TUBB3

TUBB3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	5IJ0, 5JCO, 5IJ9
Ідентифікатори
Символи	TUBB3, CDCBM, CDCBM1, CFEOM3, CFEOM3A, FEOM3, TUBB4, beta-4, tubulin beta 3 class III
Зовнішні ІД	OMIM: 602661 MGI: 107813 HomoloGene: 68503 GeneCards: TUBB3
Пов'язані генетичні захворювання
	congenital fibrosis of the extraocular muscles, complex cortical dysplasia with other brain malformations 1
Реагує на сполуку
	combrestatin A-4
	velban
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • GTP binding; • structural constituent of cytoskeleton; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0006184 GTPase activity; • netrin receptor binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • мікротрубочка; • екзосома; • цитоскелет; • клітинне ядро; • microtubule cytoskeleton; • дендрит (нейробіологія); • аксон; • lamellipodium; • Філоподія; • growth cone; • cell projection;
Біологічний процес	• microtubule-based process; • cytoskeleton organization; • axon guidance; • microtubule cytoskeleton organization; • GO:0007067 мітоз; • neuron differentiation; • netrin-activated signaling pathway; • dorsal root ganglion development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	10381
	22152
	ENSG00000258947
	ENSMUSG00000062380
	Q13509
	Q9ERD7
	NM_006086; NM_001197181
	NM_023279
	NP_001184110; NP_006077
	NP_075768
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TUBB3 (англ. Tubulin beta 3 class III) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[6] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 450 амінокислот, а молекулярна маса — 50 433^[7].

Культура нейронів переднього мозку після 40 днів диференціації індукованих плюрипотентних стовбурових клітин людини. iPSC від пацієнтrb з сімейною хворобою Альцгеймера, мутацією в гені PSEN1. TUJ 1 - позитивні клітини експресують маркер (β3-тубулін) зрілих нейронів (червоний). GABA-позитивні клітини (зелений). Клітинні ядра забарвлюються DAPI (синім).

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MREIVHIQAG	QCGNQIGAKF	WEVISDEHGI	DPSGNYVGDS	DLQLERISVY
YNEASSHKYV	PRAILVDLEP	GTMDSVRSGA	FGHLFRPDNF	IFGQSGAGNN
WAKGHYTEGA	ELVDSVLDVV	RKECENCDCL	QGFQLTHSLG	GGTGSGMGTL
LISKVREEYP	DRIMNTFSVV	PSPKVSDTVV	EPYNATLSIH	QLVENTDETY
CIDNEALYDI	CFRTLKLATP	TYGDLNHLVS	ATMSGVTTSL	RFPGQLNADL
RKLAVNMVPF	PRLHFFMPGF	APLTARGSQQ	YRALTVPELT	QQMFDAKNMM
AACDPRHGRY	LTVATVFRGR	MSMKEVDEQM	LAIQSKNSSY	FVEWIPNNVK
VAVCDIPPRG	LKMSSTFIGN	STAIQELFKR	ISEQFTAMFR	RKAFLHWYTG
EGMDEMEFTE	AESNMNDLVS	EYQQYQDATA	EEEGEMYEDD	EEESEAQGPK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

Ranganathan S., Dexter D.W., Benetatos C.A., Hudes G.R. (1998). Cloning and sequencing of human betaIII-tubulin cDNA: induction of betaIII isotype in human prostate carcinoma cells by acute exposure to antimicrotubule agents. Biochim. Biophys. Acta. 1395: 237—245. PMID 9473684 doi:10.1016/S0167-4781(97)00168-1
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Valenstein M.L., Roll-Mecak A. (2016). Graded control of microtubule severing by tubulin glutamylation. Cell. 164: 911—921. PMID 26875866 doi:10.1016/j.cell.2016.01.019
Katsetos C.D., Legido A., Perentes E., Mork S.J. (2003). Class III beta-tubulin isotype: a key cytoskeletal protein at the crossroads of developmental neurobiology and tumor neuropathology. J. Child Neurol. 18: 851—866. PMID 14736079
Katsetos C.D., Legido A., Perentes E., Mork S.J. (2004). J. Child Neurol. 19: 531—531. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TUBB3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Tubulin beta 3 class III переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Tubulin beta-3 chain переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20772 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q13509 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

[1] Захворювання, генетично пов'язані з TUBB3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Tubulin beta 3 class III переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Сполуки, які фізично взаємодіють з Tubulin beta-3 chain переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[4] Human PubMed Reference:.

[5] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-6] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:20772 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-7] UniProt, Q13509 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]