Holomycota

Holomycota
Nuclearia thermophila
Intervallo geologico
Paleozoico - Medio Ordoviciano (460 Ma) - recente
Classificazione scientifica
DominioEukaryota
SottodominioUnikonta o Amorphea
SupergruppoObazoa[1]
GruppoOpisthokonta
SottogruppoHolomycota
Regni
Cristidiscoidea

Gli Holomycota o Olomicoti[2] o Nucletmycea è un sottogruppo basale, o primitivo, del gruppo Opisthokonta, e costituisce il clade fratello dell'altro sottogruppo Holozoa.

Contiene due Regni:

  • Cristidiscoidea, o Nucleariidae
  • Fungi.

Cristidiscoidea è costituito da organismi unicellulari Fagatrofi amoeboidi,[3], considerati il lignaggio più antico degli Holomycota. Questi comprendono le due divisioni Nucleariida, una sorta di amebe fagotrofe, e i Fonticula, una sorta di muffa mucillaginosa cellulare, comprendente una sola specie: Fonticula alba).

Il Regno Fungi, invece (qualcuno lo considera un raggruppamento in senso lato, una sorta di superregno o microgruppo) L. 1753, dal latino) o miceti[4] (dal greco antico μύκης?, mýkēs) è costituito da organismi eucarioti, unicellulari e pluricellulari, comprendente più di 700 000 specie conosciute, benché la diversità sia stata stimata in più di 3 milioni di specie.[5]

Dunque Holomycota costituisce un sottogruppo basale, fratello del sottogruppo degli Holozoa, comprendente Animali ed altri microrganismi, entrambi contenuti nel gruppo Opisthokonta, comprendente Animali, Funghi e altri microorganismi simili.

Ciò suggerisce che animali e funghi abbiano acquisito indipendentemente la complessa multicellularità da un antenato unicellulare comune e che lo stile di vita osmotrofico (una delle caratteristiche distintive dei funghi) si sia originato successivamente nella divergenza di questo lignaggio eucariotico.

Alcuni hanno anche proposto un terzo regno compreso negli Holomycota, incluso attualmente in quello dei Funghi: gli Opisthosporidia, un gruppo tassonomico proposto di recente che include i Microsporidia, i Rozellomyceta[6] e i Cryptomycota, tre gruppi di endoparassiti.[7]

Rozella (Cryptomycota) è il genere fungino a divergenza più antica in cui è stata osservata la chitina almeno in alcune fasi del suo ciclo vitale,[7] sebbene la parete cellulare chitinosa (un altro segno distintivo dei funghi) e l'Osmotrofia abbiano avuto origine in un antenato comune di Blastocladiomycota e Chytridiomycota, che contengono ancora alcune caratteristiche ancestrali come il flagello nello stadio zoosporico.[8] I gruppi di funghi con la caratteristica crescita ifale, Zoopagomycota, Mucoromycotina e Dikarya, hanno avuto origine da un antenato comune ~700 milioni di anni fa.[8] Gli Zoopagomycota sono per lo più patogeni di animali o altri funghi, i Mucoromycotina sono un gruppo più diversificato che include parassiti, saprofiti o ectomicorrizici.[7] I Dikarya sono il gruppo che comprende Ascomycota e Basidiomycota, che comprendono ~98% delle specie fungine descritte.[8] A causa di questa ricca diversità, Dikarya comprende gruppi morfologicamente molto distinti, dalle ife o lieviti unicellulari (come l'organismo modello Saccharomyces cerevisiae) ai complessi funghi multicellulari popolarmente noti come funghi.[8]

Contrariamente agli animali e alle piante terrestri con multicellularità complessa, le relazioni filogenetiche inferite indicano che i funghi hanno acquisito e perso la multicellularità più volte lungo l'evoluzione di Ascomycota e Basidiomycota.[9]

Filogenesi

L'albero filogenetico degli Holomycota comprende i funghi e la loro stretta relazione con altri organismi, basandosi sul lavoro di Philippe Silar[10] e su "The Mycota: A Comprehensive Treatise on Fungi as Experimental Systems for Basic and Applied Research".[11][12] L'albero degli Olomicoti riportato qui sotto fu proposto da Tedersoo et al.[13][14][15]

Holomycota
Cristidiscoidea
 

Fonticulida

 
 

Nuclearida

 
 
Fungi
 

Ascomycota

 
 

Basidiomycota

 
 

Chytridiomycota

 
 

Zygomycota

 
 

Glomeromycota

 
 

Cryptomycota

 
 
 

