La stagione 2006 dei New York Jets è stata la 37ª della franchigia nella National Football League, la 47ª complessiva.[1] Fu anche la prima stagione col debuttante capo-allenatore Eric Mangini, che Herman Edwards lasciò la squadra per allenare i Kansas City Chiefs. Nonostante le aspettative modeste, la squadra terminò con un record di 10–6, vincendo cinque delle ultime sei fare, centrando un posto nei playoff. Nel primo turno fu eliminata dai Patriots per 37–16.
Il primo ruolo è il principale mentre gli eventuali successivi indicano i ruoli secondari.
(IR) sta per Injured Reserve ed indica la lista per i giocatori infortunati. Un giocatore inserito in questa lista può tornare nel roster attivo dopo un minimo di quattro gare. In una stagione al massimo otto giocatori possono essere riportati da questa lista al roster attivo.
(NF-Inj.) / (NF-Ill.) stanno rispettivamente per Non-Football Injured e Non-Football Illness ed indicano le liste dove viene inserito un giocatore che ha un infortunio o una malattia non dipendente dal football americano. I giocatori inseriti in queste liste possono essere riportati in prima squadra con le stesse regole del'IR.
(PUP) sta per Physically Unable to Perform ed indica la lista dove viene inserito un giocatore mentre è in attesa di recuperare la condizione fisica prima dell'avvio della stagione. Dopo l'inizio della stagione regolare un giocatore può essere riportato nel roster attivo solo dopo le prime quattro gare. Quando un giocatore è designato per ritornare da questa lista ha poi un massimo di tre settimane di tempo per allenarsi prima di essere riportato in prima squadra o eventualmente mantenuto fuori.