SART1

SART1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4PYU
Ідентифікатори
Символи	SART1, Ara1, HOMS1, SART1259, SNRNP110, Snu66, squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 1, HAF, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, spliceosome associated factor 1, recruiter of U4/U6.U5 tri-snRNP
Зовнішні ІД	OMIM: 605941 MGI: 1309453 HomoloGene: 133770 GeneCards: SART1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • Тільце Кахаля; • комплекс Ґольджі; • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex; • catalytic step 2 spliceosome; • spliceosomal complex; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • nuclear speck; • U2-type precatalytic spliceosome;
Біологічний процес	• mRNA cis splicing, via spliceosome; • positive regulation of cytotoxic T cell differentiation; • intrinsic apoptotic signaling pathway; • mRNA splicing, via spliceosome; • mRNA processing; • maturation of 5S rRNA; • spliceosomal snRNP assembly; • Сплайсинг РНК;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9092
	20227
	ENSG00000175467
	ENSMUSG00000039148
	O43290
	Q9Z315
	NM_005146
	NM_016882
	NP_005137
	NP_058578
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SART1 (англ. SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 800 амінокислот, а молекулярна маса — 90 255^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGSSKKHRGE	KEAAGTTAAA	GTGGATEQPP	RHREHKKHKH	RSGGSGGSGG
ERRKRSRERG	GERGSGRRGA	EAEARSSTHG	RERSQAEPSE	RRVKREKRDD
GYEAAASSKT	SSGDASSLSI	EETNKLRAKL	GLKPLEVNAI	KKEAGTKEEP
VTADVINPMA	LRQREELREK	LAAAKEKRLL	NQKLGKIKTL	GEDDPWLDDT
AAWIERSRQL	QKEKDLAEKR	AKLLEEMDQE	FGVSTLVEEE	FGQRRQDLYS
ARDLQGLTVE	HAIDSFREGE	TMILTLKDKG	VLQEEEDVLV	NVNLVDKERA
EKNVELRKKK	PDYLPYAEDE	SVDDLAQQKP	RSILSKYDEE	LEGERPHSFR
LEQGGTADGL	RERELEEIRA	KLRLQAQSLS	TVGPRLASEY	LTPEEMVTFK
KTKRRVKKIR	KKEKEVVVRA	DDLLPLGDQT	QDGDFGSRLR	GRGRRRVSEV
EEEKEPVPQP	LPSDDTRVEN	MDISDEEEGG	APPPGSPQVL	EEDEAELELQ
KQLEKGRRLR	QLQQLQQLRD	SGEKVVEIVK	KLESRQRGWE	EDEDPERKGA
IVFNATSEFC	RTLGEIPTYG	LAGNREEQEE	LMDFERDEER	SANGGSESDG
EENIGWSTVN	LDEEKQQQDF	SASSTTILDE	EPIVNRGLAA	ALLLCQNKGL
LETTVQKVAR	VKAPNKSLPS	AVYCIEDKMA	IDDKYSRREE	YRGFTQDFKE
KDGYKPDVKI	EYVDETGRKL	TPKEAFRQLS	HRFHGKGSGK	MKTERRMKKL
DEEALLKKMS	SSDTPLGTVA	LLQEKQKAQK	TPYIVLSGSG	KSMNANTITK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

Makarova O.V., Makarov E.M., Luehrmann R. (2001). The 65 and 110 kDa SR-related proteins of the U4/U6*U5 tri-snRNP are essential for the assembly of mature spliceosomes. EMBO J. 20: 2553—2563. PMID 11350945 doi:10.1093/emboj/20.10.2553
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Bolland D.J., Hewitt J.E. (2001). Intron loss in the SART1 genes of Fugu rubripes and Tetraodon nigroviridis. Gene. 271: 43—49. PMID 11410364 doi:10.1016/S0378-1119(01)00504-2
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 doi:10.1017/S1355838202021088
Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 doi:10.1261/rna.55406
Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 doi:10.1073/pnas.1413825111

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10538 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O43290 (англ.) . Архів оригіналу за 6 листопада 2016. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10538 (англ.) . Процитовано 8 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, O43290 (англ.) . Архів оригіналу за 6 листопада 2016. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]