336925; NP_001336926; NP_001336927; NP_001336928
NP_001104297; NP_001104298; NP_001104299; NP_001104300; NP_001273346;
	NP_001273347; NP_001273348; NP_444334; NP_780596; NP_001345699; NP_001345700; NP_001345701
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RBFOX2 (англ. RNA binding protein, fox-1 homolog 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390 амінокислот, а молекулярна маса — 41 374^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQNEPLTPGY	HGFPARDSQG	NQEPTTTPDA	MVQPFTTIPF	PPPPQNGIPT
EYGVPHTQDY	AGQTGEHNLT	LYGSTQAHGE	QSSNSPSTQN	GSLTTEGGAQ
TDGQQSQTQS	SENSESKSTP	KRLHVSNIPF	RFRDPDLRQM	FGQFGKILDV
EIIFNERGSK	GFGFVTFENS	ADADRAREKL	HGTVVEGRKI	EVNNATARVM
TNKKMVTPYA	NGWKLSPVVG	AVYGPELYAA	SSFQADVSLG	NDAAVPLSGR
GGINTYIPLI	SLPLVPGFPY	PTAATTAAAF	RGAHLRGRGR	TVYGAVRAVP
PTAIPAYPGV	VYQDGFYGAD	LYGGYAAYRY	AQPATATAAT	AAAAAAAAYS
DGYGRVYTAD	PYHALAPAAS	YGVGAVASLY	RGGYSRFAPY

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Norris J.D., Fan D., Sherk A., McDonnell D.P. (2002). A negative coregulator for the human ER. Mol. Endocrinol. 16: 459—468. PMID 11875103 doi:10.1210/mend.16.3.0787
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9906 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O43251 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 22

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:9906 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O43251 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]