SPI1

SPI1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1PUE
Ідентифікатори
Символи	SPI1, OF, PU.1, SFPI1, SPI-1, SPI-A, Spi-1 proto-oncogene, AGM10
Зовнішні ІД	OMIM: 165170 MGI: 98282 HomoloGene: 2346 GeneCards: SPI1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • sequence-specific DNA binding; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • RNA binding; • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • NFAT protein binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • transcription factor binding;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • transcription regulator complex;
Біологічний процес	• myeloid leukocyte differentiation; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • cellular response to ethanol; • somatic stem cell population maintenance; • lymphocyte differentiation; • regulation of erythrocyte differentiation; • myeloid dendritic cell differentiation; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • negative regulation of MHC class II biosynthetic process; • lymphoid progenitor cell differentiation; • transcription, DNA-templated; • macrophage differentiation; • anatomical structure regression; • negative regulation of histone H4 acetylation; • negative regulation of gene expression, epigenetic; • vasculature development; • granulocyte differentiation; • apoptotic process involved in blood vessel morphogenesis; • histone H3 acetylation; • erythrocyte differentiation; • hypermethylation of CpG island; • positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • pri-miRNA transcription by RNA polymerase II; • диференціація клітин; • interleukin-6-mediated signaling pathway;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	6688
	20375
	ENSG00000066336
	ENSMUSG00000002111
	P17947
	P17433
	NM_001080547; NM_003120
	NM_011355; NM_001378898; NM_001378899
	NP_001074016; NP_003111
	NP_035485; NP_001365827; NP_001365828
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SPI1 (англ. Spi-1 proto-oncogene) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 270 амінокислот, а молекулярна маса — 31 083^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLQACKMEGF	PLVPPPSEDL	VPYDTDLYQR	QTHEYYPYLS	SDGESHSDHY
WDFHPHHVHS	EFESFAENNF	TELQSVQPPQ	LQQLYRHMEL	EQMHVLDTPM
VPPHPSLGHQ	VSYLPRMCLQ	YPSLSPAQPS	SDEEEGERQS	PPLEVSDGEA
DGLEPGPGLL	PGETGSKKKI	RLYQFLLDLL	RSGDMKDSIW	WVDKDKGTFQ
FSSKHKEALA	HRWGIQKGNR	KKMTYQKMAR	ALRNYGKTGE	VKKVKKKLTY
QFSGEVLGRG	GLAERRHPPH

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Rao S., Matsumura A., Yoon J., Simon M.C. (1999). SPI-B activates transcription via a unique proline, serine, and threonine domain and exhibits DNA binding affinity differences from PU.1. J. Biol. Chem. 274: 11115—11124. PMID 10196196 doi:10.1074/jbc.274.16.11115
Mao S., Frank R.C., Zhang J., Miyazaki Y., Nimer S.D. (1999). Functional and physical interactions between AML1 proteins and an ETS protein, MEF: implications for the pathogenesis of t(8;21)-positive leukemias. Mol. Cell. Biol. 19: 3635—3644. PMID 10207087 doi:10.1128/MCB.19.5.3635
Dahl R., Iyer S.R., Owens K.S., Cuylear D.D., Simon M.C. (2007). The transcriptional repressor GFI-1 antagonizes PU.1 activity through protein-protein interaction. J. Biol. Chem. 282: 6473—6483. PMID 17197705 doi:10.1074/jbc.M607613200
Ray D., Culine S., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. (1990). The human homologue of the putative proto-oncogene Spi-1: characterization and expression in tumors. Oncogene. 5: 663—668. PMID 1693183
Ray D., Culine S., Tavitian A., Moreau-Gachelin F. (1990). Oncogene. 5: 1611—1612. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11241 (англ.) . Архів оригіналу за 31 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-31 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P17947 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11241 (англ.) . Архів оригіналу за 31 травня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-31 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P17947 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]