Le qualificazioni del doppio dello Sybase Open 1999 sono state un torneo di tennis preliminare per accedere alla fase finale della manifestazione. I vincitori dell'ultimo turno sono entrati di diritto nel tabellone principale. In caso di ritiro di uno o più giocatori aventi diritto a questi sono subentrati i lucky loser, ossia i giocatori che hanno perso nell'ultimo turno ma che avevano una classifica più alta rispetto agli altri partecipanti che avevano comunque perso nel turno finale.
Le qualificazioni del doppio del torneo Sybase Open 1999 prevedevano 4 coppie partecipanti di cui una è entrata nel tabellone principale.
Tabellone
Legenda
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- w/o = Walkover
- r = Ritirato
- d = Squalificato
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Tennis
Doug Flach / 
Paul Kilderry (ultimo turno)
Aleksandar Kitinov / 
Nenad Zimonjić (Qualificati)
Takao Suzuki