Variant Delta del SARS-CoV-2

Països amb casos confirmats de variant Delta a partir del 10 d'agost de 2021 (GISAID)
Llegenda:
  10,000+ seqüències confirmades
  5.000–9.999 seqüències confirmades
  1.000–4.999 seqüències confirmades
  100–999 seqüències confirmades
  10–99 seqüències confirmades
  1-9 seqüències confirmades
  Cap o sense dades

La variant Delta, també coneguda com a llinatge B.1.617.2, és una variant del llinatge B.1.617 del SARS-CoV-2, una variant preocupant del SARS-CoV-2,[1] el virus que provoca la COVID-19. Es va detectar per primera vegada a l'Índia a finals del 2020.[2][3] L'Organització Mundial de la Salut (OMS) va anomenar-la variant Delta el 31 de maig de 2021.[4]

Té mutacions en el gen que codifica la proteïna S del SARS-CoV-2[5] causant les substitucions T478K, P681R i L452R,[6] que se sap que afecten la transmissibilitat del virus, així com si pot ser neutralitzat per anticossos per variants circulants prèviament del virus COVID-19.[7] Public Health England (PHE) al maig del 2021 va observar que les taxes d'atac secundari eren un 51-67% més altes que la variant Alfa.[8]

El 7 de maig de 2021, PHE va canviar la seva classificació del llinatge B.1.617.2 d'una variant sota investigació (VUI) a una variant preocupant (VOC) basada en una avaluació de la transmissibilitat que era almenys equivalent a B.1.1.7 (Alfa[9] de la SAGE del Regne Unit que utilitza dades de maig va estimar una possibilitat "realista" de ser un 50% més transmissible.[10] L'11 de maig de 2021, l'OMS també va classificar aquest llinatge COV i va dir que mostrava evidències d'una major transmissibilitat i una neutralització reduïda. El 15 de juny de 2021, els Centres per al Control i Prevenció de Malalties (CDC) van declarar Delta una variant preocupant.[11]

Es creu que la variant és en part responsable de la segona onada de pandèmia de l'Índia a partir del febrer de 2021.[12][13][14] Posteriorment, va contribuir a una tercera onada a Fiji, el Regne Unit[15][16][17] i Sud-àfrica,[18] i l'OMS va advertir el juliol de 2021 que podria tenir un efecte similar en altres llocs d'Europa i Àfrica.[19][18] A finals de juliol també havia impulsat un augment de les infeccions diàries a parts d'Àsia,[20] Estats Units,[21] i Austràlia.[22]

El 24 d'agost de 2021, la variant s'havia estès a 163 països,[23] i l'OMS va indicar que s'estava convertint en la soca dominant a nivell mundial.[24]

