B3GAT1

B3GAT1
B3GAT1
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	1V82, 1V83, 1V84
Идентификаторы
Псевдонимы	B3GAT1, CD57, GLCATP, GLCUATP, HNK1, LEU7, NK-1, NK1, beta-1,3-glucuronyltransferase 1
Внешние ID	OMIM: 151290 MGI: 1924148 HomoloGene: 49551 GeneCards: B3GAT1
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	11-я хромосома человека
Конец	134,412,242 bp
Расположение гена (Мышь)
Расположение гена (Мышь)
Хр.	9-я хромосома мыши
Конец	26,674,397 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	C1 segment; ; цитоархитектоническое поле Бродмана 9; ; hippocampus proper; ; Region I of hippocampus proper;
	Наибольшая экспрессия в
	primary visual cortex; ; piriform cortex; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; lateral septal nucleus;
	Дополнительные справочные данные
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	трансферазная активность; связывание с ионом металла; galactosylgalactosylxylosylprotein 3-beta-glucuronosyltransferase activity; UDP-galactose:beta-N-acetylglucosamine beta-1,3-galactosyltransferase activity;
Компонент клетки	часть мембраны; аппарат Гольджи; мембрана; внеклеточная область; эндоплазматический ретикулум; endoplasmic reticulum membrane; внутриклеточная мембранная органелла; Golgi membrane;
Биологический процесс	glycosaminoglycan metabolic process; protein glycosylation; chondroitin sulfate proteoglycan biosynthetic process; chondroitin sulfate metabolic process; Углеводный обмен; cellular response to hypoxia;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	27087
	76898
	ENSG00000109956
	ENSMUSG00000045994
	Q9P2W7
	Q9CW73
	NM_018644; NM_054025; NM_001367973
	NM_029792; NM_001310766
	NP_061114; NP_473366; NP_001354902
	NP_001297695; NP_084068
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)	Смотреть (мышь)

Галактозилгалактозилксилозилпротеин-3-бета-глюкуронозилтрансфераза типа 1 (англ. Galactosylgalactosylxylosylprotein 3-beta-glucuronosyltransferase 1; B3GAT1; CD57) — фермент из семейства глюкуронозилтрансфераз, продукт гена человека B3GAT1. Активность фермента образует эпитопы CD57 на поверхности других клеток^[5]. В иммунологии антиген CD57 (HNK1, LEU7) — эпитоп, содержащий остатки углевода сульфоглюкуронила, связанные с несколькими белками адгезии нервной системы^[6].

Функции

Белок гена B3GAT1 входит в семейство глюкуронозилтрансфераз. Ферменты этого семейства обладают высокой специфичностью по отношению к акцептору, они распознают невосстановляемые конечные группы сахаров и их аномерные связи. Продукт гена B3GAT1 является ключевым ферментом в реакции переноса глюкуронила в ходе биосинтеза углеводного эпитопа HNK-1/CD57^[5].

В иммуногистохимии

В анатомической патологии эпитоп CD57, также как сходный с ним CD56, используется в дифференциальной диагностике нейроэндокринных опухолей от опухолей иного происхождения^[7]. Эпитоп CD57 находится на 10-20% лимфоцитов, а также на некоторых эпителиальных, нейрональных хромаффинных клетках. На лимфоцитах эпитоп преимущественно присутствует на T-лимфоцитах и естественных киллерах и как правило находится на клетках герминальных центров лимфатических узлов, миндалин и селезёнки^[8].

Повышенный уровень CD57+ клеток обнаруживается в крови больных после трансплантации, особенно трансплантации костного мозга, и больных с HIV, а также при ревматоидном артрите и аутоиммунном синдроме Фелти и при некоторых других заболеваниях^[8].

Структура

Продукт гена B3GAT1 состоит из 334 аминокислот, молекулярная масса 38,3 кДа. Активный центр содержит Mn²⁺.

Примечания

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000109956 - Ensembl, May 2017
↑ ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000045994 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ ¹ ² Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=27087 Entrez Gene: B3GAT1 beta-1,3-glucuronyltransferase 1 (glucuronosyltransferase P) . Архивировано 29 октября 2012 года.
↑ Mitsumoto Y., Oka S., Sakuma H., Inazawa J., Kawasaki T. Cloning and chromosomal mapping of human glucuronyltransferase involved in biosynthesis of the HNK-1 carbohydrate epitope (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 2000. — April (vol. 65, no. 2). — P. 166—173. — doi:10.1006/geno.2000.6152. — PMID 10783264.
↑ Wick, Mark R. Chapter 11 – Immunohistology of the Mediastinum // Diagnostic immunohistochemistry: theranostic and genomic applications (англ.) / Dabbs, David J.. — 3rd. — Philadelphia, PA: Saunders/Elsevier, 2010. — P. 345—346. — ISBN 978-1-4160-5766-6. — doi:10.1016/B978-1-4160-5766-6.00015-7.
↑ ¹ ² Leong, Anthony S.-Y.; Cooper, Kumarasen; Leong, F. Joel W.-M. Manual of Diagnostic Antibodies for Immunohistology (англ.). — 2nd. — London: Greenwich Medical Media, 2003. — P. 131—134. — ISBN 978-1-84110-100-2.

