SH3BP1

SH3BP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4J9D, 4J9F
Ідентифікатори
Символи	SH3BP1, ARHGAP43, SH3 domain binding protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 617368 MGI: 104603 HomoloGene: 7534 GeneCards: SH3BP1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• SH3 domain binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity; • semaphorin receptor binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • exocyst; • lamellipodium; • phagocytic cup; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • Адгезивні контакти; • bicellular tight junction; • міжклітинні контакти; • cell projection; • cell leading edge; • внутрішньоклітинний;
Біологічний процес	• GO:0072468 сигнальна трансдукція; • phagocytosis, engulfment; • actin filament organization; • regulation of actin filament depolymerization; • regulation of actin cytoskeleton organization; • cell junction assembly; • regulation of blood vessel endothelial cell migration; • establishment of epithelial cell apical/basal polarity; • negative regulation of small GTPase mediated signal transduction; • semaphorin-plexin signaling pathway; • Фагоцитоз; • cell migration; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • filopodium assembly; • ruffle assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	23616
	20401
	ENSG00000100092
	ENSMUSG00000022436
	Q9Y3L3
	P55194
	NM_018957; NM_001350055
	NM_009164; NM_001316684; NM_001316685; NM_001316686
	NP_061830; NP_001336984
	NP_001303613; NP_001303614; NP_001303615; NP_033190
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SH3BP1 (англ. SH3 domain binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 701 амінокислот, а молекулярна маса — 75 713^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMKRQLHRMR	QLAQTGSLGR	TPETAEFLGE	DLLQVEQRLE	PAKRAAHNIH
KRLQACLQGQ	SGADMDKRVK	KLPLMALSTT	MAESFKELDP	DSSMGKALEM
SCAIQNQLAR	ILAEFEMTLE	RDVLQPLSRL	SEEELPAILK	HKKSLQKLVS
DWNTLKSRLS	QATKNSGSSQ	GLGGSPGSHS	HTTMANKVET	LKEEEEELKR
KVEQCRDEYL	ADLYHFVTKE	DSYANYFIRL	LEIQADYHRR	SLSSLDTALA
ELRENHGQAD	HSPSMTATHF	PRVYGVSLAT	HLQELGREIA	LPIEACVMML
LSEGMKEEGL	FRLAAGASVL	KRLKQTMASD	PHSLEEFCSD	PHAVAGALKS
YLRELPEPLM	TFDLYDDWMR	AASLKEPGAR	LQALQEVCSR	LPPENLSNLR
YLMKFLARLA	EEQEVNKMTP	SNIAIVLGPN	LLWPPEKEGD	QAQLDAASVS
SIQVVGVVEA	LIQSADTLFP	GDINFNVSGL	FSAVTLQDTV	SDRLASEELP
STAVPTPATT	PAPAPAPAPA	PAPALASAAT	KERTESEVPP	RPASPKVTRS
PPETAAPVED	MARRTKRPAP	ARPTMPPPQV	SGSRSSPPAP	PLPPGSGSPG
TPQALPRRLV	GSSLRAPTVP	PPLPPTPPQP	ARRQSRRSPA	SPSPASPGPA
SPSPVSLSNP	AQVDLGAATA	EGGAPEAISG	VPTPPAIPPQ	PRPRSLASET
N

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 doi:10.1021/pr800500r

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10824 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-11 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9Y3L3 (англ.) . Архів оригіналу за 18 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 22

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10824 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-11 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9Y3L3 (англ.) . Архів оригіналу за 18 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]