CNOT1

CNOT1
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	4C0D, 4CQO, 4CRV, 4CRW, 4CT4, 4CT6, 4CT7, 4GMJ, 4GML, 4J8S, 5ANR, 5FU6, 5FU7
معرفات
أسماء بديلة	CNOT1, CDC39, NOT1, NOT1H, AD-005, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, HPE12, VIBOS
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 604917 MGI: MGI:2442402 HomoloGene: 9453 GeneCards: 23019
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية	• poly(A)-specific ribonuclease activity; • protein domain specific binding; • GO:0001948، GO:0016582 ربط بروتيني; • retinoic acid receptor binding; • armadillo repeat domain binding; • GO:0032947 molecular adaptor activity; • estrogen receptor binding; • RNA binding;
مكونات خلوية	• غشاء; • CCR4-NOT complex; • peroxisomal membrane; • أجسام P; • CCR4-NOT core complex; • نواة; • خارج خلوي; • سيتوبلازم; • عصارة خلوية;
عمليات حيوية	• nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening; • negative regulation of translation; • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening; • GO:0009373 ضبط نسخ الدنا; • negative regulation of retinoic acid receptor signaling pathway; • regulation of stem cell population maintenance; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of mRNA catabolic process; • نسخ الدنا; • نمو متعدد الخلايا; • positive regulation of cytoplasmic mRNA processing body assembly; • positive regulation of nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay; • gene silencing by miRNA; • إسكات الجين; • negative regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway; • regulation of translation; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic; • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	; ;
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
	A5YKK6; H3BNB1
	Q6ZQ08
	NM_001265612، NM_016284، NM_206999 NR_049763، NM_001265612، NM_016284، NM_206999
	NM_153164، NM_178078، XM_006530870، XM_006530871، XM_006530872، XR_001778431، XR_003947260، NM_001372351، NM_001372353، XM_036153964، XM_036153965 NM_001205226، NM_153164، NM_178078، XM_006530870، XM_006530871، XM_006530872، XR_001778431، XR_003947260، NM_001372351، NM_001372353، XM_036153964، XM_036153965
	NP_057368، NP_996882 NP_001252541، NP_057368، NP_996882
	NP_694804، NP_835179، XP_006530933، XP_006530934، XP_006530935، NP_001359280، NP_001359282، XP_036009857، XP_036009858 NP_001192155، NP_694804، NP_835179، XP_006530933، XP_006530934، XP_006530935، NP_001359280، NP_001359282، XP_036009857، XP_036009858
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

CNOT1‏ (CCR4-NOT transcription complex subunit 1) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين CNOT1 في الإنسان.^[1]^[2]^[3]^[4]^[5]^[6]

الوظيفة

الأهمية السريرية

المراجع

^ "Entrez Gene: CNOT1 CCR4-NOT transcription complex, subunit 1". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.
^ Sandler H، Kreth J، Timmers HT، Stoecklin G (مايو 2011). "Not1 mediates recruitment of the deadenylase Caf1 to mRNAs targeted for degradation by tristetraprolin". Nucleic Acids Res. ج. 39 ع. 10: 4373–86. DOI:10.1093/nar/gkr011. PMC:3105394. PMID:21278420.
^ Garneau NL، Wilusz J، Wilusz CJ (فبراير 2007). "The highways and byways of mRNA decay". Nat. Rev. Mol. Cell Biol. ج. 8 ع. 2: 113–26. DOI:10.1038/nrm2104. PMID:17245413.
^ Petit AP، Wohlbold L، Bawankar P، Huntzinger E، Schmidt S، Izaurralde E، Weichenrieder O (نوفمبر 2012). "The structural basis for the interaction between the CAF1 nuclease and the NOT1 scaffold of the human CCR4-NOT deadenylase complex". Nucleic Acids Res. ج. 40 ع. 21: 11058–72. DOI:10.1093/nar/gks883. PMC:3510486. PMID:22977175.
^ Ota T، Suzuki Y، Nishikawa T، Otsuki T، Sugiyama T، Irie R، وآخرون (يناير 2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nature Genetics. ج. 36 ع. 1: 40–5. DOI:10.1038/ng1285. PMID:14702039.
^ Basquin J، Roudko VV، Rode M، Basquin C، Séraphin B، Conti E (26 أكتوبر 2012). "Architecture of the nuclease module of the yeast Ccr4-not complex: the Not1-Caf1-Ccr4 interaction". Mol. Cell. ج. 48 ع. 2: 207–18. DOI:10.1016/j.molcel.2012.08.014. PMID:22959269.

