SMYD2

SMYD2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3RIB, 3S7B, 3S7D, 3S7F, 3S7J, 3TG4, 3TG5, 4O6F, 4WUY, 4YND, 5ARF, 5ARG
Ідентифікатори
Символи	SMYD2, HSKM-B, KMT3C, ZMYND14, SET and MYND domain containing 2
Зовнішні ІД	OMIM: 610663 MGI: 1915889 HomoloGene: 32466 GeneCards: SMYD2
шифр КФ	2.1.1.354
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity; • transferase activity; • RNA polymerase II complex binding; • p53 binding; • зв’язування з іоном металу; • protein-lysine N-methyltransferase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • histone methyltransferase activity (H3-K36 specific); • lysine N-methyltransferase activity; • histone-lysine N-methyltransferase activity;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • нуклеоплазма; • клітинне ядро; • цитоплазма;
Біологічний процес	• regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • peptidyl-lysine monomethylation; • transcription, DNA-templated; • histone H3-K36 methylation; • development of the heart; • Метилювання; • peptidyl-lysine dimethylation; • histone methylation; • negative regulation of cell population proliferation; • histone lysine methylation; • regulation of signal transduction by p53 class mediator; • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	56950
	226830
	ENSG00000143499
	ENSMUSG00000026603
	Q9NRG4
	Q8R5A0
	NM_020197
	NM_026796
	NP_064582
	NP_081072
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SMYD2 (англ. SET and MYND domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 433 амінокислот, а молекулярна маса — 49 688^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRAEGLGGLE	RFCSPGKGRG	LRALQPFQVG	DLLFSCPAYA	YVLTVNERGN
HCEYCFTRKE	GLSKCGRCKQ	AFYCNVECQK	EDWPMHKLEC	SPMVVFGENW
NPSETVRLTA	RILAKQKIHP	ERTPSEKLLA	VKEFESHLDK	LDNEKKDLIQ
SDIAALHHFY	SKHLGFPDND	SLVVLFAQVN	CNGFTIEDEE	LSHLGSAIFP
DVALMNHSCC	PNVIVTYKGT	LAEVRAVQEI	KPGEEVFTSY	IDLLYPTEDR
NDRLRDSYFF	TCECQECTTK	DKDKAKVEIR	KLSDPPKAEA	IRDMVRYARN
VIEEFRRAKH	YKSPSELLEI	CELSQEKMSS	VFEDSNVYML	HMMYQAMGVC
LYMQDWEGAL	QYGQKIIKPY	SKHYPLYSLN	VASMWLKLGR	LYMGLEHKAA
GEKALKKAIA	IMEVAHGKDH	PYISEIKQEI	ESH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, регуляторів хроматину, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, S-аденозил-L-метіоніном. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Wang C., Chen X., Wang Y., Gong J., Hu G. (2007). C/EBPalphap30 plays transcriptional regulatory roles distinct from C/EBPalphap42. Cell Res. 17: 374—383. PMID 17242690 doi:10.1038/sj.cr.7310121
Xu S., Zhong C., Zhang T., Ding J. (2011). Structure of human lysine methyltransferase Smyd2 reveals insights into the substrate divergence in Smyd proteins. J. Mol. Cell Biol. 3: 293—300. PMID 21724641 doi:10.1093/jmcb/mjr015

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20982 (англ.) . Процитовано 15 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9NRG4 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2017. Процитовано 15 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 1

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20982 (англ.) . Процитовано 15 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q9NRG4 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2017. Процитовано 15 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]