Литература

Andersson B., Wentland M. A., Ricafrente J. Y., Liu W., Gibbs R. A. A "double adaptor" method for improved shotgun library construction (англ.) // Analytical Biochemistry : journal. — 1996. — April (vol. 236, no. 1). — P. 107—113. — doi:10.1006/abio.1996.0138. — PMID 8619474.
Yu W., Andersson B., Worley K. C., Muzny D. M., Ding Y., Liu W., Ricafrente J. Y., Wentland M. A., Lennon G., Gibbs R. A. Large-scale concatenation cDNA sequencing (англ.) // Genome Research : journal. — 1997. — April (vol. 7, no. 4). — P. 353—358. — doi:10.1101/gr.7.4.353. — PMID 9110174. — PMC 139146.
Tone Y., Kitagawa H., Imiya K., Oka S., Kawasaki T., Sugahara K. Characterization of recombinant human glucuronyltransferase I involved in the biosynthesis of the glycosaminoglycan-protein linkage region of proteoglycans (англ.) // FEBS Letters : journal. — 1999. — October (vol. 459, no. 3). — P. 415—420. — doi:10.1016/S0014-5793(99)01287-9. — PMID 10526176.
Mitsumoto Y., Oka S., Sakuma H., Inazawa J., Kawasaki T. Cloning and chromosomal mapping of human glucuronyltransferase involved in biosynthesis of the HNK-1 carbohydrate epitope (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 2000. — April (vol. 65, no. 2). — P. 166—173. — doi:10.1006/geno.2000.6152. — PMID 10783264.
Pedersen L. C., Tsuchida K., Kitagawa H., Sugahara K., Darden T. A., Negishi M. Heparan/chondroitin sulfate biosynthesis. Structure and mechanism of human glucuronyltransferase I (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — November (vol. 275, no. 44). — P. 34580—34585. — doi:10.1074/jbc.M007399200. — PMID 10946001.
Cebo C., Durier V., Lagant P., Maes E., Florea D., Lefebvre T., Strecker G., Vergoten G., Zanetta J. P. Function and molecular modeling of the interaction between human interleukin 6 and its HNK-1 oligosaccharide ligands (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — April (vol. 277, no. 14). — P. 12246—12252. — doi:10.1074/jbc.M106816200. — PMID 11788581.
Ouzzine M., Gulberti S., Levoin N., Netter P., Magdalou J., Fournel-Gigleux S. The donor substrate specificity of the human beta 1,3-glucuronosyltransferase I toward UDP-glucuronic acid is determined by two crucial histidine and arginine residues (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — July (vol. 277, no. 28). — P. 25439—25445. — doi:10.1074/jbc.M201912200. — PMID 11986319.
Brenchley J. M., Karandikar N. J., Betts M. R., Ambrozak D. R., Hill B. J., Crotty L. E., Casazza J. P., Kuruppu J., Migueles S. A., Connors M., Roederer M., Douek D. C., Koup R. A. Expression of CD57 defines replicative senescence and antigen-induced apoptotic death of CD8+ T cells (англ.) // Blood : journal. — American Society of Hematology, 2003. — April (vol. 101, no. 7). — P. 2711—2720. — doi:10.1182/blood-2002-07-2103. — PMID 12433688.
Jirásek T., Hozák P., Mandys V. Different patterns of chromogranin A and Leu-7 (CD57) expression in gastrointestinal carcinoids: immunohistochemical and confocal laser scanning microscopy study (англ.) // Neoplasma : journal. — 2003. — Vol. 50, no. 1. — P. 1—7. — PMID 12687271.
Jeffries A. R., Mungall A. J., Dawson E., Halls K., Langford C. F., Murray R. M., Dunham I., Powell J. F. beta-1,3-Glucuronyltransferase-1 gene implicated as a candidate for a schizophrenia-like psychosis through molecular analysis of a balanced translocation (англ.) // Molecular Psychiatry : journal. — 2003. — July (vol. 8, no. 7). — P. 654—663. — doi:10.1038/sj.mp.4001382. — PMID 12874601.
Chochi K., Ichikura T., Majima T., Kawabata T., Matsumoto A., Sugasawa H., Kawarabayashi N., Takayama E., Hiraide H., Seki S., Mochizuki H. The increase of CD57+ T cells in the peripheral blood and their impaired immune functions in patients with advanced gastric cancer (англ.) // Oncology Reports : journal. — 2004. — Vol. 10, no. 5. — P. 1443—1448. — doi:10.3892/or.10.5.1443. — PMID 12883721.
Kakuda S., Shiba T., Ishiguro M., Tagawa H., Oka S., Kajihara Y., Kawasaki T., Wakatsuki S., Kato R. Structural basis for acceptor substrate recognition of a human glucuronyltransferase, GlcAT-P, an enzyme critical in the biosynthesis of the carbohydrate epitope HNK-1 (англ.) // The Journal of Biological Chemistry : journal. — 2004. — May (vol. 279, no. 21). — P. 22693—22703. — doi:10.1074/jbc.M400622200. — PMID 14993226.
Matsubara K., Yura K., Hirata T., Nigami H., Harigaya H., Nozaki H., Fukaya T., Baba K. Acute lymphoblastic leukemia with coexpression of CD56 and CD57: case report (англ.) // Pediatric Hematology and Oncology : journal. — 2005. — Vol. 21, no. 7. — P. 677—682. — doi:10.1080/08880010490501105. — PMID 15626024.
Ibegbu C. C., Xu Y. X., Harris W., Maggio D., Miller J. D., Kourtis A. P. Expression of killer cell lectin-like receptor G1 on antigen-specific human CD8+ T lymphocytes during active, latent, and resolved infection and its relation with CD57 (англ.) // Journal of Immunology : journal. — 2005. — May (vol. 174, no. 10). — P. 6088—6094. — doi:10.4049/jimmunol.174.10.6088. — PMID 15879103.
Assouti M., Vynios D. H., Anagnostides S. T., Papadopoulos G., Georgakopoulos C. D., Gartaganis S. P. Collagen type IX and HNK-1 epitope in tears of patients with pseudoexfoliation syndrome (англ.) // Biochimica et Biophysica Acta : journal. — 2006. — January (vol. 1762, no. 1). — P. 54—8. — doi:10.1016/j.bbadis.2005.09.005. — PMID 16257185.
Barré L., Venkatesan N., Magdalou J., Netter P., Fournel-Gigleux S., Ouzzine M. Evidence of calcium-dependent pathway in the regulation of human beta1,3-glucuronosyltransferase-1 (GlcAT-I) gene expression: a key enzyme in proteoglycan synthesis (англ.) // The FASEB Journal : journal. — Federation of American Societies for Experimental Biology, 2006. — August (vol. 20, no. 10). — P. 1692—1694. — doi:10.1096/fj.05-5073fje. — PMID 16807373.
Sada-Ovalle I., Torre-Bouscoulet L., Valdez-Vázquez R., Martínez-Cairo S., Zenteno E., Lascurain R. Characterization of a cytotoxic CD57+ T cell subset from patients with pulmonary tuberculosis (англ.) // Clinical Immunology : journal. — 2006. — December (vol. 121, no. 3). — P. 314—323. — doi:10.1016/j.clim.2006.08.011. — PMID 17035093.

