Variante Gama do SARS-CoV-2

Variante Gama do SARS-CoV-2
Variante da SARS-CoV-2 vírus responsável pela COVID-19 e sua pandemia
Nome científico P1
Apelido Variante Gamma
Primeira detecção em  Brasil
Variante de Preocupação (VOC)? Sim
Variante de Interesse (VOI)? Sim
Resistencia á vacinação Sem indícios
Legenda do mapa
  •   1,000+ casos confirmados
  •   500–999 casos confirmados
  •   100–499 casos confirmados
  •   2–99 casos confirmados
  •   1 caso confirmado
  •   Nenhum dado
Dados expostos no mapa é de 21 de Abril 2021

A linhagem P.1 ou variante Gama é uma das variantes do SARS-CoV-2, o vírus causador do COVID-19.[1] Esta variante do SARS-CoV-2 foi chamada de linhagem P.1 e tem 17 alterações exclusivas de aminoácidos, 10 das quais na sua proteína de pico, incluindo N501Y e E484K .[2] Esta variante do SARS-CoV-2 foi detectada pela primeira vez pelo Instituto Nacional de Doenças Infecciosas (NIID), no Japão, no dia 6 de janeiro de 2021 em quatro pessoas que chegaram a Tóquio depois de visitar a região do Amazonas, no Brasil, quatro dias antes.[3] Posteriormente, foi declarada como estando em circulação no Brasil.

Provocou infecção generalizada na cidade de Manaus, apesar de a cidade já ter passado por uma infecção generalizada em maio[4] com um estudo[5] indicando alta soroprevalência de anticorpos para SARS-CoV-2.[6] P.1 também foi chamada de 'B.1.1.28.1',[7] embora estritamente apenas três subníveis sejam permitidos no sistema de nomenclatura da linhagem PANGO, daí a designação 'P.1'.[8]

Pesquisa

Em 12 de janeiro de 2021, o Centro CADDE Brasil-Reino Unido confirmou 13 casos locais da linhagem P.1 em Manaus, estado do Amazonas, a maior cidade da floresta amazónica.[8] A nova linhagem esteve ausente nas amostras de março a novembro de Manaus, mas foi identificada em 42% das amostras de dezembro de 2020 coletadas na mesma cidade, sugerindo um aumento recente na frequência.[9]

Uma pré-publicação de um artigo de Carolina M Voloch et al. descreve as relações entre amostras brasileiras sequenciadas durante 2020 e identificou uma nova linhagem de SARS-CoV-2, 'B.1.1.248', em circulação no Brasil, que se originou a partir da B.1.1.28. É descrita como emergindo pela primeira vez em julho e detectado por eles mesmos em outubro, mas a partir da publicação (dezembro de 2020), embora tenha aumentado significativamente em frequência, ainda estava amplamente (61% dos casos) confinada à capital do estado do Rio de Janeiro .[10] Em maio, a maioria das suas amostras foram da linhagem B.1.1.33, enquanto em setembro houve uma disseminação significativa da B.1.1.28, e durante outubro e novembro a P.1 predominou sobre, respectivamente, 3 e 4 outras classificações usando a ferramenta Pangolin.[11] O artigo identifica a alteração E484K (presente em B.1.1.28 e P.1) como "amplamente difundida" nas amostras (por exemplo, 36 das 38 amostras num conjunto).

Ver também

Referências

  1. ↑ Third concerning coronavirus variant should be a 'wake up call' to the world, experts warn 12 January 2021 www.telegraph.co.uk, accessed 17 January 2021
  2. ↑ COG-UK Report on SARS-CoV-2 Spike mutations of interest in the UK www.cogconsortium.uk, Accessed 25 January 2021
  3. ↑ «Japan finds new coronavirus variant in travelers from Brazil». Japan Today. Japan. 11 de janeiro de 2021. Consultado em 14 de janeiro de 2021
  4. ↑ Matt Rivers. «Is a new coronavirus variant to blame for this Brazilian city's collapse?». CNN. Consultado em 31 de janeiro de 2021
  5. ↑ Buss, Lewis F.; Prete, Carlos A.; Abrahim, Claudia M. M.; Mendrone, Alfredo; Salomon, Tassila; de Almeida-Neto, Cesar; França, Rafael F. O.; Belotti, Maria C.; Carvalho, Maria P. S. S.; et al. (8 de dezembro de 2020). «Three-quarters attack rate of SARS-CoV-2 in the Brazilian Amazon during a largely unmitigated epidemic». American Association for the Advancement of Science. Science. 371: 288–292. ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.abe9728Acessível livremente
  6. ↑ Sabino, Ester C.; Buss, Lewis F.; Carvalho, Maria P. S.; Prete, Carlos A.; Crispim, Myuki A. E.; Fraiji, Nelson A.; Pereira, Rafael H. M.; Parag, Kris V.; Peixoto, Pedro da Silva (27 de janeiro de 2021). «Resurgence of COVID-19 in Manaus, Brazil, despite high seroprevalence». The Lancet (em inglês). 0. ISSN 0140-6736. doi:10.1016/S0140-6736(21)00183-5Acessível livremente
  7. ↑ Marlúcia Seixas (25 de janeiro de 2021). «Fiocruz Amazon confirms reinfection by a new variation of the Sars-CoV-2». Fiocruz Amazon. Fiocruz, Oswaldo Cruz Foundation
  8. 1 2 Faria, Nuno R.; et al. (12 de janeiro de 2021). «Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings». Virological (em inglês). Consultado em 23 de janeiro de 2021
  9. ↑ Danner, Chas (25 de janeiro de 2021). «What We Know About the New P.1 Strain of the Coronavirus». nymag.com. Consultado em 28 de janeiro de 2021
  10. ↑ Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil (Abstract) Carolina M Voloch et al. via www.medrxiv.org, accessed 15 January 2021 doi.org/10.1101/2020.12.23.20248598
  11. ↑ Voloch, Carolina M.; et al. (2020). "Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil". Figure 5. Retrieved 15 January 2021. doi:10.1101/2020.12.23.20248598 – via MedRxiv.
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