SNPH

SNPH
Ідентифікатори
Символи SNPH, bA314N13.5, syntaphilin
Зовнішні ІД OMIM: 604942 MGI: 2139270 HomoloGene: 8817 GeneCards: SNPH
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
9751
241727
Ensembl
ENSG00000101298
ENSMUSG00000027457
UniProt
O15079
Q80U23
RefSeq (мРНК)
NM_014723
NM_001318234
NM_001291076
NM_001291077
NM_198214
RefSeq (білок)
NP_001305163
NP_055538
NP_001278005
NP_001278006
NP_937857
Локус (UCSC) Хр. 20: 1.27 – 1.31 Mb Хр. 2: 151.59 – 151.63 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SNPH (англ. Syntaphilin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 494 амінокислот, а молекулярна маса — 53 537[4].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAMSLPGSRR TSAGSRRRTS PPVSVRDAYG TSSLSSSSNS GSYKGSDSSP
TPRRSMKYTL CSDNHGIKPP TPEQYLTPLQ QKEVCIRHLK ARLKDTQDRL
QDRDTEIDDL KTQLSRMQED WIEEECHRVE AQLALKEARK EIKQLKQVID
TVKNNLIDKD KGLQKYFVDI NIQNKKLETL LHSMEVAQNG MAKEDGTGES
AGGSPARSLT RSSTYTKLSD PAVCGDRQPG DPSSGSAEDG ADSGFAAADD
TLSRTDALEA SSLLSSGVDC GTEETSLHSS FGLGPRFPAS NTYEKLLCGM
EAGVQASCMQ ERAIQTDFVQ YQPDLDTILE KVTQAQVCGT DPESGDRCPE
LDAHPSGPRD PNSAVVVTVG DELEAPEPIT RGPTPQRPGA NPNPGQSVSV
VCPMEEEEEA AVAEKEPKSY WSRHYIVDLL AVVVPAVPTV AWLCRSQRRQ
GQPIYNISSL LRGCCTVALH SIRRISCRSL SQPSPSPAGG GSQL

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, клітинних контактах, синапсах, синаптосомах.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15931 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-04 у Wayback Machine.]
  4. UniProt, O15079 (англ.) . Архів оригіналу за 2 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також