USP28

USP28
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2LVA, 2MUU
Ідентифікатори
Символи	USP28, ubiquitin specific peptidase 28
Зовнішні ІД	OMIM: 610748 MGI: 2442293 HomoloGene: 10840 GeneCards: USP28
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cysteine-type peptidase activity; • GO:0070122 peptidase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • thiol-dependent deubiquitinase; • hydrolase activity; • cysteine-type endopeptidase activity;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • ядерні тільця; • GO:0009327 protein-containing complex; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• response to ionizing radiation; • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator; • regulation of protein stability; • ubiquitin-dependent protein catabolic process; • cellular response to UV; • DNA damage checkpoint signaling; • протеоліз; • cellular response to DNA damage stimulus; • Ras protein signal transduction; • проліферація; • GO:0100026 Репарація ДНК; • protein deubiquitination;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	57646
	235323
	ENSG00000048028
	ENSMUSG00000032267
	Q96RU2
	Q5I043
NM_001301029; NM_001346252; NM_001346253; NM_001346254; NM_001346255;
	NM_001346257; NM_001346258; NM_001346259; NM_001346260; NM_001346261; NM_001346262; NM_001346263; NM_001346264; NM_001346265; NM_001346267; NM_001346268; NM_001346269; NM_001346270; NM_001346271; NM_001346272; NM_001346273; NM_020886
	NM_175482; NM_001359739
NP_001287958; NP_001333181; NP_001333182; NP_001333183; NP_001333184;
	NP_001333186; NP_001333187; NP_001333188; NP_001333189; NP_001333190; NP_001333191; NP_001333192; NP_001333193; NP_001333194; NP_001333196; NP_001333197; NP_001333198; NP_001333199; NP_001333200; NP_001333201; NP_001333202; NP_065937
	NP_780691; NP_001346668
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

USP28 (англ. Ubiquitin specific peptidase 28) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 11-й хромосомі.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 077 амінокислот, а молекулярна маса — 122 491^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MTAELQQDDA	AGAADGHGSS	CQMLLNQLRE	ITGIQDPSFL	HEALKASNGD
ITQAVSLLTD	ERVKEPSQDT	VATEPSEVEG	SAANKEVLAK	VIDLTHDNKD
DLQAAIALSL	LESPKIQADG	RDLNRMHEAT	SAETKRSKRK	RCEVWGENPN
PNDWRRVDGW	PVGLKNVGNT	CWFSAVIQSL	FQLPEFRRLV	LSYSLPQNVL
ENCRSHTEKR	NIMFMQELQY	LFALMMGSNR	KFVDPSAALD	LLKGAFRSSE
EQQQDVSEFT	HKLLDWLEDA	FQLAVNVNSP	RNKSENPMVQ	LFYGTFLTEG
VREGKPFCNN	ETFGQYPLQV	NGYRNLDECL	EGAMVEGDVE	LLPSDHSVKY
GQERWFTKLP	PVLTFELSRF	EFNQSLGQPE	KIHNKLEFPQ	IIYMDRYMYR
SKELIRNKRE	CIRKLKEEIK	ILQQKLERYV	KYGSGPARFP	LPDMLKYVIE
FASTKPASES	CPPESDTHMT	LPLSSVHCSV	SDQTSKESTS	TESSSQDVES
TFSSPEDSLP	KSKPLTSSRS	SMEMPSQPAP	RTVTDEEINF	VKTCLQRWRS
EIEQDIQDLK	TCIASTTQTI	EQMYCDPLLR	QVPYRLHAVL	VHEGQANAGH
YWAYIYNQPR	QSWLKYNDIS	VTESSWEEVE	RDSYGGLRNV	SAYCLMYIND
KLPYFNAEAA	PTESDQMSEV	EALSVELKHY	IQEDNWRFEQ	EVEEWEEEQS
CKIPQMESST	NSSSQDYSTS	QEPSVASSHG	VRCLSSEHAV	IVKEQTAQAI
ANTARAYEKS	GVEAALSEVM	LSPAMQGVIL	AIAKARQTFD	RDGSEAGLIK
AFHEEYSRLY	QLAKETPTSH	SDPRLQHVLV	YFFQNEAPKR	VVERTLLEQF
ADKNLSYDER	SISIMKVAQA	KLKEIGPDDM	NMEEYKKWHE	DYSLFRKVSV
YLLTGLELYQ	KGKYQEALSY	LVYAYQSNAA	LLMKGPRRGV	KESVIALYRR
KCLLELNAKA	ASLFETNDDH	SVTEGINVMN	ELIIPCIHLI	INNDISKDDL
DAIEVMRNHW	CSYLGQDIAE	NLQLCLGEFL	PRLLDPSAEI	IVLKEPPTIR
PNSPYDLCSR	FAAVMESIQG	VSTVTVK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 doi:10.1093/dnares/7.2.143
Zhang D., Zaugg K., Mak T.W., Elledge S.J. (2006). A role for the deubiquitinating enzyme USP28 in control of the DNA-damage response. Cell. 126: 529—542. PMID 16901786 doi:10.1016/j.cell.2006.06.039
Popov N., Herold S., Llamazares M., Schulein C., Eilers M. (2007). Fbw7 and Usp28 regulate myc protein stability in response to DNA damage. Cell Cycle. 6: 2327—2331. PMID 17873522 doi:10.4161/cc.6.19.4804
Li Q., Kluz T., Sun H., Costa M. (2009). Mechanisms of c-myc degradation by nickel compounds and hypoxia. PLoS ONE. 4: E8531—E8531. PMID 20046830 doi:10.1371/journal.pone.0008531
Serra R.W., Fang M., Park S.M., Hutchinson L., Green M.R. (2014). A KRAS-directed transcriptional silencing pathway that mediates the CpG island methylator phenotype. Elife. 3: E02313—E02313. PMID 24623306 doi:10.7554/eLife.02313

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12625 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2015. Процитовано 19 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-11 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q96RU2 (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2018. Процитовано 19 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12625 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2015. Процитовано 19 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-11 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q96RU2 (англ.) . Архів оригіналу за 20 травня 2018. Процитовано 19 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]