David Baker

David Baker
Nascimento6 de outubro de 1962
Seattle
CidadaniaEstados Unidos
CônjugeHannele Ruohola-Baker
Alma mater
Ocupaçãobioinformata, bioquímico, professor universitário, computational biologist, biochemistry teacher
Distinções
Empregador(a)Universidade de Washington, University of Washington School of Medicine
Orientador(a)(es/s)Randy Schekman
Página oficial
https://sites.uw.edu/biochemistry/faculty/david-baker/, https://www.bakerlab.org/

David Baker (Seattle, 6 de outubro de 1962)[1] é um bioquímico estadunidense, biólogo computacional e vencedor do Nobel que foi pioneiro em métodos para projetar proteínas e prever suas estruturas tridimensionais. Ele é professor dotado de Bioquímica Henrietta e Aubrey Davis, investigador do Instituto Médico Howard Hughes e professor adjunto de ciências do genoma, bioengenharia, engenharia química, ciência da computação e física na Universidade de Washington. Ele foi laureado com o Prêmio Nobel de Química de 2024 "pelo design computacional de proteínas".[2]

Os programas de inteligência artificial desenvolvidos por Baker e outros resolveram agora em grande parte o problema da previsão da estrutura das proteínas.[3][4] Baker é membro da Academia Nacional de Ciências dos Estados Unidos e diretor do Instituto de Design de Proteínas da Universidade de Washington.[5] Baker foi cofundador de mais de uma dúzia de empresas de biotecnologia e foi incluído na lista inaugural da revista Time das 100 pessoas mais influentes na saúde em 2024.[6]

Pesquisa

Embora seja conhecido principalmente pelo desenvolvimento de métodos computacionais para prever e projetar as estruturas e funções de proteínas, Baker mantém um grupo ativo de bioquímica experimental.[7] Ele é autor de mais de 600 artigos científicos.[8]

O grupo de Baker desenvolveu o algoritmo Rosetta para a previsão ab initio de estrutura de proteína, que foi expandido para uma ferramenta de design de proteínas, um projeto de computação distribuída chamado Rosetta@Home,[7][9][10] e o jogo de computador Foldit.[11][12][13] Baker foi diretor do Rosetta Commons, um consórcio de laboratórios e pesquisadores que desenvolvem software para previsão e design de estruturas biomoleculares. O grupo de Baker participa regularmente da competição de previsão de estrutura CASP, especializando-se em métodos ab initio, incluindo variantes manuais e automatizadas do protocolo Rosetta.[14][15]

O grupo de Baker também é ativo no campo de design de proteínas;[7][16] eles são conhecidos por projetar a Top7, a primeira proteína artificial com uma nova dobra.[17]

Em 2017, o Instituto de Design de Proteínas de Baker recebeu mais de 11 milhões de dólares da Open Philanthropy,[18][19] seguido por uma doação adicional de 3 milhões de dólares em 2021.[20]

Baker cofundou várias empresas de biotecnologia, incluindo a Prospect Genomics, que foi adquirida por uma subsidiária da Eli Lilly em 2001, Icosavax, que foi adquirida pela AstraZeneca em 2023, Sana Biotechnology, Lyell Immunotherapeutics e Xaira Therapeutics.[21][22]