Perfil genètic

Referències

  1. ↑ «Confirmed cases of COVID-19 variants identified in UK». , 15 abril 2021. Aquest article incorpora text publicat sota l'Open Government Licence britànica  v3.0.
  2. ↑ «Tracking of Variants». GISAID, 26 abril 2021.
  3. ↑ «Expert reaction to cases of variant B.1.617 (the 'Indian variant') being investigated in the UK». Science Media Centre.
  4. ↑ «Covid: WHO renames UK and other variants with Greek letters». BBC News, 31-05-2021.
  5. ↑ Shang, Jian; Yushun, Wan; Lou, Chuming; Ye, Gang; Geng, Qibin; Auerbach, Ashley; Fang, Li «Cell entry mechanisms of SARS-CoV-2». Proceedings of the National Academy of Sciences, 117, 21, 2020, p. 11727–11734. DOI: 10.1073/pnas.2003138117. PMC: 7260975. PMID: 32376634.
  6. ↑ «expert reaction to VUI-21APR-02/B.1.617.2 being classified by PHE as a variant of concern», 07-05-2021.
  7. ↑ Starr, Tyler N.; Greaney, Allison J.; Dingens, Adam S.; Bloom, Jesse D. «Complete map of SARS-CoV-2 RBD mutations that escape the monoclonal antibody LY-CoV555 and its cocktail with LY-CoV016». Cell Reports Medicine, 2, 4, 4-2021, p. 100255. DOI: 10.1016/j.xcrm.2021.100255. PMC: 8020059. PMID: 33842902.
  8. ↑ «SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England» (en anglès) p. 8, 19-06-2021. Aquest article incorpora text publicat sota l'Open Government Licence britànica  v3.0.
  9. ↑ «Confirmed cases of COVID-19 variants identified in UK», 7 maig 2021. Arxivat de l'original el 7 maig 2021. Aquest article incorpora text publicat sota l'Open Government Licence britànica  v3.0.
  10. ↑ «Is The Variant From India The Most Contagious Coronavirus Mutant On The Planet?». NPR, 14 maig 2021. cited «Eighty-ninth SAGE meeting on COVID-19, 13 May 2021 (Held via Video Teleconference)». UK Government, 13 maig 2021.
  11. ↑ «06/15/2021: Lab Advisory: CDC Classifies SARS-CoV-2 Variant B.1.617.2 (Delta) a Variant of Concern». CDC, 15 juny 2021.
  12. ↑ WHO labels a Covid strain in India as a 'variant of concern' — here's what we know, CNBC, 11 May 2021.
  13. ↑ "WHO says India Covid variant of 'global concern", BBC News, 11 May 2021.
  14. ↑ "India's second COVID-19 wave", The Wire Science, 22 April 2021.
  15. ↑ Mishra, Swapnil; Mindermann, Sören; Sharma, Mrinank; Whittaker, Charles; Mellan, Thomas A.; Wilton, Thomas; Klapsa, Dimitra; Mate, Ryan; Fritzsche, Martin «Changing composition of SARS-CoV-2 lineages and rise of Delta variant in England» (en anglès). EClinicalMedicine, 39, 01-09-2021. DOI: 10.1016/j.eclinm.2021.101064. ISSN: 2589-5370. PMID: 34401689.
  16. ↑ Callaway, Ewen «Delta coronavirus variant: scientists brace for impact» (en anglès). Nature, 595, 7865, 22 juny 2021, p. 17–18. DOI: 10.1038/d41586-021-01696-3. PMID: 34158664.
  17. ↑ Rob Picheta. «Britain thinks it can out-vaccinate the Delta variant. The world isn't so sure», 30 juny 2021.
  18. 1 2 «Health service buckling as third coronavirus wave fuelled by Delta variant sweeps across South Africa» (en anglès), 4 juliol 2021.
  19. ↑ Ellyatt, Holly. «New Covid wave could be imminent as delta variant sweeps Europe, WHO says» (en anglès), 1 juliol 2021.
  20. ↑ «Delta variant: Which Asian countries are seeing rising cases?» (en anglès). BBC News, 19 juliol 2021.
  21. ↑ «US in 'another pivotal moment' as Delta variant drives surge in Covid cases» (en anglès), 23 juliol 2021.
  22. ↑ «New Zealand suspends quarantine-free travel bubble with Australia» (en anglès), 23 juliol 2021.
  23. ↑ «Weekly epidemiological update on COVID-19 - 24 August 2021», 24 agost 2021.
  24. ↑ «WHO Director-General's opening remarks at the 8th meeting of the IHR Emergency Committee on COVID-19 - 14 July 2021». WHO, 14 juliol 2021. Arxivat de l'original el 15 juliol 2021. «The Delta variant is now in more than 111 countries and we expect it to soon be the dominant COVID-19 strain circulating worldwide, if it isn’t already.»
  25. ↑ Spike Variants: Delta variant, aka B.1.617.2 24 June 2021, covdb.stanford.edu, accessed 1 July 2021
This article is issued from Viquipèdia. The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.