Note

  1. ↑ (EN) Matthew W. Brown, Susan C. Sharpe, Jeffrey D. Silberman, Aaron A. Heiss, B. Franz Lang, Alastair G. B. Simpson e Andrew J. Roger, Phylogenomics demonstrates that breviate flagellates are related to opisthokonts and apusomonads, in Proceedings of the Royal Society of London B: Biological Sciences, vol. 280, n. 1769, 22 ottobre 2013, p. 20131755, DOI:10.1098/rspb.2013.1755, ISSN 0962-8452, PMC 3768317, PMID 23986111.
  2. ↑ Lowell Lindgren, De Luca [Di Luca], Severo, Oxford Music Online, Oxford University Press, 2001, DOI:10.1093/gmo/9781561592630.article.17095.
  3. ↑ David López-Escardó, Purificación López-García, David Moreira, Iñaki Ruiz-Trillo e Guifré Torruella, Parvularia atlantis gen. et sp. nov., a Nucleariid Filose Amoeba (Holomycota, Opisthokonta), in Journal of Eukaryotic Microbiology, vol. 65, n. 2, 12 agosto 2017, pp. 170–179, DOI:10.1111/jeu.12450, ISSN 1550-7408, PMC 5708529, PMID 28741861.
  4. ↑ Tiziano Cornegliani, Ugo Scaioni e Bianca Venturini, Enciclopedia della Medicina, Vittorio Monzini e Marco Volpati, Mondolibri S.p.A., Novara, De Agostini Editore S.p.A, 2003, p. 195.
  5. ↑ (EN) Heath E. O'Brien, Jeri Lynn Parrent, Jason A. Jackson, Jean-Marc Moncalvo e Rytas Vilgalys, Fungal Community Analysis by Large-Scale Sequencing of Environmental Samples, in Applied and Environmental Microbiology, vol. 71, n. 9, 2005, pp. 5544–5550, DOI:10.1128/AEM.71.9.5544-5550.2005, ISSN 0099-2240. URL consultato l'8 gennaio 2024 (archiviato il 20 luglio 2023).
  6. ↑ Sergey Karpov, Maria A. Mamkaeva, Vladimir Aleoshin, Elena Nassonova, Osu Lilje e Frank H. Gleason, Morphology, phylogeny, and ecology of the aphelids (Aphelidea, Opisthokonta) and proposal for the new superphylum Opisthosporidia, in Frontiers in Microbiology, vol. 5, 2014, p. 112, Bibcode:2014FrMic...500112K, DOI:10.3389/fmicb.2014.00112, PMC 3975115, PMID 24734027.
  7. 1 2 3 Mary L. Berbee, Timothy Y. James e Christine Strullu-Derrien, Early Diverging Fungi: Diversity and Impact at the Dawn of Terrestrial Life, in Annual Review of Microbiology, vol. 71, n. 1, 8 settembre 2017, pp. 41–60, DOI:10.1146/annurev-micro-030117-020324, PMID 28525299.
  8. 1 2 3 4 Jason E. Stajich, Mary L. Berbee, Meredith Blackwell, David S. Hibbett, Timothy Y. James, Joseph W. Spatafora e John W. Taylor, The Fungi, in Current Biology, vol. 19, n. 18, 29 settembre 2009, pp. R840–R845, Bibcode:2009CBio...19.R840S, DOI:10.1016/j.cub.2009.07.004, PMC 2913116, PMID 19788875.
  9. ↑ Tu Anh Nguyen, Ousmane H. Cissé, Jie Yun Wong, Peng Zheng, David Hewitt, Minou Nowrousian, Jason E. Stajich e Gregory Jedd, Innovation and constraint leading to complex multicellularity in the Ascomycota, in Nature Communications, vol. 8, 8 febbraio 2017, Bibcode:2017NatCo...814444N, DOI:10.1038/ncomms14444, PMC 5309816, PMID 28176784.
  10. ↑ Silar P, Protistes Eucaryotes: Origine, Evolution et Biologie des Microbes Eucaryotes, HAL, 2016, p. 462, ISBN 978-2-9555841-0-1.
  11. ↑ Esser K, The Mycota VII A: Systematics and Evolution (2nd ed.), Springer, 2014, p. 461, ISBN 978-3-642-55317-2.
  12. ↑ (EN) David Bass, Lucas Czech, Bryony A. P. Williams, Cédric Berney, Micah Dunthorn, Frederic Mahé, Guifré Torruella, Grant D. Stentiford e Tom A. Williams, Clarifying the Relationships between Microsporidia and Cryptomycota, in Journal of Eukaryotic Microbiology, vol. 65, n. 6, 28 aprile 2018, pp. 773–782, Bibcode:2018JEukM..65..773B, DOI:10.1111/jeu.12519, ISSN 1066-5234, PMC 6282948, PMID 29603494.
  13. ↑ (EN) Leho Tedersoo, Santiago Sánchez-Ramírez, Urmas Kõljalg, Mohammad Bahram, Markus Döring, Dmitry Schigel, Tom May, Martin Ryberg e Kessy Abarenkov, High-level classification of the Fungi and a tool for evolutionary ecological analyses, in Fungal Diversity, vol. 90, n. 1, 2018, pp. 135–159, DOI:10.1007/s13225-018-0401-0, ISSN 1560-2745, hdl:10138/238983.
  14. ↑ (EN) Purificacion Lopez-Garcia, Eckhard Volcker, Arnau Sebe-Pedros, John Burns, Sergey A. Karpov, David Moreira, Xavier Grau-Bove e Guifre Torruella, Global transcriptome analysis of the aphelid Paraphelidium tribonemae supports the phagotrophic origin of fungi, in Communications Biology, vol. 1, 2018, DOI:10.1038/s42003-018-0235-z, PMC 6299283, PMID 30588510.
  15. ↑ Luis Javier Galindo, Guifré Torruella, Purificación López-García, Maria Ciobanu, Ana Gutiérrez-Preciado, Sergey A Karpov e David Moreira, Phylogenomics Supports the Monophyly of Aphelids and Fungi and Identifies New Molecular Synapomorphies, in Systematic Biology, vol. 72, n. 3, 2023, pp. 505–515, DOI:10.1093/sysbio/syac054, PMID 35900180.

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