Referências

  1. ↑ Howes, Laura. «Protein wrangler, serial entrepreneur, and community builder». Chemical & Engineering News. 97 (30)
  2. ↑ «The Nobel Prize in Chemistry 2024». The Nobel Prize. 9 de outubro de 2024. Consultado em 9 de outubro de 2024
  3. ↑ «Protein structures for all». Science (em inglês). American Association for the Advancement of Science. 16 de dezembro de 2021. Consultado em 30 de setembro de 2024
  4. ↑ «How AI Revolutionized Protein Science, but Didn't End It». Quanta Magazine (em inglês). Simons Foundation. 26 de junho de 2024. Consultado em 30 de setembro de 2024
  5. ↑ «UW to Establish Institute for Protein Design» (em inglês). University of Washington. Consultado em 14 de janeiro de 2019
  6. ↑ Henshall, Will (2 de maio de 2024). «David Baker». Time (em inglês). Time Magazine. Consultado em 30 de setembro de 2024
  7. 1 2 3 Howes, Laura. «Protein wrangler, serial entrepreneur, and community builder». Chemical & Engineering News. 97 (30)
  8. ↑ «David Baker». scholar.google.com. Consultado em 10 de outubro de 2024
  9. ↑ Castillo, Oscar; Melin, Patricia; Kacprzyk, Janusz, eds. (2018). Fuzzy Logic Augmentation of Neural and Optimization Algorithms: Theoretical Aspects and Real Applications. [S.l.]: Springer. p. 455. ISBN 9783319710075. Consultado em 2 de agosto de 2018. Cópia arquivada em 9 de outubro de 2024
  10. ↑ Bonneau, Richard; Ruczinski, Ingo; Tsai, Jerry; Baker, David (agosto de 2002). «Contact order and ab initio protein structure prediction». Protein Science. 11 (8): 1937–1944. PMC 2373674Acessível livremente. PMID 12142448. doi:10.1110/ps.3790102
  11. ↑ Hand, E. (2010). «Citizen science: People power». Nature. 466 (7307): 685–687. PMID 20686547. doi:10.1038/466685aAcessível livremente
  12. ↑ Cooper, S.; Khatib, F.; Treuille, A.; Barbero, J.; Lee, J.; Beenen, M.; Leaver-Fay, A.; Baker, D.; Popović, Z.; Players, F. (2010). «Predicting protein structures with a multiplayer online game». Nature. 466 (7307): 756–760. Bibcode:2010Natur.466..756C. PMC 2956414Acessível livremente. PMID 20686574. doi:10.1038/nature09304
  13. ↑ Marshall, Jessica (22 de janeiro de 2012). «Victory for crowdsourced biomolecule design». Nature Publishing Group. Consultado em 30 de setembro de 2024. Cópia arquivada em 4 de fevereiro de 2024
  14. ↑ Dimaio, F.; Terwilliger, T. C.; Read, R. J.; Wlodawer, A.; Oberdorfer, G.; Wagner, U.; Valkov, E.; Alon, A.; Fass, D.; Axelrod, H. L.; Das, D.; Vorobiev, S. M.; Iwaï, H.; Pokkuluri, P. R.; Baker, D. (2011). «Improved molecular replacement by density- and energy-guided protein structure optimization». Nature. 473 (7348): 540–3. Bibcode:2011Natur.473..540D. PMC 3365536Acessível livremente. PMID 21532589. doi:10.1038/nature09964
  15. ↑ Qian, B.; Raman, S.; Das, R.; Bradley, P.; McCoy, A. J.; Read, R. J.; Baker, D. (2007). «High-resolution structure prediction and the crystallographic phase problem». Nature. 450 (7167): 259–64. Bibcode:2007Natur.450..259Q. PMC 2504711Acessível livremente. PMID 17934447. doi:10.1038/nature06249
  16. ↑ Zimmer, Carl (26 de dezembro de 2017). «Scientists Are Designing Artisanal Proteins for Your Body». The New York Times. Consultado em 2 de agosto de 2018. Cópia arquivada em 2 de agosto de 2018
  17. ↑ Kuhlman, Brian; Dantas, Gautam; Ireton, Gregory C.; Varani, Gabriele; Stoddard, Barry L.; Baker, David (21 de novembro de 2003). «Design of a Novel Globular Protein Fold with Atomic-Level Accuracy». Science. 302 (5649): 1364–1368. Bibcode:2003Sci...302.1364K. PMID 14631033. doi:10.1126/science.1089427
  18. ↑ «Open Philanthropy awards $11.3 million to the Institute for Protein Design». Institute for Protein Design (em inglês). 4 de abril de 2018. Consultado em 9 de outubro de 2024
  19. ↑ «University of Washington — Universal Flu Vaccine and Computational Protein Design (David Baker and Neil King)». Open Philanthropy (em inglês). Novembro de 2017. Consultado em 9 de outubro de 2024
  20. ↑ «University of Washington — Protein Design Research (David Baker)». Open Philanthropy (em inglês). Consultado em 9 de outubro de 2024
  21. ↑ Hamilton, David (2001). «Structural GenomiX to Acquire Research Firm Prospect Genomics». Consultado em 15 de setembro de 2024. Cópia arquivada em 9 de outubro de 2024
  22. ↑ Soper, Taylor (12 de dezembro de 2023). «AstraZeneca will pay up to $1.1B to acquire Icosavax, a Univ. of Washington biotech spinout». GeekWire. Consultado em 1 de outubro de 2024. Cópia arquivada em 15 de julho de 2024

Ligações externas

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