قراءة متعمقة

Bonaldo MF، Lennon G، Soares MB (1996). "Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery". Genome Res. ج. 6 ع. 9: 791–806. DOI:10.1101/gr.6.9.791. PMID:8889548.
Nagase T، Ishikawa K، Suyama M، Kikuno R، Hirosawa M، Miyajima N، Tanaka A، Kotani H، Nomura N، Ohara O (1999). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro". DNA Res. ج. 6 ع. 1: 63–70. DOI:10.1093/dnares/6.1.63. PMID:10231032.
Chen J، Rappsilber J، Chiang YC، Russell P، Mann M، Denis CL (2001). "Purification and characterization of the 1.0 MDa CCR4-NOT complex identifies two novel components of the complex". J. Mol. Biol. ج. 314 ع. 4: 683–94. DOI:10.1006/jmbi.2001.5162. PMID:11733989.
Laveder P، De Pittà C، Toppo S، Valle G، Lanfranchi G (2002). "A two-step strategy for constructing specifically self-subtracted cDNA libraries". Nucleic Acids Res. ج. 30 ع. 9: e38. DOI:10.1093/nar/30.9.e38. PMC:113861. PMID:11972353.
Winkler GS، Mulder KW، Bardwell VJ، Kalkhoven E، Timmers HT (2006). "Human Ccr4-Not complex is a ligand-dependent repressor of nuclear receptor-mediated transcription". EMBO J. ج. 25 ع. 13: 3089–99. DOI:10.1038/sj.emboj.7601194. PMC:1500986. PMID:16778766.

[entrez-1] "Entrez Gene: CNOT1 CCR4-NOT transcription complex, subunit 1". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.

[2] Sandler H، Kreth J، Timmers HT، Stoecklin G (مايو 2011). "Not1 mediates recruitment of the deadenylase Caf1 to mRNAs targeted for degradation by tristetraprolin". Nucleic Acids Res. ج. 39 ع. 10: 4373–86. DOI:10.1093/nar/gkr011. PMC:3105394. PMID:21278420.

[3] Garneau NL، Wilusz J، Wilusz CJ (فبراير 2007). "The highways and byways of mRNA decay". Nat. Rev. Mol. Cell Biol. ج. 8 ع. 2: 113–26. DOI:10.1038/nrm2104. PMID:17245413.

[4] Petit AP، Wohlbold L، Bawankar P، Huntzinger E، Schmidt S، Izaurralde E، Weichenrieder O (نوفمبر 2012). "The structural basis for the interaction between the CAF1 nuclease and the NOT1 scaffold of the human CCR4-NOT deadenylase complex". Nucleic Acids Res. ج. 40 ع. 21: 11058–72. DOI:10.1093/nar/gks883. PMC:3510486. PMID:22977175.

[pmid14702039-5] Ota T، Suzuki Y، Nishikawa T، Otsuki T، Sugiyama T، Irie R، وآخرون (يناير 2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nature Genetics. ج. 36 ع. 1: 40–5. DOI:10.1038/ng1285. PMID:14702039.

[6] Basquin J، Roudko VV، Rode M، Basquin C، Séraphin B، Conti E (26 أكتوبر 2012). "Architecture of the nuclease module of the yeast Ccr4-not complex: the Not1-Caf1-Ccr4 interaction". Mol. Cell. ج. 48 ع. 2: 207–18. DOI:10.1016/j.molcel.2012.08.014. PMID:22959269.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

التصنيفات الطبية	دليل الوراثة المندلية عند البشر (OMIM): 604917
المعرفات الخارجية	Ensembl Transcript ID: ENST00000570139 نظام اللغة الطبية الموحدة (UMLS CUI): C1417763