RNF216

RNF216
Ідентифікатори
Символи	RNF216, CAHH, TRIAD3, U7I1, UBCE7IP1, ZIN, ring finger protein 216
Зовнішні ІД	OMIM: 609948 MGI: 1344349 HomoloGene: 19442 GeneCards: RNF216
Пов'язані генетичні захворювання
	Gordon-Holmes syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • зв’язування з іоном металу; • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity; • transferase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • гіалоплазма; • Schaffer collateral - CA1 synapse; • postsynaptic endocytic zone; • glutamatergic synapse;
Біологічний процес	• protein K48-linked ubiquitination; • negative regulation of type I interferon production; • GO:0022415 viral process; • regulation of interferon-beta production; • Убіквітин-залежний протеоліз; • regulation of defense response to virus by host; • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; • GO:0097285 апоптоз; • protein catabolic process, modulating synaptic transmission;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	54476
	108086
	ENSG00000011275
	ENSMUSG00000045078
	Q9NWF9
	P58283
	NM_019011; NM_207111; NM_207116; NM_001377156
	NM_080561; NM_207110; NM_001359851
	NP_996994; NP_996999; NP_001364085
	NP_542128; NP_996993; NP_001346780
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RNF216 (англ. Ring finger protein 216) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 866 амінокислот, а молекулярна маса — 99 406^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEEGNNNEEV	IHLNNFHCHR	GQEWINLRDG	PITISDSSDE	ERIPMLVTPA
PQQHEEEDLD	DDVILTEDDS	EDDYGEFLDL	GPPGISEFTK	PSGQTEREPK
PGPSHNQAAN	DIVNPRSEQK	VIILEEGSLL	YTESDPLETQ	NQSSEDSETE
LLSNLGESAA	LADDQAIEED	CWLDHPYFQS	LNQQPREITN	QVVPQERQPE
AELGRLLFQH	EFPGPAFPRP	EPQQGGISGP	SSPQPAHPLG	EFEDQQLASD
DEEPGPAFPM	QESQEPNLEN	IWGQEAAEVD	QELVELLVKE	TEARFPDVAN
GFIEEIIHFK	NYYDLNVLCN	FLLENPDYPK	REDRIIINPS	SSLLASQDET
KLPKIDFFDY	SKLTPLDQRC	FIQAADLLMA	DFKVLSSQDI	KWALHELKGH
YAITRKALSD	AIKKWQELSP	ETSGKRKKRK	QMNQYSYIDF	KFEQGDIKIE
KRMFFLENKR	RHCRSYDRRA	LLPAVQQEQE	FYEQKIKEMA	EHEDFLLALQ
MNEEQYQKDG	QLIECRCCYG	EFPFEELTQC	ADAHLFCKEC	LIRYAQEAVF
GSGKLELSCM	EGSCTCSFPT	SELEKVLPQT	ILYKYYERKA	EEEVAAAYAD
ELVRCPSCSF	PALLDSDVKR	FSCPNPHCRK	ETCRKCQGLW	KEHNGLTCEE
LAEKDDIKYR	TSIEEKMTAA	RIRKCHKCGT	GLIKSEGCNR	MSCRCGAQMC
YLCRVSINGY	DHFCQHPRSP	GAPCQECSRC	SLWTDPTEDD	EKLIEEIQKE
AEEEQKRKNG	ENTFKRIGPP	LEKPVEKVQR	VEALPRPVPQ	NLPQPQMPPY
AFAHPPFPLP	PVRPVFNNFP	LNMGPIPAPY	VPPLPNVRVN	YDFGPIHMPL
EHNLPMHFGP	QPRHRF

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Chen D., Li X., Zhai Z., Shu H.-B. (2002). A novel zinc finger protein interacts with receptor-interacting protein (RIP) and inhibits tumor necrosis factor (TNF)- and IL1-induced NF-kappa B activation. J. Biol. Chem. 277: 15985—15991. PMID 11854271 doi:10.1074/jbc.M108675200
Chuang T.-H., Ulevitch R.J. (2004). Triad3A, an E3 ubiquitin-protein ligase regulating Toll-like receptors. Nat. Immunol. 5: 495—502. PMID 15107846 doi:10.1038/ni1066
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 doi:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з RNF216 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21698 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-14 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9NWF9 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

[1] Захворювання, генетично пов'язані з RNF216 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21698 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 7 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-14 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q9NWF9 (англ.) . Архів оригіналу за 18 вересня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]