[refGRCh38EnsemblENSG00000109956-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000109956 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38EnsemblENSMUSG00000045994-2] ¹ ² ³ GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000045994 - Ensembl, May 2017

[3] Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] ¹ ² Db=gene&Cmd=ShowDetailView&TermToSearch=27087 Entrez Gene: B3GAT1 beta-1,3-glucuronyltransferase 1 (glucuronosyltransferase P) . Архивировано 29 октября 2012 года.

[pmid10783264-6] Mitsumoto Y., Oka S., Sakuma H., Inazawa J., Kawasaki T. Cloning and chromosomal mapping of human glucuronyltransferase involved in biosynthesis of the HNK-1 carbohydrate epitope (англ.) // Genomics : journal. — Academic Press, 2000. — April (vol. 65, no. 2). — P. 166—173. — doi:10.1006/geno.2000.6152. — PMID 10783264.

[Wick_2010-7] Wick, Mark R. Chapter 11 – Immunohistology of the Mediastinum // Diagnostic immunohistochemistry: theranostic and genomic applications (англ.) / Dabbs, David J.. — 3rd. — Philadelphia, PA: Saunders/Elsevier, 2010. — P. 345—346. — ISBN 978-1-4160-5766-6. — doi:10.1016/B978-1-4160-5766-6.00015-7.

[Leong-8] ¹ ² Leong, Anthony S.-Y.; Cooper, Kumarasen; Leong, F. Joel W.-M. Manual of Diagnostic Antibodies for Immunohistology (англ.). — 2nd. — London: Greenwich Medical Media, 2003. — P. 131—134. — ISBN 978-1-84110-100-2.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Белки: Кластеры дифференцировки
1-50	CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E) CD2 CD3 (γ, δ, ε) CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 (a) CD9 CD10 CD11 (a, b, c, d) CD13 CD14 CD15 CD16 (A, B) CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 (A, B) CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 (a, b, c, d) CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 (a, b, c, d, e, f) CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 (E, L, P) CD63 CD64 (A, B, C) CD66 (a, b, c, d, e, f) CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 (a, b) CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 (a, d, e, h, j, k) CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 (a, b) CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 (a, b) CD121 (a, b) CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 (a, b, c) CD157 CD158 (a, d, e, i, k) CD159 (a, c) CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 (a, b) CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 (a, b, g) CD174 CD177 CD178 CD179 (a, b) CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 (a, b) CD212 CD213a (1, 2) CD217 CD218 (a, b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 (a, b) CD236] CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD270 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD319 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350
351-400	CD351 CD352 CD353 CD354 CD355 CD357 CD358 CD360 CD361 CD362 CD363 CD364 CD365 CD366 CD367 CD368 CD369 CD370 CD371