SKAP1

SKAP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1U5D
Ідентифікатори
Символи	SKAP1, HEL-S-81p, SCAP1, SKAP55, src kinase associated phosphoprotein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 604969 MGI: 1925723 HomoloGene: 2764 GeneCards: SKAP1
Пов'язані генетичні захворювання
	рак яєчника
Онтологія гена
Молекулярна функція	• SH3 domain binding; • SH2 domain binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein phosphatase binding; • protein kinase binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • protein homodimerization activity; • microtubule plus-end binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мембрана; • cell-cell junction; • клітинна мембрана; • T cell receptor complex; • клітинне ядро; • гіалоплазма; • ruffle; • immunological synapse; • microtubule plus-end; • plasma membrane raft;
Біологічний процес	• адаптивна імунна відповідь; • процес імунної системи; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • protein localization to plasma membrane; • T cell receptor signaling pathway; • positive regulation of cell adhesion; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of signal transduction; • microtubule cytoskeleton organization; • positive regulation of cell-matrix adhesion; • positive regulation of adaptive immune response; • cell migration; • positive regulation of integrin activation; • positive regulation of cell-cell adhesion mediated by integrin; • positive regulation of heterotypic cell-cell adhesion; • cellular response to epidermal growth factor stimulus; • positive regulation of leukocyte cell-cell adhesion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	8631
	78473
	ENSG00000141293
	ENSMUSG00000057058
	Q86WV1
	Q3UUV5
	NM_001075099; NM_003726
	NM_001033186; NM_001177898; NM_001177899
	NP_001068567; NP_003717
	NP_001028358; NP_001171369; NP_001171370
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SKAP1 (англ. Src kinase associated phosphoprotein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359 амінокислот, а молекулярна маса — 41 432^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MQAAALPEEI	RWLLEDAEEF	LAEGLRNENL	SAVARDHRDH	ILRGFQQIKA
RYYWDFQPQG	GDIGQDSSDD	NHSGTLGLSL	TSDAPFLSDY	QDEGMEDIVK
GAQELDNVIK	QGYLEKKSKD	HSFFGSEWQK	RWCVVSRGLF	YYYANEKSKQ
PKGTFLIKGY	GVRMAPHLRR	DSKKESCFEL	TSQDRRSYEF	TATSPAEARD
WVDQISFLLK	DLSSLTIPYE	EDEEEEEKEE	TYDDIDGFDS	PSCGSQCRPT
ILPGSVGIKE	PTEEKEEEDI	YEVLPDEEHD	LEEDESGTRR	KGVDYASYYQ
GLWDCHGDQP	DELSFQRGDL	IRILSKEYNM	YGWWVGELNS	LVGIVPKEYL
TTAFEVEER

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Wu L., Yu Z., Shen S.-H. (2002). SKAP55 recruits to lipid rafts and positively mediates the MAPK pathway upon T cell receptor activation. J. Biol. Chem. 277: 40420—40427. PMID 12171928 doi:10.1074/jbc.M206023200
Wu L., Fu J., Shen S.-H. (2002). SKAP55 coupled with CD45 positively regulates T-cell receptor-mediated gene transcription. Mol. Cell. Biol. 22: 2673—2686. PMID 11909961 doi:10.1128/MCB.22.8.2673-2686.2002
Jo E.-K., Wang H., Rudd C.E. (2005). An essential role for SKAP-55 in LFA-1 clustering on T cells that cannot be substituted by SKAP-55R. J. Exp. Med. 201: 1733—1739. PMID 15939789 doi:10.1084/jem.20042577
Duke-Cohan J.S., Kang H., Liu H., Rudd C.E. (2006). Regulation and function of SKAP-55 non-canonical motif binding to the SH3c domain of adhesion and degranulation-promoting adaptor protein. J. Biol. Chem. 281: 13743—13750. PMID 16461356 doi:10.1074/jbc.M508774200
Kosco K.A., Cerignoli F., Williams S., Abraham R.T., Mustelin T. (2008). SKAP55 modulates T cell antigen receptor-induced activation of the Ras-Erk-AP1 pathway by binding RasGRP1. Mol. Immunol. 45: 510—522. PMID 17658605 doi:10.1016/j.molimm.2007.05.024

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з SKAP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15605 (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-04-06 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q86WV1 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

[1] Захворювання, генетично пов'язані з SKAP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15605 (англ.) . Архів оригіналу за 6 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-04-06 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q86WV1 (англ.) . Архів оригіналу за 10 листопада 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]